新型嵌合tRNA-sgRNA得到tgRNA的方法技术

技术编号:43434477 阅读:37 留言:0更新日期:2024-11-27 12:43
本发明专利技术公开一种新型嵌合tRNA‑sgRNA (tgRNA) 的CRISPR/Cas平台构建及应用,属于基因编辑和分子生物学领域,步骤如下:设计并构建针对特定靶基因的sgRNA;合成tRNA框架;将sgRNA序列精确插入tRNA框架的反密码子臂,形成嵌合tgRNA;并构建含有嵌合tgRNA的载体,将其转化到大肠杆菌E. coliK12MG1655菌株中进行表达;通过Northern blot分析检测tgRNA的表达情况;此外,应用CRISPR干扰(CRISPRi)技术,通过dCas蛋白与嵌合tgRNA共表达来抑制目标DNA的转录。验证结果表明,本发明专利技术提出的新型嵌合tgRNA能够显著增强对基因表达的抑制效果,为CRISPR/Cas技术及其领域提供了一种高效的新型tgRNA平台。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因编辑和分子生物学领域,具体涉及一种在crispr/cas中改进的新型嵌合trna-sgrna (tgrna) 平台的建立及应用。


技术介绍

1、crispr/cas是一种利用cas蛋白和sgrna精确识别并切割目标dna的基因编辑技术。sgrna包含一个与目标dna配对的导向序列和一个用于结合cas的骨架结构,是crispr系统中的核心组件。sgrna的稳定性和表达水平直接影响到crispr/cas介导的基因编辑的效率和特异性。研究显示,提高sgrna的稳定性可以显著减少脱靶效应,并提高目标dna的切割效率。因此,增强sgrna的稳定性和表达量是提升crispr/cas9编辑效率的关键。

2、trna由于其紧凑的三维结构具有固有的高稳定性和高表达率,能有效抵抗降解。通过trna-sgrna串联系统在单一转录本中产生多个sgrna,已被证明能够已在多个系统中显示出提升crispr/cas9和cpf1介导的基因编辑效率的潜力,但这些方法尚未充分利用trna在结构上的优势。

3、基于此,我们提出了新型嵌合tgrna平台的本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种新型嵌合tRNA-sgRNA得到tgRNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.如权利要求1所述的新型嵌合tRNA-sgRNA得到tgRNA的方法,其特征在于,步骤(1)中sgRNA的构建包括针对所有真核生物和原核生物的靶基因。

3.如权利要求1所述的新型嵌合tRNA-sgRNA得到tgRNA的方法,其特征在于,步骤(1)中sgRNA插入的载体还可以选择pUC19或pBR322。

4.如权利要求1所述的新型嵌合tRNA-sgRNA得到tgRNA的方法,其特征在于,在步骤(2)中,为了构建tRNA支架,合成的DNA序列为:</p>

5.如权...

【技术特征摘要】

1.一种新型嵌合trna-sgrna得到tgrna的方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.如权利要求1所述的新型嵌合trna-sgrna得到tgrna的方法,其特征在于,步骤(1)中sgrna的构建包括针对所有真核生物和原核生物的靶基因。

3.如权利要求1所述的新型嵌合trna-sgrna得到tgrna的方法,其特征在于,步骤(1)中sgrna插入的载体还可以选择puc19或pbr322。

4.如权利要求1所述的新型嵌合trna-sgrna得到tgrna的方法,其特征在于,在步骤(2)中,为了构建trna支架,合成的dna序列为:

5.如权利要求1所述的新型嵌合trna-sgrna得到tgrna的方法,其特征在于,在步骤(2)中,所述trna支架来源于细菌、真菌、动物、植物中任一物种的trna。

6.如权利要求1所述的新型嵌合trna-sgrna得到tgrna的方法,其特征在于,步骤(3...

【专利技术属性】
技术研发人员:党梅金格琳吴龙江张小莺
申请(专利权)人:陕西理工大学
类型:发明
国别省市:

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