对蛋白质或核酸序列进行编程处理以识别以编程方式确定的子序列处的突变制造技术

技术编号:43359666 阅读:25 留言:0更新日期:2024-11-19 17:44
示例性实施方案可从数据源获得蛋白质、基因序列或核酸序列,利用执行计算机编程指令的处理器处理序列以识别突变,并在显示设备上向用户显示关于这些突变的信息。对于蛋白质序列,这些示例性实施方案可识别这些序列中的哪些子序列非常适合用于作为这些序列中可能出现潜在突变的位置进行观察。统计技术可应用于这些子序列的差异,以确定这些差异是否是突变。关于每个突变的所显示的信息可包括该突变的性质、该突变的频率、具有该突变的该用户的位置、获得样本的日期和其他感兴趣的信息。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、蛋白质含有氨基酸序列,并且核酸含有核苷酸序列。突变可能存在于核酸和蛋白质中。这些突变可能会对依赖于检测蛋白质或核酸的部分的诊断工作构成挑战。例如,由于氨基酸序列可能已经由于突变而发生变化,如果一个或多个肽已经发生突变,则在肽中寻找某些氨基酸序列的测定可能无法正常工作。突变也可能对疫苗等治疗措施构成挑战。针对病毒的疫苗可被配制为以具有特定基因指纹的病毒为目标。当基因指纹发生变化时,则疫苗可能不那么有效。


技术实现思路

1、根据第一个专利技术方面,一种方法由电子设备的处理器执行。该方法包括利用该处理器以编程方式确定蛋白质、基因序列或核酸的所选子序列相对于参考序列非常适合用于识别该蛋白质、该基因序列或该核酸的收集的序列中的突变。该方法还包括利用该处理器分析该收集的序列来识别该所选子序列中的任何差异,其中该收集的序列中的该所选子序列与该参考序列中的该所选子序列不同。对于已识别到该所选子序列中的一个或多个差异的该收集的序列中的序列,该处理器通过基于该收集的序列间的该差异的该频率应用统计检验,确定该差异是本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种由电子设备的处理器执行的方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中利用所述处理器以编程方式确定蛋白质、基因序列或核酸的所选子序列相对于参考序列非常适合用于识别所述蛋白质、所述基因序列或所述核酸的收集的序列中的突变,所述方法包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其中利用所述处理器以编程方式确定蛋白质、基因序列或核酸的所选子序列相对于参考序列非常适合用于识别所述蛋白质、所述基因序列或所述核酸的收集的序列中的突变,确定了多个子序列相对于所述参考序列非常适合用于识别所述收集的序列中的突变。

4.根据权利要求1所述的方法,所述方法还包括利用...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种由电子设备的处理器执行的方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中利用所述处理器以编程方式确定蛋白质、基因序列或核酸的所选子序列相对于参考序列非常适合用于识别所述蛋白质、所述基因序列或所述核酸的收集的序列中的突变,所述方法包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其中利用所述处理器以编程方式确定蛋白质、基因序列或核酸的所选子序列相对于参考序列非常适合用于识别所述蛋白质、所述基因序列或所述核酸的收集的序列中的突变,确定了多个子序列相对于所述参考序列非常适合用于识别所述收集的序列中的突变。

4.根据权利要求1所述的方法,所述方法还包括利用所述处理器以编程方式从数据库中检索所述收集的序列。

5.根据权利要求1所述的方法,所述方法还包括将所述收集的序列与所述处理器进行序列比对。

6.根据权利要求1所述的方法,其中所述统计检验确定每个差异的可能性,并且基于所述可能性确定所述差异是否是突变。

7.根据权利要求1所述的方法,其中输出关于所述收集的序列中所述突变的所述频率的信息包括:生成网页、文件或用户界面元素以供显示,所述网页、所述文件或所述用户界面元素包含关于所述收集的序列中所述突变的所述频率的所述信息。

8.根据权利要求1所述的方法,其中输出关于所述收集的序列中所述突变的所述频率的信息包括:输出描绘所述收集的序列中所述突变的所述频率的图形。

9.根据权利要求8所述的方法,其中输出关于所述收集的序列中所述突变的所述频率的信息输出按收集所述收集的序列的位置和/或收集所述收集的序列的日期排序的频率。

10.根据权利要求1所述的方法,其中输出关于所述收集的序列中所述突变的所述频率的信息包括:输出所述突变中的每个突变的内容以及所述突变中的每个突变的频率。

11.根据权利要求1所述的方法,其中所述蛋白质是病毒、疾病或病症中发现的蛋白质中的一...

【专利技术属性】
技术研发人员:S·J·杰罗马诺斯E·M·霍伊斯F·特雷西A·卡斯维尔M·高
申请(专利权)人:沃特世科技爱尔兰有限公司
类型:发明
国别省市:

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