【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于植物种质资源鉴定，具体涉及一种用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合及其应用。
技术介绍
1、羊草（ leymus chinensis），又名碱草，为小麦族赖草属多年生草本植物，是一种重要的乡土草种，具有抗旱、耐盐碱、营养价值高的特点，被称为禾本科“牧草之王”，在我国北方草地生态修复及草食畜牧业高质量发展中扮演着重要角色。
2、羊草为四倍体异花授粉植物，具有基因组大、杂合度高的特点，在国内其分子生物研究远落后于水稻及玉米。近些年，对羊草种子的需求量越来越大，如何更有效的保存和开发利用现有羊草种质资源，准确高效鉴定种质材料，是目前亟需解决的技术问题，以确保品种的真实性和品种选育的时效性。
3、近年来，羊草aflp、rapd、ssr这一系列分子标记被广泛应用于羊草的遗传多样性和指纹图谱构建中。而以上这些传统的分子标记，一般都基于凝胶电泳，不仅费时，且步骤繁琐。随着高通量技术的发展，因单核苷酸多态性（snp）分子标记具有突变率低、遗传稳定、位点丰富、特异性高、易于自动化的特点，它可有效克服传统分子标记的瓶颈，逐渐成为种质资源研究的主流分子标记。常见的snp检测技术有基因组重测序、简化基因组测序及基因芯片，具有简单便捷、高通量、自动化、高灵敏度、高准确度的特点。
4、kasp即竞争性等位基因特异性pcr，是一种基于荧光的同源基因分型技术，其基本原理是对目标位点的snp进行特异性引物设计，通过引物末端snp的特异性配对来进行标记分型和检测，
5、dna指纹是指个体dna序列中特定的特异性片段或snp位点，dna指纹图谱是鉴定品种的一种有效方法，具有快速、高效、准确性高的优点，在种质资源鉴定、植物分子身份证构建、分子标记辅助育种和种质资源遗传多样性研究中应用广泛，更对植物新品种权的保护和利用提供更为科学的依据和技术支持。
6、在现有技术中，水稻、玉米、小麦这些作物有kasp标记的相关报道，但还没有羊草种质资源与育种研究的可用分子标记相关研究报道，并且已报道的kasp标记无法应用于羊草种质资源鉴定及指纹图谱构建。目前羊草分子鉴定的技术步骤繁琐、费时、成本较高。因此，亟需基于羊草全基因组的用于羊草种质资源鉴定的kasp标记引物组合，并以此构建羊草种质资源指纹图谱。
技术实现思路
1、本专利技术的第一目的是为了克服现有技术存在的不足，提供一种用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合。
2、本专利技术的第一目的是通过以下技术方案实现的：一种用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合，所述kasp标记引物组合由36对kasp引物组成，kasp引物的核苷酸序列如下表所示：
3、 引物名称 正向引物-1 正向引物-2 通用引物 marker1 gaaggtgaccaagttcatgctgtacctagtattgatgactacgtcgccseq id no :1 gaaggtcggagtcaacggattgtacctagtattgatgactacgtcgctseq id no :2 cttactgctatatctccatgccctttgseq id no :3 marker2 gaaggtgaccaagttcatgcttgattcgttttcagttccccatcagtseq id no :4 gaaggtcggagtcaacggatttgattcgttttcagttccccatcagaseq id no :5 catatcagccacattcaacaagtcttseq id no :6 marker3 gaaggtgaccaagttcatgctcttcttctctttcttgctctgctttccseq id no :7 gaaggtcggagtcaacggattcttcttctctttcttgctctgctttctseq id no :8 cattttcacacttggagaacaattgtcseq id no :9 marker4 gaaggtgaccaagttcatgctgctgcgtgtgtgattagtgcacseq id no :10 gaaggtcggagtcaacggattgctgcgtgtgtgattagtgcatseq id no :11 taaaagtggaagccgctggtatseq idno :12 marker5 gaaggtgaccaagttcatgctggctgtactatgatacaataatcacaacgcseq id no :13 gaaggtcggagtcaacggattggctgtactatgatacaataatcacaacgtseq id no :14 cgacaactagctatcatatcaaagagtatgseq id no :15 marker6 gaaggtgaccaagttcatgctcatagggagtatgtccttctgataccseq id no :16 gaaggtcggagtcaacggattcatagggagtatgtccttctgatacaseq id no :17 acggaaatggatactatcagaaacgaseq id no :18 marker7 gaaggtgaccaagttcatgcttttcccacgtaatccagctccattseq i本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合，其特征在于：所述KASP标记引物组合由36对KASP引物组成，KASP引物的核苷酸序列如下表所示：
2.根据权利要求1所述的用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合，其特征在于：所述KASP标记引物的5’端添加通用荧光标签：正向引物序列-1的5 '端添加：GAAGGTGACCAAGTTCATGCT，正向引物序列- 2 的5 '端添加：GAAGGTCGGAGTCAACGGATT。
3.根据权利要求2所述的用于羊草种质鉴定的KASP标记引物组合在构建羊草种质资源指纹图谱中的应用。
【技术特征摘要】
1.一种用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合，其特征在于：所述kasp标记引物组合由36对kasp引物组成，kasp引物的核苷酸序列如下表所示：
2.根据权利要求1所述的用于羊草种质鉴定的kasp标记引物组合，其特征在于：所述kasp标记引物的5’端添加通用荧光...
【专利技术属性】
技术研发人员：武自念，牛天秀，田春育，杨艳婷，李志勇，宫文龙，刘乐萌，冯玉梅，
申请(专利权)人：中国农业科学院草原研究所，
类型：发明
国别省市：
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