一种分子标签组合及其在单细胞ATAC-seq中的应用制造技术

技术编号:43098501 阅读:17 留言:0更新日期:2024-10-26 09:43
本发明专利技术提出了一种分子标签组合及其在单细胞ATAC‑seq中的应用,所述分子标签组合包括第一分子标签集,所述第一分子标签集包括第一分子标签1和第一分子标签2,其中,所述第一分子标签1包括随机序列1和Barcode1‑1,所述第一分子标签2包括随机序列2和Barcode1‑2,其中,所述随机序列1的3’端与所述Barcode1‑1的5’端相连,所述随机序列2的3’端与所述Barcode1‑2的5’端相连,所述随机序列1和2均具有5’端磷酸化修饰。根据本发明专利技术实施方案的分子标签组合构建的单细胞测序文库能够进行染色质可及性分析,不仅成本非常低,且通量明显高于现有技术,测序通量超过100万个细胞。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及单细胞测序,具体地,涉及一种分子标签组合及其在单细胞atac-seq中的应用。


技术介绍

1、染色质dna在行使转录等功能的生命活动中,需要将蛋白质剥离,使其处于相对裸露的状态,此时裸露的dna便于启动转录以调控基因的表达。这种允许启动子、增强子、绝缘子、沉默子等顺式调控元件和反式作用因子能够与染色质dna物理接触的程度就称为染色质可及性。

2、在全基因组层面对染色质可及性进行系统性的分析,可以破译基因转录调控中的功能性调控元件,为深入探究胚胎发育和肿瘤发生发展等生物学过程中的调控机制提供新的。atac-seq是一种目前应用最为广泛的在全基因组水平检测染色质可及性的测序技术。近几年来,随着微孔板、微流控和组合索引等单细胞标记技术的进步,各种scatac-seq技术如雨后春笋般涌现出来。虽然atac-seq等检测染色质开放性的技术已经被广泛地用于研究基因表达调控以及疾病的致病因素等中,但是在bulk水平的研究掩盖了细胞与细胞之间的异质性,极大地限制了其在研究复杂生物问题中的运用,如研究肿瘤微环境中各种免疫细胞的染色质可及性等。在20本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种分子标签组合,其特征在于,包括第一分子标签集,

2.根据权利要求1所述的分子标签组合,其特征在于,所述第一分子标签集进一步包括序列1,所述序列1包括ME1序列;

3.根据权利要求2所述的分子标签组合,其特征在于,所述第一分子标签集进一步包括序列3,所述序列3包括ME3序列;

4.根据权利要求1所述的分子标签组合,其特征在于,进一步包括第二分子标签,

5.根据权利要求4所述的分子标签组合,其特征在于,还包括第三分子标签,所述第三分子标签包括i7接头序列和Barcode3;

6.根据权利要求5所述的分子标签组合,其特征在于,...

【技术特征摘要】

1.一种分子标签组合,其特征在于,包括第一分子标签集,

2.根据权利要求1所述的分子标签组合,其特征在于,所述第一分子标签集进一步包括序列1,所述序列1包括me1序列;

3.根据权利要求2所述的分子标签组合,其特征在于,所述第一分子标签集进一步包括序列3,所述序列3包括me3序列;

4.根据权利要求1所述的分子标签组合,其特征在于,进一步包括第二分子标签,

5.根据权利要求4所述的分子标签组合,其特征在于,还包括第三分子标签,所述第三分子标签包括i7接头序列和barcode3;

6.根据权利要求5所述的分子标签组合,其特征在于,包括第四分子标签集,所述第四分子标签集包括第四分子标签1和第四分子标签2,所述第四分子标签1包括p5序列和barcode4-1,所述第四分子标签2包括p7序列和barcode4-2;

7.一种试剂盒,其特征在于,包括权利要求1~6任一项所述的分子标签组合,所述分子标签组合不包括所述插入dna片段。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括细胞核提取试剂、细胞核固定试剂、转座反应试剂、核酸连接试剂、pcr反应试剂和核酸纯化试剂中的至少之一;

9.一种高通量单细胞测序文库的构建方法,其特征在于,包括:

10.根据权利要求9所...

【专利技术属性】
技术研发人员:蓝勋孙克用
申请(专利权)人:人科北京生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:

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