一种用于确定抗原抗体对接信息的方法与设备技术

技术编号:42622374 阅读:62 留言:0更新日期:2024-09-06 01:26
本申请的目的是提供一种用于确定抗原抗体对接信息的方法与设备,该方法包括:基于抗原信息与抗体信息,利用深度学习网络,获取相应的抗原抗体对接信息,其中,所述抗原信息包括抗原序列信息与抗原结构信息,所述抗体信息包括抗体序列信息与抗体结构信息,所述深度学习网络包括编码器‑解码器架构,所述抗原抗体对接信息包括抗原抗体复合物结构信息。该深度学习网络对未结合的抗原、抗体的结合结构进行预测,不仅预测了抗原抗体结合的结构,还预测了抗原和抗体由未结合到结合状态中自身的结构的转变。利用编码器‑解码器架构进行结合结构预测有效提升计算效率与预测准确性。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及生物信息学,尤其涉及一种用于确定抗原抗体对接信息的技术。


技术介绍

1、抗体通过与外来物质结合、激活补体、促进吞噬细胞的吞噬作用等,在免疫系统中起着至关重要的作用。精确预测抗原与抗体的结合构型,对免疫药物的研发很有帮助。虽然抗原与抗体单独的结构现在可以被高精度地预测,但确定抗原与抗体复合物的三维结构仍然是一个挑战。抗原与抗体对接是指根据抗原与抗体单独的非结合结构,预测抗原与抗体复合物结构的方法。传统的对接方法依赖于经验评分函数(empirical scoringfunctions)和刚体模拟(rigid body simulations)来预测抗原与抗体的结合姿态。其往往不能有效适应构象灵活性,不能保证预测准确性。


技术实现思路

1、本申请的一个目的是提供一种用于确定抗原抗体对接信息的方法与设备

2、根据本申请的一个方面,提供了一种用于确定抗原抗体对接信息的方法,该方法包括:

3、基于抗原信息与抗体信息,利用深度学习网络,获取相应的抗原抗体对接信息,其中,所述抗原信息包括抗本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于确定抗原抗体对接信息的方法,其中,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述基于抗原信息与抗体信息,利用深度学习网络,获取相应的抗原抗体对接信息包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其中,所述基于抗原信息与抗体信息,通过编码器确定抗原抗体复合物编码信息包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述基于所述抗原嵌入信息与所述抗体嵌入信息,通过编码器确定抗原抗体复合物编码信息包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述抗体嵌入信息包括抗体骨架区信息与抗体互补决定区信息;

6.根据权利要求5所述的方法,...

【技术特征摘要】

1.一种用于确定抗原抗体对接信息的方法,其中,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述基于抗原信息与抗体信息,利用深度学习网络,获取相应的抗原抗体对接信息包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其中,所述基于抗原信息与抗体信息,通过编码器确定抗原抗体复合物编码信息包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述基于所述抗原嵌入信息与所述抗体嵌入信息,通过编码器确定抗原抗体复合物编码信息包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述抗体嵌入信息包括抗体骨架区信息与抗体互补决定区信息;

6.根据权利要求5所述的方法,其中,所述基于所述抗体嵌入信息...

【专利技术属性】
技术研发人员:许锦波谭无为
申请(专利权)人:上海分子之心智能科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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