核盘菌群体中抗药性基因频率的高通量实时检测技术制造技术

技术编号:4342140 阅读:248 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术属于核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)群体中抗药性基因频率的实时检测方法,可用于引起油菜等作物菌核病的核盘菌对多菌灵等苯并咪唑类杀菌剂抗药性监测和流行预警。该检测方法共分3个主要步骤,第一步:分别提取已知抗药性菌株、敏感性菌株和待测样品的核基因组DNA;第二步:运用抗药性菌株和核盘菌菌株的特异性检测引物,进行实时定量PCR反应,分别建立抗药性菌株和核盘菌菌株检测的标准曲线;第三步:待测样品分别运用上述两种特异性引物进行实时定量PCR反应,对照已经建立好的两个标准曲线,求出相应的抗药性菌株和敏感性菌株的数量和抗药性菌株在核盘菌总量中的比例。采用实时定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术可以高通量、快速、准确定量测出田间抗药性核盘菌的数量及其在病原群体中的比例,具有高通量的特点。比常规的生物测定和普通的PCR检测抗药性菌株省时、节本、快速。直接从田间采集回来的菌核、病斑和孢子中提取基因组DNA到实时定量-PCR整个检测过程只需6h,检测准确率达96%以上。

【技术实现步骤摘要】
一、
本专利技术属于一种核盘菌群体中抗药性基因频率的实时检测方法,可用于监测苯并咪唑类杀菌剂抗性核盘菌群体发展动态,进行抗药性油菜菌核病的流行预测。二、技术背景油菜菌核病是由核盘菌Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary引起的一种世界性病害,严重影响油菜的产量和品质。长期以来采用苯并咪唑类杀菌剂或以这类药剂为主的复配剂进行化学防治。苯并咪唑类杀菌剂作为一类高效、广谱内吸性杀菌剂在生产上应用,解决了保护性杀菌剂的环境毒性问题,提高了人类控制该病害的能力。苯并咪唑类杀菌剂包括多菌灵、苯菌灵、噻菌灵、硫菌灵等。这些杀菌剂具有相同的抗菌谱和抗菌机制,他们也具有相同的抗药性机制,相互之间存在正交互抗药性。由于这类药剂的高度专化性,作用位点单一,加上施用频率高,使用2~3年后许多植物病原真菌群体中就会出现抗药性优势生理小种,使药剂防治完全失去效果。近年研究证明,核盘菌对多菌灵的抗药性产生是因为细胞中β-微管蛋白基因发生突变,使编码的蛋白质三维构象和电性分布改变,从而失去了与药剂分子的亲和性。β-微管蛋白基因编码198或200位氨基酸的密码子发生点突变是导致大本文档来自技高网...

【技术保护点】
核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)群体中抗药性基因频率的实时检测方法,其特征在于采用实时定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术检测核盘菌群体中存在的对苯并咪唑类杀菌剂的抗药性基因频率。 一种核盘菌抗多菌灵的检测方法,共分三步 第一步:采用常规的苯酚.氯仿.异戊醇法,分别提取已知抗药性菌株、敏感性菌株和待测样品的核基因组DNA。 第二步:运用抗药性菌株和核盘菌菌株的特异性检测引物和SYBR Green I 为发光材料进行实时定量PCR反应,分别建立抗药性菌株和核盘菌菌株检测的标准曲线。 实时定量PCR(Re...

【技术特征摘要】
1、核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)群体中抗药性基因频率的实时检测方法,其特征在于采用实时定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术检测核盘菌群体中存在的对苯并咪唑类杀菌剂的抗药性基因频率。一种核盘菌抗多菌灵的检测方法,共分三步第一步:采用常规的苯酚·氯仿·异戊醇法,分别提取已知抗药性菌株、敏感性菌株和待测样品的核基因组DNA。第二步:运用抗药性菌株和核盘菌菌株的特异性检测引物和SYBR Green I为发光材料进行实时定量PCR反应,分别建立抗药性菌株和核盘菌菌株检测的标准曲线。实时定量PCR(Real-time quantitative PCR)反应体系及其扩增程序:(1)核盘菌总量检测的标准曲线反应体系:dH2O(灭菌蒸馏水)                             9μLPremix Ex TaqTM(2×)                     12.5μLSclSF(10μM)                                  0.25μLSclAF(10μM)                                  0.25μLROX Reference Dye(50×)                      0.5μLDNA模板                                      2.0μI总体积                                       25μL扩增条件:预变性:95℃                         10s             ↓变性:95℃                           5s退火:55.8℃                         31s40个循环             ↓延伸:72℃                           5minDissociation protocol       ...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈长军王建新周明国
申请(专利权)人:南京农业大学
类型:发明
国别省市:84[中国|南京]

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