一种用于空间转录组测序的小鼠骨组织石蜡切片制备方法技术

技术编号:43414909 阅读:22 留言:0更新日期:2024-11-22 17:50
本发明专利技术涉及一种用于空间转录组测序的小鼠骨组织石蜡切片制备方法,属于病理学研究领域。该方法可有效解决骨这一特殊部位因固定、脱钙等处理时间较长而导致的RNA降解率高的问题。本发明专利技术所制备石蜡切片满足空间转录组测序样本要求(DV200>30%),可用于骨病变、肿瘤转移等病灶微环境中细胞组成和基因表达特征的分析。本发明专利技术为采用珍贵骨组织样本进行空间转录组测序分析提供了一种高效且可靠的方法,具有广阔的应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于病理学研究领域,涉及一种用于空间转录组测序的小鼠骨组织石蜡切片制备方法


技术介绍

1、空间转录组技术将高通量数据和探针捕获的空间异质性rna结合,帮助研究者快速挖掘细胞微环境分子特征。样本制备是转录组学实验的起始,dv200(总rna中大于200nt的组分占比)>30%被认为是评估样本可用性的重要指标。然而骨组织中因含有大量的无机钙盐,在切片染色前需进行脱钙处理。若脱钙时间过短,不易得到厚薄均匀切片,若脱钙时间过长,切片质量下降。其中rna大量降解,抗原活性降低,空间组学实验结果重复性差,可信度下降。

2、以往空间组学骨组织样本采用冰冻切片,然而该类切片保存条件高,常出现脱水,氧化等现象使得组织形变,仅可在短期低温保存下使用。传统石蜡切片虽有易于保存等优势,但过往无固定温度、时长、溶液浓度的常规处理导致样本质量不合格,因此,临床迫切需要建立一种骨组织石蜡切片的制备方法用于空间转录组实验,以便研究珍贵骨组织病理标本,对骨病变、肿瘤骨转移等的骨病灶微环境中细胞组成和基因表达特征进行分析。


<p>技术实现思本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于空间转录组测序的小鼠骨组织石蜡切片制备方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)具体为:取小鼠离体骨组织置于95%乙醇溶液或无水乙醇中浸泡,清除附着软组织后用0.9%的氯化钠水溶液冲洗去除残余乙醇。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中在对骨组织进行固定后,取出骨组织,用0.9%氯化钠水溶液冲洗去除残余多聚甲醛。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中对骨组织脱钙液处理后流水轻柔冲洗骨组织去除残余脱钙液。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)具...

【技术特征摘要】

1.一种用于空间转录组测序的小鼠骨组织石蜡切片制备方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)具体为:取小鼠离体骨组织置于95%乙醇溶液或无水乙醇中浸泡,清除附着软组织后用0.9%的氯化钠水溶液冲洗去除残余乙醇。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中在对骨组织进行固定后,取出骨组织,用0.9%氯化钠水溶液冲洗去除残余多聚甲醛。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中对骨组织脱钙液处理后流水轻柔冲洗骨组织去除残余脱钙液。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)具体为:将骨组织依次放入体积分数为75%~85%乙醇溶液、95%~100%乙醇溶液中直至...

【专利技术属性】
技术研发人员:吴瑾任民石晶唐鹏
申请(专利权)人:中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院
类型:发明
国别省市:

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