【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因工程，具体涉及基于免疫相关基因构建预测精原细胞瘤预后模型的方法。
技术介绍
1、睾丸生殖细胞肿瘤(tgct)被认为最常见的泌尿系统恶性肿瘤之一，尽管其发病率相对较低，但仍呈现出发病率逐年上升的趋势。此外，在15-34岁的年轻男性中，它们是主要的实体瘤类型，约50％的病例以精原细胞瘤组织学为特征。仅在美国，2023年就预计将有9190例新诊断和470例死亡，死亡主要归因于肿瘤转移、复发或化疗耐药性。值得注意的是，在tgct诊断时，有32.2％的患者已经转移，这其中25％的患者可能会复发。一项针对i期睾丸肿瘤的调查结果表明，18.9％的患者经历了肿瘤复发，其中近一半的复发病例由于转移扩散或复发而需要额外的化疗或放疗，因此寻求既定治疗模式益处的化疗耐药患者提出了巨大挑战。此外，睾丸肿瘤细胞的侵袭性增强是肿瘤复发和不良临床结果的重要预后指标。在丹麦进行的一项全国性、基于人群的队列研究涉及924名患者，结果显示148名(16％)患者在6.3年的中位随访期内复发。包括睾丸门(包括睾丸网和肝门软组织)侵犯、淋巴血管侵犯以及睾丸切除前...
【技术保护点】
1.CTLA4、SNX17和/或TMX1基因在构建预测精原细胞瘤预后模型中的应用。
2.基于免疫相关基因构建预测精原细胞瘤预后模型的方法，其特征在于，包括以下步骤：
3.根据权利要求2所述的基于免疫相关基因构建预测精原细胞瘤预后模型的方法，其特征在于，步骤1)中所述WGCNA分析包括确定每个基因的平均表达，并去除meanFPKM＜0.5的基因，通过“goodSamplesGenes”函数对基因表达矩阵进行过滤，以检查缺失值，使用“软”阈值功率来计算相邻度，然后将邻接转换为拓扑重叠矩阵，随后测定基因比例和相异性，使用层次聚类和动态树切割函数对模块...
【技术特征摘要】
1.ctla4、snx17和/或tmx1基因在构建预测精原细胞瘤预后模型中的应用。
2.基于免疫相关基因构建预测精原细胞瘤预后模型的方法，其特征在于，包括以下步骤：
3.根据权利要求2所述的基于免疫相关基因构建预测精原细胞瘤预后模型的方法，其特征在于，步骤1)中所述wgcna分析包括确定每个基因的平均表达，并去除meanfpkm＜0.5的基因，通过“goodsamplesgenes”函数对基因表达矩阵进行过滤，以检查缺失值，使用“软”阈值功率来计算相邻度，然后将邻接转换为拓扑重叠矩阵，随后测定基因比例和相异性，使用层次聚类和动态树切割函数对模块进行检测，在最小基因组大小和基于tom的相异性度量的情况下，使用平均连锁层次聚类将具有相同表达谱的基因分类到基因模块中，最后，计算模块特征基因的相异性，选择模块树状图的切割线，并将几个模块基因组合起来进行进一步研究，将模块基因输入string数据库，构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，使用cytoscape中的mcode插件对网络进行可视化和分析，获得hub基因重要集群。
4.根据权利要求3所述的基于免疫相关基因构建预测精原细胞瘤预后模型的方法，其特征在于，步骤1)中还包括通过平均连锁层次聚类和最优软阈值功率确定获得绿松石模块，所述绿松石模块内集群基因mm值>0.5或<-0.5进一步分析获得与精原细胞瘤高度相关模块基因，通过将模块基因输入string数据库，构建蛋白质-蛋白质相互...
【专利技术属性】
技术研发人员：崔岩康，房波，张静，商学军，
申请(专利权)人：中国人民解放军东部战区总医院，
类型：发明
国别省市：
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