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共价性抑制剂设计中的EWF片段库构建方法及其应用技术

技术编号:43337863 阅读:18 留言:0更新日期:2024-11-15 20:33
本发明专利技术提供共价性抑制剂设计中的EWF片段库构建方法及其应用,涉及生物医药技术领域。该共价性抑制剂设计中的EWF片段库构建方法,包括收集已知共价性激酶抑制剂的结构信息:通过对已知共价性激酶抑制剂CKIs的全面收集,这些数据主要来源于科学文献、专利以及公共数据库;收集的CKI结构将根据其与蛋白质靶标结合的特定区域进行详尽的注释;通过对这些结构的细致分析,我们能够识别出用于形成共价键的关键Electrophilic Warhead Fragment。支持对特定疾病靶标进行个性化药物设计,有助于推动个性化医疗的发展,为患者提供更为精准和个性化的治疗方案,通过深度学习生成的EWF片段,本发明专利技术增强了药物分子的多样性,有助于避免药物抗性和提高治疗效果。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医药,具体为共价性抑制剂设计中的ewf片段库构建方法及其应用。


技术介绍

1、在现代医药研究中,药物分子与靶标蛋白质的相互作用是治疗干预的核心。传统的药物设计方法主要依赖于非共价结合机制,这涉及氢键、疏水作用、范德华力等非共价相互作用。这些非共价性药物分子在药物发现中占据主导地位,因为它们通常具有较好的生物利用度和较低的毒性。然而,非共价性结合可能在某些情况下无法提供足够的稳定性和选择性,特别是在针对某些难以药物化的靶标时。

2、共价性抑制剂通过形成稳定的共价键与靶标蛋白质相互作用,提供了一种替代策略。这种共价结合可以显著提高药物分子的亲和力和选择性,尤其适用于那些传统非共价药物难以结合的靶标。共价性抑制剂的设计关键在于electrophilic warhead fragment(ewf),这些片段是能够与靶标蛋白质中的特定氨基酸残基(如半胱氨酸)形成共价键的化学基团。然而,尽管共价性抑制剂具有潜在的优势,但它们在药物设计中的应用仍然受到限制,主要因为缺乏系统化的ewf库来支持设计过程。

3、现有技术在共价性抑制剂本文档来自技高网...

【技术保护点】

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2.根据权利要求1所述的共价性抑制剂设计中的EWF片段库构建方法,其特征在于:所述扩展Electrophi l ic Warhead Fragment库的类型的包括以下步骤:

3.根据权利要求1所述的共价性抑制剂设计中的EWF片段库构建方法,其特征在于:所述构建Electrophi l ic Warhead Fragment库包括以下步骤:

4.根据权利要求1所述的共价性抑制剂设计中的EWF片段库构建方法,其特征在于:所述SyntaLinker模型包括以下步骤:>

5.根据权利...

【技术特征摘要】

1.共价性抑制剂设计中的ewf片段库构建方法,其特征在于:包括:

2.根据权利要求1所述的共价性抑制剂设计中的ewf片段库构建方法,其特征在于:所述扩展electrophi l ic warhead fragment库的类型的包括以下步骤:

3.根据权利要求1所述的共价性抑制剂设计中的ewf片段库构建方法,其特征在于:所述构建electrophi...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨凌智王腾杨刘天悦江民川邝泰维黄圣杰李梓昕袁茗
申请(专利权)人:暨南大学
类型:发明
国别省市:

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