靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法技术

本公开实施例中提供了一种靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法，属于生物信息学技术领域，具体包括：将药物SMILES作为输入，获取最终的药物的特征向量；将靶点的序列作为输入，使用多层一维卷积神经网络从靶点的序列中提取靶点的特征向量；使用非对称的交叉注意力机制获取药物和靶点对的融合特征向量；将融合特征向量输入初始模型预测药物和靶点的亲和力，计算损失，并基于反向传播方法更新初始模型的参数；直到模型拟合，得到预训练模型；使用突变数据集对预训练模型进行微调，得到目标模型；使用目标模型对特定的药物和靶点的亲和力进行预测，得到预测分值。通过本公开的方案，提高了预测效率和精准度。

【技术实现步骤摘要】

本公开实施例涉及生物信息学，尤其涉及一种靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法。

技术介绍

1、目前，在有效治疗及最大程度减少治疗期间副作用的过程中，特定关键靶点抑制剂的识别显得至关重要。因此药物-靶点亲和力(drug-target affinity，dta)研究已然成为跨领域研究的焦点，是药物研发过程中的关键环节。从生物医学实验的角度，dta实验方法从依赖化学修饰向非化学修饰的转变已经成为趋势。细胞热转移实验(cellularthermal shift assay，cetsa)和热蛋白质组分析(thermal proteome profiling，tpp)等技术，因其在识别药物与靶点间相互作用方面的广泛应用而备受青睐。x射线晶体学作为研究生物大分子结构的核心技术，能够精确揭示小分子与蛋白质间的结合机制，解析复杂的结构。这两类方法因其在分析药物-靶点结合亲和力方面所展现出的高度可靠性而被高度肯定。然而它们高昂的成本及对精密实验设施的需求限制了其在广泛筛选药物靶点亲和力方面的应用。由于肿瘤、病毒或细菌引发的疾病频繁展现出对药物的抵抗性，蛋白质的突变成为本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于,所述使用定向消息传递神经网络聚合药物分子图上节点信息，使用Readout函数获取最终的药物的特征向量的步骤，包括：

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于,每层一维卷积神经网络中使用残差连接方法。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于,所述使用多层一维卷积神经网络从靶点的序列中提取靶点的特征向量的步骤，包括：

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于,所述交叉注意力机制的表达式为

6.根据权利要求5所述的方法...

【技术特征摘要】

1.一种靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于,所述使用定向消息传递神经网络聚合药物分子图上节点信息，使用readout函数获取最终的药物的特征向量的步骤，包括：

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于,每层一维卷积神经网...

【专利技术属性】
技术研发人员：李广迪，邓磊，张东山，秦家碧，胡小文，张盼，黄洁，宋启翔，
申请(专利权)人：中南大学，
类型：发明
国别省市：