一种与橡胶树农艺性状相关的SNP位点组合及液相基因芯片和应用制造技术

技术编号:42623927 阅读:29 留言:0更新日期:2024-09-06 01:27
本发明专利技术公开了一种与橡胶树农艺性状相关的SNP位点组合及液相基因芯片和应用,属于分子标记领域。与橡胶树农艺性状相关的SNP位点组合包括2951个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该位点的等位基因变化,所述2951个SNP位点的物理位置是基于橡胶树野生种质MT/VB/25A 57/8的基因组序列比对确定的。本发明专利技术所筛选的2951个SNP位点与橡胶树重要农艺性状相关,可通过测定橡胶树个体DNA中这2951个SNP位点的基因型来评估橡胶树个体的农艺性状,将其应用于橡胶树的分子标记辅助育种和全基因组选择育种工作中,可实现节省育种成本,加快育种进程。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子标记领域,特别是涉及一种与橡胶树农艺性状相关的snp位点组合及液相基因芯片和应用。


技术介绍

1、分子标记分析方法均以dna的多态性为基础,如rflp、rapd、aflp、ssr以及snp标记等。早期rflp、rapd、aflp分子标记技术在使用中经常出现稳定性差、多态性低以及数据整合困难等问题,未能被广泛应用。由于snp标记具有高通量、位点特异、共显性遗传、误检率低、开发和检测成本急剧降低、数据易整合等优点,随着二代测序技术不断完善,基因组测序效率得到极大提高,测序成本也大幅度下降,snp标记成为基因型鉴定的主要标记类型,大大推动了遗传育种相关研究的进展。

2、橡胶树作为最重要的热带经济作物,其生产的天然橡胶是我国重要的战略资源,在军事、航空航天、海洋工程、轨道交通等领域具有不可替代的作用。目前在橡胶树的育种过程中,仍旧采用的是传统的表型性状评估方法,其需要对种子进行种植后,通过观察其树皮厚度、耐寒性、茎围生产速率和胶乳产量等方式来获得其性状指标。橡胶树传统育种方法的程序繁琐,橡胶树幼龄期长,育种周期长达30年,且根据早期表本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种与橡胶树农艺性状相关的SNP位点组合在如下任一项中的应用:

2.一种包含权利要求1中所述SNP位点的分子标记在如下任一项中的应用:

3.一种检测权利要求1中所述SNP位点的基因芯片在下任一项中的应用:

4.如权利要求1-3任一项所述的应用,其特征在于,所述橡胶树农艺性状包括树皮厚度、耐寒性、茎围生产速率、胶乳产量和乳管数量。

5.如权利要求1-3任一项所述的应用,其特征在于,所述辅助橡胶树育种包括选育与树皮厚度、耐寒性、茎围生产速率、胶乳产量或乳管数量相关的橡胶树品种或者品系。

6.一种基因芯片,其特征在于,包括检测权利...

【技术特征摘要】

1.一种与橡胶树农艺性状相关的snp位点组合在如下任一项中的应用:

2.一种包含权利要求1中所述snp位点的分子标记在如下任一项中的应用:

3.一种检测权利要求1中所述snp位点的基因芯片在下任一项中的应用:

4.如权利要求1-3任一项所述的应用,其特征在于,所述橡胶树农艺性状包括树皮厚度、耐寒性、茎围生产速率、胶乳产量和乳管数量。

5.如权利要求1-3任一项所述的应用,其特征在于,所述辅助橡胶树育种包括选育与树皮厚度、耐寒性、茎围生产速率、胶乳产量或乳管数量相关的橡胶树品种或...

【专利技术属性】
技术研发人员:王小波程汉吴挺开邓治安泽伟吴文冠袁渊
申请(专利权)人:中国热带农业科学院三亚研究院
类型:发明
国别省市:

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