【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，具体涉及一种ssr标记引物在甘薯块根性状筛选中的应用。
技术介绍
1、甘薯是复杂的异源六倍体作物(2n＝6x＝90)，遗传背景高度复杂，基因组高度杂合，且存在自交不亲和现象，造成其育种周期长，育种效率低下。在采用单交、集团杂交、开放授粉等手段杂交获得实生种后，需将实生种播种，并单株进行鉴定，筛选优异的后代材料。再将筛选获得的实生材料繁殖构成株系材料，再对株系材料进行性状鉴定，之后进入行比阶段继续选优，形成各世代株系，繁殖、鉴定，最终选育性状优异的品种。该过程耗费大量人力和物力，且周期较长，通常需持续进行数年的试验。而且，杂种一代入选过多会增加工作量、拖长育种年限，入选过少会错失优良品系，因此，对后代材料性状的高效筛选是育种的关键。
2、分子标记辅助选择(molecular marker assisted selection，mas)是重要的生物育种手段，利用性状相关基因或位点连锁分子标记作为辅助，通过分子标记检测目标基因的存在，达到选择目标性状的目的，具有快速、准确、不易受环境影响等优点。可应用于鉴别亲本亲缘关系、遗传背景分析、杂交后代选择、杂种优势预测及品种纯度鉴定等各个育种环节。目前，分子标记辅助选择技术在水稻等作物中已经得到应用。然而，甘薯中应用分子标记辅助选择的报道仍然较少。
3、采用分子标记对杂交后代进行早代筛选，可在苗期预测杂交后代的性状，有效缩小候选材料的检测范围，缩短育种周期，提高育种效率。淀粉含量、出粉率、干率、胡萝卜素含量、淀粉组分(直链淀粉含量、直支比)等性状是甘
技术实现思路
1、有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种ssr标记引物在甘薯块根性状筛选中的应用。
2、为达到上述目的，本专利技术提供如下技术方案：
3、1、ssr标记引物在甘薯块根性状筛选中的应用，所述块根性状为块根中直链淀粉和β-胡萝卜素的含量；所述ssr标记引物的编号为sip003、sip031、sip137、sip171、sip232、sip283，其核苷酸序列分别如seq id no.1～seq id no.8、seq id no.11～seq id no.12、seq id no.15～seq id no.16所示，用于筛选不同直链淀粉含量的甘薯品种；所述ssr标记引物的编号为sip200、sip250、sip296、sip302，其核苷酸序列如seq id no.9～seq idno.10、seq id no.13～seq id no.14、seq id no.17～seq id no.20所示，用于筛选不同β-胡萝卜素含量的甘薯品种。
4、本专利技术优选的，sip003的扩增带型出现约150bp、155bp、160bp、200bp和230bp条带时，或sip031在400bp以下的扩增带型出现约200bp、210bp、280bp和315bp条带时，或sip171在400bp以下的扩增带型出现约250bp、255bp、350bp和355bp条带时，用于筛选直链淀粉含量为20-29％(重量)的甘薯品种。
5、本专利技术优选的，sip137的扩增带型出现约280bp、285bp和290bp条带时，或sip171在400bp以下的扩增带型出现约250bp、255bp、280bp、300bp、350bp和355bp条带时，或sip232的扩增带型出现约135bp、140bp、170bp、220bp、230bp、300bp和320bp条带时，或sip283的扩增带型出现约200bp、230bp、250bp和400bp条带时，用于筛选直链淀粉含量高于30％(重量)的甘薯品种。
6、本专利技术优选的，sip302的扩增带型出现约120bp、150bp、160bp和170bp条带时，可用于筛选胡萝卜素含量低于6mg/100g鲜薯的甘薯品种。
7、本专利技术优选的，sip200的扩增带型出现约230bp、240bp和250bp条带时，或sip250的扩增带型出现约200bp、220bp和240bp条带时，或sip302的扩增带型出现约120bp、270bp和280bp条带时，可用于筛选胡萝卜素含量介于6-10mg/100g鲜薯的甘薯品种。
8、本专利技术优选的，sip296的扩增带型出现约120bp和125bp条带时，或sip200的扩增带型出现约250bp和260bp条带时，可用于筛选胡萝卜素含量高于10mg/100g鲜薯的甘薯品种。
9、本专利技术优选的，具体包括如下步骤：
10、(1)提取甘薯叶片的基因组dna；
11、(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板，如seq id no.1～seq id no.20所示序列为引物进行pcr扩增，然后进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，根据电泳的多态性条带标记筛选获得块根中直链淀粉或β-胡萝卜素含量不同的甘薯。
12、本专利技术优选的，所述pcr扩增条件为95℃预变性3min；95℃变性10s，退火温度55℃进行10s，72℃条件下延伸10s，循环35次；然后72℃条件下延伸2min，低温12℃保持10min。
13、本专利技术的有益效果在于：本研究选用了课题组前期研究中开发的与淀粉含量、β-胡萝卜素含量和淀粉组分相关联的32、16和17个ssr标记，得到用于筛选不同直链淀粉含量材料的有效标记：sip003、sip031、sip137、sip171、sip232、sip283共6个，其中可筛选高直链淀粉含量材料的有效标记：sip137、sip171、sip232、sip283共四个；结合测得的β-胡萝卜素含量，得到可筛选β-胡萝卜素含量的有效标记：sip200、sip250、sip296、sip302共4个，其中可筛选高胡萝卜素含量材料的有效标记：sip200、sip296共2个。
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1.SSR标记引物在甘薯块根性状筛选中的应用，其特征在于，所述块根性状为块根中直链淀粉和β-胡萝卜素的含量；所述SSR标记引物的编号为SIP003、SIP031、SIP137、SIP171、SIP232、SIP283，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.11～SEQ IDNO.12、SEQ ID NO.15～SEQ ID NO.16所示，用于筛选不同直链淀粉含量的甘薯品种；所述SSR标记引物的编号为SIP200、SIP250、SIP296、SIP302，其核苷酸序列如SEQ ID NO.9～SEQID NO.10、SEQ ID NO.13～SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.17～SEQ ID NO.20所示，用于筛选不同β-胡萝卜素含量的甘薯品种。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，SIP003的扩增带型出现约150bp、155bp、160bp、200bp和230bp条带时，或SIP031在400bp以下的扩增带型出现约200bp、210bp、280bp和315bp条带时，或SIP171在400bp
3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，SIP137的扩增带型出现约280bp、285bp和290bp条带时，或SIP171在400bp以下的扩增带型出现约250bp、255bp、280bp、300bp、350bp和355bp条带时，或SIP232的扩增带型出现约135bp、140bp、170bp、220bp、230bp、300bp和320bp条带时，或SIP283的扩增带型出现约200bp、230bp、250bp和400bp条带时，用于筛选直链淀粉含量高于30％(重量)的甘薯品种。
4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，SIP302的扩增带型出现约120bp、150bp、160bp和170bp条带时，可用于筛选胡萝卜素含量低于6mg/100g鲜薯的甘薯品种。
5.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，SIP200的扩增带型出现约230bp、240bp和250bp条带时，或SIP250的扩增带型出现约200bp、220bp和240bp条带时，或SIP302的扩增带型出现约120bp、270bp和280bp条带时，可用于筛选胡萝卜素含量介于6-10mg/100g鲜薯的甘薯品种。
6.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，SIP296的扩增带型出现约120bp和125bp条带时，或SIP200的扩增带型出现约250bp和260bp条带时，可用于筛选胡萝卜素含量高于10mg/100g鲜薯的甘薯品种。
7.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，具体包括如下步骤：
8.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增条件为95℃预变性3min；95℃变性10s，退火温度55℃进行10s，72℃条件下延伸10s，循环35次；然后72℃条件下延伸2min，低温12℃保持10min。
...【技术特征摘要】
1.ssr标记引物在甘薯块根性状筛选中的应用，其特征在于，所述块根性状为块根中直链淀粉和β-胡萝卜素的含量；所述ssr标记引物的编号为sip003、sip031、sip137、sip171、sip232、sip283，其核苷酸序列分别如seq id no.1～seq id no.8、seq id no.11～seq idno.12、seq id no.15～seq id no.16所示，用于筛选不同直链淀粉含量的甘薯品种；所述ssr标记引物的编号为sip200、sip250、sip296、sip302，其核苷酸序列如seq id no.9～seqid no.10、seq id no.13～seq id no.14、seq id no.17～seq id no.20所示，用于筛选不同β-胡萝卜素含量的甘薯品种。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，sip003的扩增带型出现约150bp、155bp、160bp、200bp和230bp条带时，或sip031在400bp以下的扩增带型出现约200bp、210bp、280bp和315bp条带时，或sip171在400bp以下的扩增带型出现约250bp、255bp、350bp和355bp条带时，用于筛选直链淀粉含量为20-29％(重量)的甘薯品种。
3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，sip137的扩增带型出现约280bp、285bp和290bp条带时，或sip171在400bp以下的扩增带型出现约250bp、255bp、280bp、300bp、350b...
【专利技术属性】
技术研发人员：张凯，王季春，闫彩月，唐道彬，吕长文，杜康，
申请(专利权)人：西南大学，
类型：发明
国别省市：
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