【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物技术相关领域，尤其是一种与小麦千粒重相关的snp位点及其应用。
技术介绍
1、小麦(triticum aestivum l)是最主要的粮食作物之一。提升小麦单产是满足粮食需求不断提高的重要方式。小麦千粒重是决定小麦产量的重要因素。主要在生殖生长时期影响。因此，挖掘调控千粒重的优异等位变异并开发功能标记在小麦高产育种中具有重要的应用价值。
2、目前，研究人员已经定位了大量调控千粒重的qtl。guan等利用“nd3338和jd6”的dh群体在4a上检测到千粒重qtl，并构建了qtl近等基因系。chen等检测到16个与正常条件下千粒重相关的稳定snp，分布在1b、2b、3a、3b、5a、5b和7d染色体上。meng等利用“kn9204和j411”杂交的重组自交系筛选出定位在2d上的千粒重qtl。hu等利用“陇鉴19和q9086”杂交的重组自交系筛选出了定位在1a、3b、4d和6a上的千粒重qtl。
3、由此可见，开发新的千粒重相关snp位点，尤其是效果显著性和稳定性优势明显的新的小麦千粒重相关snp位点分子标记，是小麦科研和育种应用中的重要课题。
技术实现思路
1、本专利技术要解决的技术问题是提供一种与小麦千粒重相关的snp位点及其应用。
2、为解决上述技术问题，本专利技术所采取的技术方案如下。
3、本专利技术首先包括一种与小麦千粒重相关的snp位点，对应于seq id no.1所示序列自5’末端第4139位碱基，该位
4、所述snp位点的用途，包括但不限于：用于开发分子标记引物、用于构建基因检测试剂盒、用于小麦的定向育种。
5、引物组合，包括seq id no.2和seq id no.3组成的引物对1f和1r，以及seq idno.4和seq id no.5组成的引物对2f和2r。
6、所述引物组合的用途，通过此引物组合对包含所述snp位点在内的基因片段进行pcr扩增产及酶切鉴定以区分所述snp位点的基因型、用于构建基因检测试剂盒、用于小麦的定向育种。
7、用于检测权利要求1所述snp位点基因型的试剂盒，至少所述的引物组合。
8、作为本专利技术的一种优选技术方案，所述试剂盒还包括pcr扩增所需的缓冲液、dntps、必要的限制性内切酶组件。
9、作为本专利技术的一种优选技术方案，所述限制性内切酶为hinfi酶。
10、所述试剂盒的用途，用于鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性性状。
11、作为本专利技术的一种优选技术方案，在分子标记辅助选择育种mas早期，通过对所述snp位点的基因型进行鉴定，获取具有更高或更低千粒重的小麦品种，由此进行小麦的定向育种或辅助定向育种。
12、在分子标记辅助选择育种mas早期鉴定或辅助鉴定小麦千粒重表型的方法，对待测小麦基因组dna中任意一段包含权利要求1所述snp位点在内的dna片段进行pcr扩增，并将该pcr扩增产物进行酶切鉴定；所述pcr扩增的特异性引物对为seq id no.2和seq idno.3组成的引物对1f和1r，以及seq id no.4和seq id no.5组成的引物对2f和2r；所述酶切包括以下步骤：以小麦基因组dna为模板，以引物1f和1r为引物对扩增得到pcr产物；将此pcr产物稀释100倍，以其作为模板，以引物2f和2r为引物对扩增得到pcr产物；用限制性内切酶hinfi酶切pcr产物；若pcr产物可以被切开，则该核苷酸多态性位点为a/a，基因型为甲；若pcr产物不能被切开，则该核苷酸多态性位点为g/g，基因型为乙；以基因型甲对应的小麦作为具有更高千粒重表型的候选小麦品种，以以基因型乙对应的小麦作为具有更低千粒重表型的候选小麦品种。
13、采用上述技术方案所产生的有益效果在于：本专利技术通过对小麦自然变异群体的遗传变异分析，发现有一个snp，对应于序列表序列1自5’末端第4139位，该snp存在两种基因型：基因型甲(a)、基因型乙(g)。通过关联分析证明，这两种单倍型的纯合类型中，千粒重大小为：基因型甲纯合的小麦>基因型乙纯合的小麦。本专利技术的snp位点具有效果显著性和稳定性的潜在优势，对于小麦科研及其育种应用均具有重要价值。
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1.与小麦千粒重相关的SNP位点，对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第4139位碱基，该位点为A/A纯合时相对应的基因型是甲；该位点为G/G纯合时相对应的基因型是乙；该位点为A/G杂合时相对应的基因型是丙；对于小麦千粒重表型而言，基因型甲纯合的小麦＞基因型乙纯合的小麦。
2.权利要求1所述SNP位点的用途，包括但不限于：用于开发分子标记引物、用于构建基因检测试剂盒、用于小麦的定向育种。
3.引物组合，包括SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，以及SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R。
4.权利要求2所述引物组合的用途，通过此引物组合对包含所述SNP位点在内的基因片段进行PCR扩增产及酶切鉴定以区分所述SNP位点的基因型、用于构建基因检测试剂盒、用于小麦的定向育种。
5.用于检测权利要求1所述SNP位点基因型的试剂盒，至少包括权利要求3所述的引物组合。
6.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒还包括PCR扩增所需的缓冲液、dNTPs、
7.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：所述限制性内切酶为HinfI酶。
8.权利要求5-7任一项所述的试剂盒的用途，用于鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性性状。
9.根据权利要求8的应用，其特征在于：在分子标记辅助选择育种MAS早期，通过对所述SNP位点的基因型进行鉴定，获取具有更高或更低千粒重的小麦品种，由此进行小麦的定向育种或辅助定向育种。
10.在分子标记辅助选择育种MAS早期鉴定或辅助鉴定小麦千粒重表型的方法，其特征在于：对待测小麦基因组DNA中任意一段包含权利要求1所述SNP位点在内的DNA片段进行PCR扩增，并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定；所述PCR扩增的特异性引物对为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，以及SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R；所述酶切包括以下步骤：以小麦基因组DNA为模板，以引物1F和1R为引物对扩增得到PCR产物；将此PCR产物稀释100倍，以其作为模板，以引物2F和2R为引物对扩增得到PCR产物；用限制性内切酶HinfI酶切PCR产物；若PCR产物可以被切开，则该核苷酸多态性位点为A/A，基因型为甲；若PCR产物不能被切开，则该核苷酸多态性位点为G/G，基因型为乙；以基因型甲对应的小麦作为具有更高千粒重表型的候选小麦品种，以以基因型乙对应的小麦作为具有更低千粒重表型的候选小麦品种。
...【技术特征摘要】
1.与小麦千粒重相关的snp位点，对应于seq id no.1所示序列自5’末端第4139位碱基，该位点为a/a纯合时相对应的基因型是甲；该位点为g/g纯合时相对应的基因型是乙；该位点为a/g杂合时相对应的基因型是丙；对于小麦千粒重表型而言，基因型甲纯合的小麦＞基因型乙纯合的小麦。
2.权利要求1所述snp位点的用途，包括但不限于：用于开发分子标记引物、用于构建基因检测试剂盒、用于小麦的定向育种。
3.引物组合，包括seq id no.2和seq id no.3组成的引物对1f和1r，以及seq id no.4和seq id no.5组成的引物对2f和2r。
4.权利要求2所述引物组合的用途，通过此引物组合对包含所述snp位点在内的基因片段进行pcr扩增产及酶切鉴定以区分所述snp位点的基因型、用于构建基因检测试剂盒、用于小麦的定向育种。
5.用于检测权利要求1所述snp位点基因型的试剂盒，至少包括权利要求3所述的引物组合。
6.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒还包括pcr扩增所需的缓冲液、dntps、必要的限制性内切酶组件。
7.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：所述限制性内切酶为hinfi酶。
8.权利要求5...
【专利技术属性】
技术研发人员：郭琳，叶一凡，杨雨风，张腾腾，刘西岗，
申请(专利权)人：河北师范大学，
类型：发明
国别省市：
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