用于鉴定北京油鸡品种的SNP标记组合及其应用制造技术

本发明专利技术涉及遗传育种和分子生物学领域，提供一套用于鉴定北京油鸡品种的SNP标记组合及其应用。本发明专利技术利用19个各类型鸡品种/品系全基因重测序数据进行单位点群体分化指数分析，以MEAN_FAST≥0.80为筛选标准，初步筛选得到候选SNP标记，利用连锁不平衡分析确定候选SNP标记集合，然后通过随机森林算法分析确定最终7个SNPs标记作为北京油鸡品种特征性标记集合，其中7个位点优势等位基因频率皆高于82.5％，利用这些位点将北京油鸡与其它代表性品种区分。本发明专利技术提供的SNP标记可作为北京油鸡品种鉴定的标记集合，在品种鉴定、保种和育种技术开发中具有重要的实际应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及遗传育种和分子生物学领域，具体地说，涉及用于鉴定北京油鸡品种的snp标记组合及其应用。

技术介绍

1、北京油鸡是北京市特有的优良地方品种，具有肉质细嫩、味道鲜美和蛋品质优良等特性，其胴体特征鲜明，且外貌具有较强的观赏价值。北京油鸡2000年被列入《国家级畜禽品种资源保护名录》。现处于小规模保种状态，全国群体数量约6000只，但现阶段北京油鸡的精准鉴定和保种方法仍然有较大的提升空间。利用少量特征性分子标记对北京油鸡品种进行精准标识，对推动北京油鸡种质资源保护和商业化利用具有重要应用价值。

2、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp)标记作为第三代遗传标记具有数量多、分布广泛等优点，已有技术可对其进行快速和规模化筛查，进而实现基因分型。随着二代基因组测序成本降低，全基因组重测序成为种质资源研究、群体进化研究等常规的技术方法，可以挖掘到大量目标性状相关的snp标记。然而，针对家禽地方品种和专门化品系众多的特点，需要筛选数量较少的snp标记集合进行品种/品系区分，建立简便快速的鉴定方法，即建立本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.用于鉴定北京油鸡品种的SNP标记组合，其特征在于，所述SNP标记组合包括标记rs733783879、rs14327089、rs739352301、rs738094060、rs13643870、rs3388267196和rs80739085；

2.根据权利要求1所述的SNP标记组合，其特征在于，标记rs733783879所含多态性位点的优势基因型为GG，标记rs14327089所含多态性位点的优势基因型为GG，标记rs739352301所含多态性位点的优势基因型为AA，标记rs738094060所含多态性位点的优势基因型为TT，标记rs13643870所含多态性位点的优势基...

【技术特征摘要】

1.用于鉴定北京油鸡品种的snp标记组合，其特征在于，所述snp标记组合包括标记rs733783879、rs14327089、rs739352301、rs738094060、rs13643870、rs3388267196和rs80739085；

2.根据权利要求1所述的snp标记组合，其特征在于，标记rs733783879所含多态性位点的优势基因型为gg，标记rs14327089所含多态性位点的优势基因型为gg，标记rs739352301所含多态性位点的优势基因型为aa，标记rs738094060所含多态性位点的优势基因型为tt，标记rs13643870所含多态性位点的优势基因型为cc，标记rs3388267196所含多态性位点的优势基因型为aa，且标记rs80739085所含多态性位点的优势基因型为gg，7个位点多态性位点的优势基因型频率皆高于82.5％，表明个体为北京油鸡品种。...

【专利技术属性】
技术研发人员：文杰，刘冉冉，赵桂苹，郑麦青，李庆贺，白露，
申请(专利权)人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：