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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因检测,具体涉及一种基于mtdna cytb基因的苹果蠧蛾pcr检测引物及检测方法和应用。
技术介绍
1、目前用于苹果蠹蛾鉴定的方法主要有:1)形态特征鉴定。在检疫工作中,截获的往往是低龄幼虫或卵,通常的作法是对其进行室内饲养至老熟幼虫后再进行鉴定,耗时长,延长了进出口物品的通关时间,增加了检疫人员的工作强度;2)mt dna cytb基因序列变异水平高于mt dna coⅰ和mt dnacoⅱ;pcr技术等,coⅰ和coⅱ技术曾用于鉴别苹果蠹蛾及其近缘种,但是需要将pcr产物回收、纯化、测序,根据序列比对和系统发育树构建来判断检测结果,操作步骤太多,也导致耗时长。
2、综上,现有苹果蠹蛾鉴定方法存在的问题是耗时长,检测速度慢。
技术实现思路
1、为了解决上述技术问题,本专利技术提供了一种基于mtdna cytb基因的苹果蠧蛾pcr检测引物及检测方法和应用。本专利技术的引物及pcr反应体系和反应条件,可以快速鉴别苹果蠹蛾,无需测序和序列比对,具有灵敏度高、特异性强、快速、简便且稳定性强的优点。
2、本专利技术提供一种基于mtdna cytb基因的苹果蠧蛾pcr检测引物,所述引物为cp-cytb-f和cp-cytb-r,核苷酸序列如下:
3、cp-cytb-f:
4、5’-ggttcattaattgatttaccatctccctct-3’;
5、cp-cytb-r:
6、5’-tacctaatgg
7、根据我们的引物特异性试验结果,该引物具有明确清晰的检测结果,且可以有效区分桃小食心虫、梨小食心虫与苹果蠹蛾。
8、本专利技术提供一种检测试剂盒,包括基于mtdna cytb基因的苹果蠧蛾pcr检测引物和pcr检测试剂。
9、如所述pcr检测试剂为10×easytaq buffer、high pure dntps和easytaq dnapolymerase。
10、利用上述检测试剂盒鉴定苹果蠹蛾时,无需测序,也无需根据序列比对和系统发育树构建来判断检测结果,操作步骤简化,耗时短,相比于现有技术,检测速度提升。
11、本专利技术提供一种苹果蠧蛾pcr检测方法,包括以下步骤:
12、提取待检测样本的基因组dna;
13、以提取的基因组dna为模板,利用所述的引物cp-cytb-f和cp-cytb-r进行pcr扩增;
14、扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,若扩增产物条带为586bp,则待检测样本为苹果蠹蛾,若没有586bp的条带,则待检测样本不是苹果蠹蛾。
15、优选的,pcr扩增反应体系为25μl,包括:引物cp-cytb-f、cp-cytb-r各0.5μl,基因组dna 1μl,10×easytaq buffer 2.5μl,high pure dntps 2μl,easytaq dna polymerase1μl,ddh2o补足至25μl。
16、优选的,pcr扩增的扩增反应条件为:
17、95℃预变性2min;95℃变性15s、45℃-49℃退火30s、72℃延伸45s、共40个循环;72℃延伸10min。
18、优选的,退火温度为45℃。
19、优选的,用质量分数1%的琼脂糖凝胶电泳分析,恒压110-125v,15-20min。
20、本专利技术提供一种基于mtdna cytb基因的苹果蠧蛾pcr检测引物的应用,所述引物用于鉴定苹果蠧蛾,区分苹果蠹蛾及其近缘种。
21、优选的,所述引物用于区分桃小食心虫、梨小食心虫与苹果蠹蛾。
22、优选的,所述苹果蠹蛾来自新疆阿勒泰、新疆博乐、新疆阿克陶、新疆石河子、甘肃张掖、甘肃金昌、辽宁彰武、辽宁营口、辽宁瓦房店、辽宁葫芦岛。
23、优选的,所述pcr的最低dna浓度检测限为3.125ng/μl。
24、与现有技术相比,本专利技术具有以下有益效果:
25、本专利技术的pcr检测引物,利用pcr手段检测待测样本基因组dna,根据琼脂糖电泳后条带的有无及大小来判断检测结果,无需测序和序列比对,具有灵敏度高、特异性强、快速、简便且稳定性强等优点。
26、另外,本专利技术设计的pcr引物以及建立的pcr反应体系和反应条件,能够实现快速、准确、高效对苹果蠹蛾的鉴别,可用于实际生产中对入侵害虫苹果蠹蛾的快速鉴定。可在实际中用于农业害虫和检验检疫中的害虫识别,从而为制定害虫防治策略和检疫提供参考。
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1.一种基于mtDNA Cytb基因的苹果蠧蛾PCR检测引物,其特征在于,为Cp-Cytb-F和Cp-Cytb-R,核苷酸序列如下:
2.一种检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物和PCR检测试剂。
3.一种检测苹果蠧蛾的PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的检测苹果蠧蛾的PCR检测方法,其特征在于,PCR扩增反应体系为25μL,包括:引物Cp-Cytb-F、Cp-Cytb-R各0.5μL,基因组DNA1μL,10×EasyTaq Buffer2.5μL,High pure dNTPs 2μL,EasyTaq DNAPolymerase 1μL,ddH2O补足至25μL。
5.根据权利要求4所述的检测苹果蠧蛾的PCR检测方法,其特征在于,PCR的扩增反应条件为:
6.根据权利要求5所述的检测苹果蠧蛾的PCR检测方法,其特征在于,用质量分数1%的琼脂糖凝胶电泳分析,恒压110-125V,15-20min。
7.根据权利要求1所述的基于mtDNACytb基因的苹果蠧蛾PCR
8.根据权利要求7所述的基于mtDNA Cytb基因的苹果蠧蛾PCR检测引物的应用,其特征在于,所述引物用于区分桃小食心虫、梨小食心虫与苹果蠹蛾。
9.根据权利要求7所述的基于mtDNA Cytb基因的苹果蠧蛾PCR检测引物的应用,其特征在于,所述苹果蠹蛾来自新疆阿勒泰、新疆博乐、新疆阿克陶、新疆石河子、甘肃张掖、甘肃金昌、辽宁彰武、辽宁营口、辽宁瓦房店、辽宁葫芦岛。
10.根据权利要求7所述的基于mtDNACytb基因的苹果蠧蛾PCR检测引物的应用,其特征在于,所述PCR的最低DNA浓度检测限为3.125ng/μL。
...【技术特征摘要】
1.一种基于mtdna cytb基因的苹果蠧蛾pcr检测引物,其特征在于,为cp-cytb-f和cp-cytb-r,核苷酸序列如下:
2.一种检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物和pcr检测试剂。
3.一种检测苹果蠧蛾的pcr检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的检测苹果蠧蛾的pcr检测方法,其特征在于,pcr扩增反应体系为25μl,包括:引物cp-cytb-f、cp-cytb-r各0.5μl,基因组dna1μl,10×easytaq buffer2.5μl,high pure dntps 2μl,easytaq dnapolymerase 1μl,ddh2o补足至25μl。
5.根据权利要求4所述的检测苹果蠧蛾的pcr检测方法,其特征在于,pcr的扩增反应条件为:
6.根据权利要求5所述的检测苹果蠧蛾的pcr检...
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