【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物技术检测领域，涉及微生物耐药领域，尤其涉及一种阴道加德纳菌药敏标志基因及其检测方法和应用。
技术介绍
1、本部分的陈述仅仅是提供了与本专利技术相关的
技术介绍
信息，不必然构成在先技术。
2、细菌性阴道病(bacterial vaginitis,bv)是育龄妇女最常见的生殖道炎症性疾病，由于阴道内微生物菌群与宿主、环境之间所构成的动态平衡遭到破坏，导致菌群失调而引起的一组症候群，发病率高达23-29％。阴道加德纳菌(gardnerella vaginalis,gv)是引起细菌性阴道病的主要致病菌，阴道加德纳菌作为细菌性阴道病的重要致病菌之一，其具有高度遗传可变性和普遍致病性，对该菌的流行菌株进行药敏性检测发现该细菌的抗生素耐药性多变，给细菌性阴道病的治疗带来了挑战。随着临床抗生素的广泛应用，细菌耐药性的问题日益严重，细菌的药物敏感性检测对于精准有效治疗具有重要意义，通过对目前临床上药敏检测方法的优缺点进行探讨，发现传统的药敏检测方法需进行菌株纯化，不仅操作繁琐耗时较长，还容易产生污染影响检测准确率，无法满足临床急需的快速检测需求，若能够直接对原始临床样本进行细菌药敏性检测，能够大大降低时间成本。因此，开发一种可靠的针对原始临床样本的细菌药敏性快速检测方法，有助于解决目前该领域的临床难题，改善对细菌性阴道病的治疗效果。
3、由于阴道加德纳菌为兼性厌氧菌，且对生长条件有一定需求，现如今临床上传统检测药物敏感性的方法时间较长且准确度较差，而新型检测药物敏感性的方法成本较高且技术难度较大，导致现在临
技术实现思路
1、为克服上述现有技术的不足，本专利技术提供了一种阴道加德纳菌药敏标志基因及其检测方法和应用。本专利技术中提供了16种阴道加德纳菌的药敏标志基因。通过加入抗生素后检测原始临床样本中药敏标志基因的表达量变化情况以确定样本中阴道加德纳菌的药敏性，即探索基于阴道加德纳菌药敏标志基因的药敏性快速检测方法，以应对细菌性阴道病治疗中的细菌药敏性检测难题，克服现有药敏检测方法针对厌氧菌的临床应用缺陷、大幅降低细菌药敏检测时间成本的应用。
2、为实现上述目的，本专利技术的一个或多个实施例提供了如下技术方案：
3、第一方面，提供一种阴道加德纳菌药敏标志基因，所述药敏标志基因为duf881、brnq、prmc、rok、psts、tal、pyrf、naga、trmd、glna、srmb、nusa、glf、nrdg、mfs或nrde中的任意一种或多种；
4、所述药敏标志基因的核酸序列分别如seq id no.1-16所示。
5、本专利技术中，认为敏感菌株与耐药菌株在抗生素存在时基因的表达量变化情况有显著差异，因而其转录组中某些基因的转录水平变化可以反映出微生物是否受对某类抗生素耐受或敏感，我们将这些基因称为药敏标志基因。
6、第二方面，提供确定样本中第一方面所述的药敏标志基因表达水平的试剂在制备检测阴道加德纳菌药物敏感性产品中的应用。
7、在本专利技术的具体实施方式中，所述药物包括抑制dna合成的抗生素、抑制蛋白质合成的抗生素或抑制细胞壁合成的抗生素；
8、优选的，所述抑制dna合成的抗生素，包括甲硝唑(metronidazole，甲硝唑)或环丙沙星(dithiothreitol，环丙沙星)；
9、所述抑制蛋白质合成的抗生素，包括te(tetracycline,四环素)、azm(azithromycin,阿奇霉素)、erm(erythromycin,红霉素)、cli(clindamycin,克林霉素)、dnr(daunorubicin,柔红霉素)、gm(gentamicin,庆大霉素)和to(tobramycin,妥布霉素)；
10、所述抑制细胞壁合成的抗生素，包括amp(ampicillin,氨苄青霉素)、cmr(chloramphenicol,氯霉素)和va(vancomycin,万古霉素)；
11、当药物为甲硝唑时，所述药敏标志基因为duf881、brnq、prmc或rok中的任意一种或多种；
12、当药物为阿奇霉素时，所述药敏标志基因为psts、tal、pyrf、naga、trmd、glna、srmb或nusa中的任意一种或多种；
13、当药物为氨苄青霉素时，所述药敏标志基因为glf、nrdg、mfs或nrde中的任意一种或多种。
14、在本专利技术的具体实施方式中，所述确定样本中药敏标志基因表达水平的试剂包括特异性扩增药敏标志基因的引物和/或特异性识别药敏标志基因的探针。
15、在本专利技术的具体实施方式中，所述特异性扩增duf881的引物包括duf881 pf和duf881 pr，其核酸序列分别如seq id no.17-18所示；
16、或，所述特异性扩增brnq的引物包括brnq pf和brnq pr，其核酸序列分别如seqid no.19-20所示；
17、或，所述特异性扩增prmc的引物包括prmc pf和prmc pr，其核酸序列分别如seqid no.21-22所示；
18、或，所述特异性扩增rok的引物包括rok pf和rok pr，其核酸序列分别如seq idno.23-24所示；
19、或，所述特异性扩增psts的引物包括psts pf和psts pr，其核酸序列分别如seqid no.25-26所示；
20、或，所述特异性扩增tal的引物包括tal pf和tal pr，其核酸序列分别如seq idno.27-28所示；
21、或，所述特异性扩增pyrf的引物包括pyr pf和pyr pr，其核酸序列分别如seq idno.29-30所示；
22、或，所述特异性扩增naga的引物包括naga pf和naga pr，其核酸序列分别如seqid no.31-32所示；
23、或，所述特异性扩增trmd的引物包括trmd pf和trmd pr，其核酸序列分别如seqid no.33-34所示；
24、或，所述特异性扩增glna的引物包括glna pf和glna pr，其核酸序列分别如seqid no.35-36所示；
25、或，所述特异性扩增srmb的引物包括srmb pf和srmb pr，其核酸序列分别如seqid no.37-38所示；
26、或，所述特异性扩增nusa的引物包括nusa pf和nusa pr，其核酸序列分别如seqid no.3本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种阴道加德纳菌药敏标志基因，其特征在于，所述药敏标志基因为duf881、brnq、prmc、rok、psts、tal、pyrf、naga、trmd、glna、srmb、nusa、glf、nrdg、mfs或nrde中的任意一种或多种；
2.确定样本中权利要求1所述的药敏标志基因表达水平的试剂在制备检测阴道加德纳菌药物敏感性产品中的应用。
3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，所述药物包括抑制DNA合成的抗生素、抑制蛋白质合成的抗生素、抑制细胞壁合成的抗生素；
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述确定样本中药敏标志基因表达水平的试剂包括特异性扩增药敏标志基因的引物和/或特异性识别药敏标志基因的探针。
5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增duf881的引物核酸序列分别如SEQ ID NO.17-18所示；
6.如权利要求2所述的应用，其特征在于，所述样本为阴道分泌物。
7.如权利要求5所述的应用，其特征在于，所述产品使用方法为：取待测样本在含有药物的培养基上进行培养，取总RNA，通
8.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包括权利要求2中所述的确定样本中药敏标志基因表达水平的试剂。
9.一种阴道加德纳菌药敏性检测系统，其特征在于，所述系统包括:
10.一种快速检测阴道加德纳菌药敏性的方法，其特征在于，加入抗生素刺激待测菌株后，在其对抗生素显著反应的临界点进行取样，检测其药敏标志基因的表达量变化，与药敏标志基因在耐药/敏感菌株的转录组变化情况进行比对以确定菌株的药敏性。
...【技术特征摘要】
1.一种阴道加德纳菌药敏标志基因，其特征在于，所述药敏标志基因为duf881、brnq、prmc、rok、psts、tal、pyrf、naga、trmd、glna、srmb、nusa、glf、nrdg、mfs或nrde中的任意一种或多种；
2.确定样本中权利要求1所述的药敏标志基因表达水平的试剂在制备检测阴道加德纳菌药物敏感性产品中的应用。
3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，所述药物包括抑制dna合成的抗生素、抑制蛋白质合成的抗生素、抑制细胞壁合成的抗生素；
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述确定样本中药敏标志基因表达水平的试剂包括特异性扩增药敏标志基因的引物和/或特异性识别药敏标志基因的探针。
5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增duf881的引物核...
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