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一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法技术

技术编号:43291454 阅读:29 留言:0更新日期:2024-11-12 16:11
本发明专利技术公开了一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其中方法包括:从公开数据库中,收集噬菌体多肽数据、收集抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;对抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据进行冗余序列去除后,分别与噬菌体多肽数据进行同源性分析,并进行预处理后,获取噬菌体特异性的抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;构建正样本数据集和负样本数据集;数据应用包括:训练神经网络,进行神经网络应用,获取噬菌体特异性抗细菌肽或非抗细菌肽数据正负样本分类预测。本发明专利技术方法有效的对噬菌体和抗细菌肽之间的协同作用进行探索,实现噬菌体特异性抗细菌肽/非噬菌体特异性抗细菌肽准确的目标分类,为后续噬菌体的工程改良及潜在高效抗细菌肽的发掘做出贡献。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及噬菌体数据与抗细菌肽数据协同处理,尤其涉及一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法


技术介绍

1、抗生素的滥用,不仅会导致细菌产生耐药性,还会造成人体内正常菌群的紊乱,对人体生命产生极大地威胁。噬菌体在宿主细胞中生长繁殖,能够引起致病菌的裂解,降低致病菌的密度,减少或避免致病菌感染或发病的机会。抗细菌肽(abp)是构成生物体先天免疫的一个要素,其具有广谱细菌活性。噬菌体和抗细菌肽以完全不同于抗生素的杀菌机制和极少的副作用反应成为抗生素的有效替代品。

2、虽然已有部分研究提出可以使用抗细菌肽增强噬菌体,并且基于实验验证了噬菌体驱动的抗细菌肽表达系统,但极少有研究对两者的协同作用进行探索,也缺乏对噬菌体基因组中编码抗细菌肽的基因片段探究,使实验室方法耗时耗力。

3、为了解决上述问题,现实中需要提出一种便捷而又高效的数据发掘方法,对噬菌体和抗细菌肽两者的协同作用进行深入探索,提高噬菌体和抗细菌肽两者的联合应用。


技术实现思路

1、针对上述问题,本专利技术的目的在于提供一种噬本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述S1中收集噬菌体多肽数据的过程包括:

3.根据权利要求2所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述S13中:

4.根据权利要求1所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述S2中:

5.根据权利要求4所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述S3中获取噬菌体特异性的抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据,过程包括

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【技术特征摘要】

1.一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述s1中收集噬菌体多肽数据的过程包括:

3.根据权利要求2所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述s13中:

4.根据权利要求1所述的一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,所述s2中:

5.根据权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:宾艳南何亚蕊
申请(专利权)人:安徽大学
类型:发明
国别省市:

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