一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具制造技术

本发明专利技术涉及多片段同源重组设计技术领域，具体地说，涉及一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具。其包括，用户输入单元接收引物设计参数和设计文件；数据处理单元读取并解析这些文件，提取样本信息和基因序列，检查错误和遗漏；引物设计单元使用Pr imer3和多目标非线性优化算法优化生成引物；重组质粒图谱单元将骨架和外源片段序列拼接成质粒序列，并标记引物；引物订购服务单元整理引物数据，生成合成订购表；发送邮件单元将设计结果和订购信息发送给用户；检查异常信息单元检查系统各阶段的数据，收集并记录异常信息。有益效果：利用多目标非线性优化算法优化引物设计，生成引物序列，提高设计效率和准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及多片段同源重组设计，具体地说，涉及一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具。

技术介绍

1、一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具是利用多目标非线性优化算法来实现高效精准的引物设计，结合多种数据输入和自动化数据处理，实现快速高效的多片段同源重组组装设计。

2、现有的引物设计工具只提供基本的pcr引物设计功能，且由于需要用户手动添加同源序列并不能自定义片段数量，会导致设计过程冗长复杂且易于出现人为错误的问题，因此，设计一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具。

技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，以解决上述
技术介绍
中提出的由于需要用户手动添加同源序列并不能自定义片段数量，会导致设计过程冗长复杂且易于出现人为错误的问题。

2、为实现上述目的，本专利技术目的在于提供了一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，包括：

3、用户输入单元，所述用户输入单元用于接收用户手动填写的引物设计参数以及本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：包括：

2.根据权利要求1所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述用户输入单元(1)包括样本信息填写模块、批量设计样本表模块和引物设计参数填写模块；

3.根据权利要求1所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述数据处理单元(2)包括数据读取与解析模块和数据校验与反馈模块；

4.根据权利要求1所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述引物设计单元(3)包括引物设计参数接收模块、引物设计规则模块、多目标非线性优化模块、P...

【技术特征摘要】

1.一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：包括：

2.根据权利要求1所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述用户输入单元(1)包括样本信息填写模块、批量设计样本表模块和引物设计参数填写模块；

3.根据权利要求1所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述数据处理单元(2)包括数据读取与解析模块和数据校验与反馈模块；

4.根据权利要求1所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述引物设计单元(3)包括引物设计参数接收模块、引物设计规则模块、多目标非线性优化模块、pcr引物设计模块和引物序列验证模块；

5.根据权利要求4所述的面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具，其特征在于：所述多目标非线性优化模块利用多目标非线性优化算法进行引物设计的优化所涉及的具体步骤如下：

6.根据权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：王猛，张悦，郭艳梅，毛雨丰，程海娇，张越，王申晖，廖小平，马红武，
申请(专利权)人：中国科学院天津工业生物技术研究所，
类型：发明
国别省市：