水稻籽粒镉含量相关基因YZCd1的SNP分子标记的应用制造技术

技术编号:42689486 阅读:22 留言:0更新日期:2024-09-10 12:38
本发明专利技术属于植物分子育种技术领域,具体涉及水稻籽粒镉含量相关基因YZCd1的SNP分子标记的应用。所述SNP分子标记的基因位于水稻第7号染色体上SEQ ID No.1的第2559位核苷酸,其为T或C。通过实验证明了TagSNP‑7501871是水稻籽粒镉含量相关的SNP分子标记。通过检测待测水稻基因组中SNP位点的多态性或基因型,根据基因型鉴定或辅助鉴定水稻籽粒镉含量。本发明专利技术还提供了一种引物组合物及利用引物组合物鉴定或辅助鉴定水稻籽粒镉含量的方法,可用于预测水稻籽粒镉含量,可对待筛选水稻进行早期筛选,用于水稻分子标记辅助育种,本发明专利技术提供的SNP分子标记在发掘籽粒镉含量低的水稻种质资源和选育籽粒镉含量低的水稻品种的研究中具有重要的应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于植物分子育种,具体涉及水稻籽粒镉含量相关基因yzcd1的snp分子标记的应用。


技术介绍

1、近年来,全基因组关联分析作为一种有效的基因定位工具,已经成为当前研究生物基因组的先进方法之一。全基因组关联分析不仅适用于单基因控制的性状,还适用于复杂的数量性状由多基因进行控制的研究,并且在数量性状上具有很大的优势。snp作为第三代分子标记检测体系,具有高密度、遗传稳定性高、操作简便、效率高、成本低等优势。对于抗病性相关的复杂的数量性状,非常适合利用全基因组关联分析的方法,对抗性相关的遗传位点进行初步定位。

2、重金属污染具有复杂隐蔽性、危害持久性,尤其可能通过食物链的富集作用危及人类健康。其中镉是对环境毒性最大的重金属元素之一,对水稻等粮食作物的安全生产构成严重威胁。稻米中镉含量超标会严重影响人体健康,长期摄入高镉稻米会诱发肾脏慢性中毒、骨质疏松、脊柱变形等多种疾病。目前,可用于镉低积累新品种选育的分子标记较少,这些标记的使用需要繁琐的凝胶电泳检测,自动化程度低通量小,因此,急需发掘使用简单、自动化程度高的snp位点,加快镉低积累新品种本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.水稻籽粒镉含量相关的SNP分子标记,所述SNP分子标记的基因位于水稻第7号染色体上SEQ ID No.1的第2559位核苷酸,多态性为T或C。

2.一种产品,包含检测权利要求1所述的水稻籽粒镉含量相关的SNP分子标记的物质。

3.如权利要求2所述的产品,其特征在于,所述产品包含用于扩增权利要求1所述的与水稻籽粒镉含量相关的SNP分子标记的引物组合物。

4.如权利要求3所述的产品,其特征在于,所述引物组合物由引物A、引物B和引物C组成,所述引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;

5.一种试剂盒,包含权利要求3或4所示的引物组合物...

【技术特征摘要】

1.水稻籽粒镉含量相关的snp分子标记,所述snp分子标记的基因位于水稻第7号染色体上seq id no.1的第2559位核苷酸,多态性为t或c。

2.一种产品,包含检测权利要求1所述的水稻籽粒镉含量相关的snp分子标记的物质。

3.如权利要求2所述的产品,其特征在于,所述产品包含用于扩增权利要求1所述的与水稻籽粒镉含量相关的snp分子标记的引物组合物。

4.如权利要求3所述的产品,其特征在于,所述引物组合物由引物a、引物b和引物c组成,所述引物a的核苷酸序列如seq id no.2所示;

5.一种试剂盒,包含权利要求3或4所示的引物组合物。

6.权利要求1所述的与水稻籽粒镉含量相关的snp分子标记、权利要求2-4中任一项所述的产品、权利要求5所述的试剂盒在(1)-(...

【专利技术属性】
技术研发人员:张洪亮闫慧莉何振艳许文秀谢建引韩晓燕
申请(专利权)人:海南大学三亚南繁研究院
类型:发明
国别省市:

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