一种特异性检测间型球孢囊霉的靶标Rpb1基因及其应用制造技术

技术编号:43420056 阅读:25 留言:0更新日期:2024-11-22 17:53
本发明专利技术公开了一种特异性检测间型球孢囊霉的靶标Rpb1基因及其应用,所述靶标Rpb1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明专利技术公开的特异性检测间型球孢囊霉(Globisporangium intermedium)的靶标Rpb1基因,基于该靶标基因设计的LAMP引物组合物可用于快速高效检测间型球孢囊霉(Globisporangium intermedium),检测方法具有特异性强、准确度高、灵敏度好、操作简单、可肉眼观察结果的优点,当DNA达到10pg·μL‑1时即可鉴定出间型球孢囊霉,实用性强。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物技术检测领域,涉及一种特异性检测间型球孢囊霉的靶标rpb1基因及其应用。


技术介绍

1、间型球孢囊霉(globisporangiumintermedium)是一种重要的植物病原菌,属于卵菌门(oomycota),是广义腐霉类群,能侵染多针叶树、花卉和农作物,如绣球、玫瑰、欧芹、欧洲萝卜和大豆等,世界广布,引起植株根腐、猝倒等多种症状,等在受侵染植物生产中造成较重的经济损失。globisporangiumintermedium菌丝无隔,老后有隔,不规则分枝,孢子囊球形或近球形,链生,菌丝生长的最低、最适和最高温度分别为0℃、25-28℃和35℃。globisporangiumintermedium形态上极易与长孢囊霉菌,狭义腐霉菌,疫腐霉菌和密孢囊菌中的种混淆,需要丰富和专业的病原菌鉴定经验区分。并且球孢囊霉菌具有很高的形态多样性,有些物种之间的形态特征又具有交叉性,还有些物种存在较高的种内形态变异,而且有些表型容易受环境条件和营养基质的影响而出现较大的变化,往往难以通过肉眼观察来判断这些复杂多变的形态特征之间的相互联系

2、本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种特异性检测间型球孢囊霉(Globisporangiumintermedium)的靶标Rpb1基因,其特征在于,所述靶标Rpb1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.一种以Rpb1基因为特异性靶标检测间型球孢囊霉(Globisporangiumintermedium)的LAMP引物组合物,其特征在于,所述引物组合物包括:如SEQ ID NO.2所示的正向内引物FIP,如SEQ ID NO.3所示的反向内引物BIP,如SEQ ID NO.4所示的正向外引物F3,如SEQ IDNO.5所示的反向外引物B3,如SEQ ID NO.6所示的反向环引物LB。

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【技术特征摘要】

1.一种特异性检测间型球孢囊霉(globisporangiumintermedium)的靶标rpb1基因,其特征在于,所述靶标rpb1基因的核苷酸序列如seq id no.1所示。

2.一种以rpb1基因为特异性靶标检测间型球孢囊霉(globisporangiumintermedium)的lamp引物组合物,其特征在于,所述引物组合物包括:如seq id no.2所示的正向内引物fip,如seq id no.3所示的反向内引物bip,如seq id no.4所示的正向外引物f3,如seq idno.5所示的反向外引物b3,如seq id no.6所示的反向环引物lb。

3.一种权利要求2所述的以rpb1基因为特异性靶标检测间型球孢囊霉(globisporangiumintermedium)的lamp引物组合物在制备试剂盒中的应用。

4.一种用于检测间型球孢囊霉(globisporangiumintermedium)的lamp试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含权利要求2所述的lamp引物组合物。

5.根据权利要求4所述的用于检测间型球孢囊霉(globisporangiumintermedium)的lamp试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含10×thermopol buffer、mgso4、dntps、甜菜碱、bst dna polymerase、羟基萘酚蓝。

6.一种权利要求2所述的lamp引物组合物、权利要求4~5任一项所述的lamp试剂盒在检测间型球孢囊霉(glo...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈佳佳于健张超凡彭金凤孙亚亚付丹阳黄晓潇李松吴项乾郑香容
申请(专利权)人:江苏农林职业技术学院
类型:发明
国别省市:

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