用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合及其应用。用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合，由36对KASP引物组成。KASP标记引物组合可用于构建羊草种质资源指纹图谱。本发明专利技术对99份羊草的dd‑RAD简化基因组测序数据开发36对核心SNP标记，并基于该36对核心引物KASP标记构建了99份羊草的指纹图谱，发现该36个KASP标记可清晰区分所有参试99份的羊草种质资源。通过指纹图谱构建为种质资源构建了分子身份证，使得分子鉴定步骤更简单、更省时、成本更低，并可提高品种选育的准确度，也可用于品种真伪鉴别及种质资源亲缘关系鉴定。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于植物种质资源鉴定，具体涉及一种用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合及其应用。

技术介绍

1、羊草（ leymus chinensis），又名碱草，为小麦族赖草属多年生草本植物，是一种重要的乡土草种，具有抗旱、耐盐碱、营养价值高的特点，被称为禾本科“牧草之王”，在我国北方草地生态修复及草食畜牧业高质量发展中扮演着重要角色。

2、羊草为四倍体异花授粉植物，具有基因组大、杂合度高的特点，在国内其分子生物研究远落后于水稻及玉米。近些年，对羊草种子的需求量越来越大，如何更有效的保存和开发利用现有羊草种质资源，准确高效鉴定种质材料，是目前亟需解决的技术问题，以确保品种的真实性和品种选育的时效性。

3、近年来，羊草aflp、rapd、ssr这一系列分子标记被广泛应用于羊草的遗传多样性和指纹图谱构建中。而以上这些传统的分子标记，一般都基于凝胶电泳，不仅费时，且步骤繁琐。随着高通量技术的发展，因单核苷酸多态性（snp）分子标记具有突变率低、遗传稳定、位点丰富、特异性高、易于自动化的特点本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合，其特征在于：所述KASP标记引物组合由36对KASP引物组成，KASP引物的核苷酸序列如下表所示：

2.根据权利要求1所述的用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合，其特征在于：所述KASP标记引物的5’端添加通用荧光标签：正向引物序列-1的5 '端添加：GAAGGTGACCAAGTTCATGCT，正向引物序列- 2 的5 '端添加：GAAGGTCGGAGTCAACGGATT。

3.根据权利要求2所述的用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合在构建羊草种质资源指纹图谱中的应用。

【技术特征摘要】

1.一种用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合，其特征在于：所述kasp标记引物组合由36对kasp引物组成，kasp引物的核苷酸序列如下表所示：

2.根据权利要求1所述的用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合，其特征在于：所述kasp标记引物的5’端添加通用荧光...

【专利技术属性】
技术研发人员：武自念，牛天秀，田春育，杨艳婷，李志勇，宫文龙，刘乐萌，冯玉梅，
申请(专利权)人：中国农业科学院草原研究所，
类型：发明
国别省市：