蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法技术

技术编号:42863843 阅读:67 留言:0更新日期:2024-09-27 17:27
本发明专利技术提供蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,属于生物信息分析领域,所述方法包括如下步骤:采用双向最佳比对的方法对蕉麻和芭蕉进行基因同源比对分析,进行差异基因表达分析,然后差异表达基因筛选,差异表达基因可视化处理,差异表达基因模式聚类处理,差异表达基因GO功能注释,差异表达基因KEGG通路注释,进行差异表达基因功能与通路的富集分析,差异表达基因IPATH分析,差异表达基因基于GO的GSEA分析,差异表达基因基于KEGG的GSEA分析。通过差异基因KEGG富集分析发现,DEGs显著富集在次生代谢物的生物合成、代谢途径、内质网中的蛋白质加工、内吞作用、泛素介导的蛋白水解等途径与细胞壁建成和纤维细胞发育密切相关。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息分析领域,尤其涉及蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法


技术介绍

1、蕉麻(musa textilis nee)又称马尼拉麻(manila hemp),属芭蕉科芭蕉属,多年生草本植物,热带优质硬纤维作物。蕉麻纤维具有很强的机械强度(被认为是天然纤维中最强的)、耐盐水浸泡、耐腐蚀、力学性能好等特点,在绳索、纱线、纺织品、工艺品、汽车工业软装饰及作为聚合物复合材料的增强剂等领域发挥着极为重要的作用。2019年全球剑麻纤维产量20.7万吨(联合国粮食及农业组织,2020),远低于80万吨的需求,呈供不应求态势。然而蕉麻也属硬质纤维,拉力强,多用于绳缆,在一定程度上可替代剑麻],且以蕉麻纤维作为聚合物的增强材料在工业中具有更为广泛的用途,因此蕉麻纤维可作为替代剑麻纤维的一种战略资源,从而填补天然纤维市场的巨大缺口。

2、植物纤维细胞壁是原生质体外围动态有序的高纤维复合物。细胞壁是植物细胞的重要组成部分,决定着植物细胞的性状、大小和机械强度,同时对植物细胞生长和分化,水分运输及应对外界刺激反应均具有重要作用。植物细胞壁化学组成与结构本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤1的具体过程为:

3.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤2的具体过程为:

4.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤4的具体过程为:

5.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤5的具体过程为:

6.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤6的具...

【技术特征摘要】

1.蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤1的具体过程为:

3.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤2的具体过程为:

4.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤4的具体过程为:

5.根据权利要求1所述的蕉麻和芭蕉真核转录组测序及分析方法,其特征在于:步骤5的具体过程为:

6....

【专利技术属性】
技术研发人员:刘明吴密陈涛金刚蒋越华覃旭杨祥燕黄灿彭欣怡黄显雅钟敬贤崔明勇
申请(专利权)人:广西壮族自治区亚热带作物研究所广西亚热带农产品加工研究所
类型:发明
国别省市:

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