一种有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法技术

本发明专利技术涉及农药污染土壤生态环境评估技术领域，具体涉及一种有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法；对有机氯农药污染场地土壤DNA中的所有基因进行注释，得到所有基因种类和相对丰度；对基因的共存和排斥作用进行构建，构建土壤中基因相互作用矩阵；计算基因网络的平均连接度、中介性核心性、紧密中心性三类指标，对所有的基因进行聚类分析；对聚类得到的基因进行分类，统计各个类别下基因的数目和占比；判定不同网络中关键降解基因的数目及占比变化；通过上述方式，能够利用生态网络筛选有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因，并探究在该方法下关键降解基因构成的生态网络的复杂性和稳定性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及农药污染土壤生态环境评估，尤其涉及一种有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法。

技术介绍

1、目前农药污染土壤中，有机氯农药污染场地土壤污染水平高、污染成分复杂，严重影响土壤中的物质循环过程，微生物的群落结构及基因的多样性也发生了明显的改变。土壤中的微生物群落和基因结构会向适应环境改变方向演化，其中，微生物群落中涉及有机氯农药降解的微生物群落生长得到促进，这些微生物群落的降解有机氯农药的能力也与农药降解基因息息相关。因而，筛选及鉴定与农药降解相关的功能基因是评估这些污染场地土壤生态群落功能的关键。传统的评估污染生态群落功能的方法和指标侧重于简单的属性，比如分类学丰富度、生态系统单一功能(碳积累)等，但是，在利用这些简单的指标评估生态系统的功能时发现：这些指标只能简单定量生态系统的生物组成多样性及单一功能，而人为扰动生态系统中，需要同时评估生态系统的复杂性及潜在的功能变化趋势，这表明传统方法过于简化了评估指标，也不能对污染后的生态系统功能变化进行预估。生态网络是一种更全面、复杂的评估方法，综合考虑了物种丰富度、组成、功能多样性、遗传多样本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.如权利要求1所述的有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，在利用宏基因组测序的方法，对有机氯农药污染场地土壤DNA中的所有基因进行注释，得到所有基因种类和相对丰度的步骤中：

3.如权利要求1所述的有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，在对有机氯农药污染场地土壤DNA中的所有基因进行注释的过程中，需要收集有机氯农药污染土壤，收集的具体步骤为：

4.如权利要求3所述的有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，在...

【技术特征摘要】

1.一种有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.如权利要求1所述的有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，在利用宏基因组测序的方法，对有机氯农药污染场地土壤dna中的所有基因进行注释，得到所有基因种类和相对丰度的步骤中：

3.如权利要求1所述的有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，在对有机氯农药污染场地土壤dna中的所有基因进行注释的过程中，需要收集有机氯农药污染土壤，收集的具体步骤为：

4.如权利要求3所述的有机氯农药污染场地土壤中关键降解基因的鉴定方法，其特征在于，在对有机氯农药污染场地土壤dna中的所...

【专利技术属性】
技术研发人员：张忠云，高琪，郭升，
申请(专利权)人：南京建邦生态环境发展有限公司，
类型：发明
国别省市：