一种基于CRISPRi的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法和应用技术

技术编号:42658422 阅读:78 留言:0更新日期:2024-09-10 12:17
本发明专利技术涉及一种基于CRISPRi的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法和应用。本发明专利技术在杀鱼爱德华氏菌中建立了基于CRISPR‑Cas9系统的基因靶向干扰系统(CRISPR interference,CRISPRi),并结合高通量测序技术建立CRISPRi‑seq技术平台,以及适应于体内条件必需基因筛查的PACE 2.0方法,可以鉴定杀鱼爱德华氏菌在感染条件下的全基因组范围内包含必需基因和短基因的适应性决定因子,探究杀鱼爱德华氏菌致病机制,揭示减毒活疫苗开发的新型靶点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及减毒活疫苗研发领域,尤其是涉及一种基于crispri的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法和应用。


技术介绍

1、杀鱼爱德华氏菌(edwardsiella piscicida)是一种革兰氏阴性菌,可感染淡水和海水鱼类并导致危害严重的爱德华氏菌病,对水产养殖业产生严重危害[1]。以抗生素为代表的化学疗法对爱德华氏菌病害的控制和防治曾发挥了积极作用。但是,过度使用抗生素会造成严重的环境污染以及超级耐药菌的出现,危害人类健康。美国和欧盟已经逐渐禁止以抗生素为主的化学药物在水产养殖业中的应用。人们对水产品安全和环境保护的关注越来越重视,通过疫苗防控水产病害并且有利于水产养殖环境的保护的有效手段。疫苗具有针对性强、抗病周期长、可终身免疫、效果显著和防治主动的特点。为水产养殖病害防治提供了有效手段。

2、抗生素作为化学疗法的代表,曾在对爱德华氏菌病害的控制和防治中发挥了重要作用。然而,过度使用抗生素可能导致严重环境污染,并促使超级耐药菌的出现,对人类健康造成危害。美国和欧盟已逐步禁止在水产养殖业中使用以抗生素为主的化学药物。在中国,人们日益本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于CRISPRi的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法,其特征在于,具体步骤如下:

2.根据权利要求1所述的一种基于CRISPRi的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法,其特征在于,步骤S1中,通过PCR扩增杀鱼爱德华氏菌基因组中性位点上下游片段,得到up片段和down片段;

3.根据权利要求1所述的一种基于CRISPRi的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法,其特征在于,步骤S5中,所述测序手段为Illumina测序。

4.一种基于CRISPRi的杀鱼爱德华氏菌减毒株,其特征在于,所述减毒株中如权利要求1中所述的高通量筛选方法得到的杀...

【技术特征摘要】

1.一种基于crispri的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法,其特征在于,具体步骤如下:

2.根据权利要求1所述的一种基于crispri的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法,其特征在于,步骤s1中,通过pcr扩增杀鱼爱德华氏菌基因组中性位点上下游片段,得到up片段和down片段;

3.根据权利要求1所述的一种基于crispri的杀鱼爱德华氏菌减毒靶点的高通量筛选方法,其特征在于,步骤s5中,所述测序手段为illumina测序。

4.一种基于crispri的杀鱼爱德华氏菌减毒株,其特征在于,所述减毒株中如权利要求1中所述的高通量筛选方法得到的杀鱼爱德华氏菌毒力因子的基因或基因片段被下调。

5.根据权利要求4所述的一种基于crispri的杀鱼爱德华氏菌减毒株,其特征在于,所述杀鱼爱德华氏菌毒力因子包括bama、lpta、mura、ftsz或lptb基因。

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【专利技术属性】
技术研发人员:王启要邵帅张日煜张博雅王蓬勃张元兴刘琴吴宵
申请(专利权)人:华东理工大学
类型:发明
国别省市:

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