一种检测水稻TT2基因型的KASP引物组、试剂盒及其应用制造技术

技术编号:42618499 阅读:71 留言:0更新日期:2024-09-03 18:25
本发明专利技术提供了一种检测水稻TT2基因型的KASP引物组、试剂盒及其应用,属于作物遗传育种技术领域。本发明专利技术的引物组包括第一正向引物、第二正向引物和反向引物。本发明专利技术针对水稻耐高温基因TT2的SNP差异位点(位于水稻3号染色体的16733442bp处),设计出特异性引物组进行基因型鉴定,具有操作简便、成本低廉、检测周期短、标记稳定、绿色环保等优点,可精准检测水稻耐高温基因TT2,能够应用于耐高温水稻种质的筛选、鉴定以及应用于基因型辅助改良水稻耐热性,对促进耐高温水稻育种具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及作物遗传育种,尤其涉及一种检测水稻tt2基因型的kasp引物组、试剂盒及其应用。


技术介绍

1、水稻作为全世界最重要的粮食作物之一,全球约有一半的人口以水稻作为主食,而在亚洲以之为主食的人口占比则更大。目前的水稻种植区大部分区域地处高温伏旱区,抽穗开花期常遭遇高温天气,对水稻的结实及产量造成了极大的影响,会造成水稻秕粒率增加、籽粒充实度下降、产量降低、米质变劣,给水稻生产造成严重损失。因此,开展水稻耐高温种质资源的筛选和水稻品种的耐高温性精准鉴定,以推动水稻耐高温性育种进程,保障粮食安全已成为当前水稻研究的一个重要课题。

2、水稻耐高温性是受多种遗传因素和环境共同调控的数量性状。利用耐高温基因连锁分子标记在水稻苗期从dna水平对目标植株进行高温耐性选择,可以弥补传统育种中出现的诸多弊端,是提高耐高温水稻育种效率的有效途径。目前,水稻部分耐高温基因已被克隆且存在功能变异,如tt2(基因编号loc9269602)。tt2编码区存在snp位点,其中16733442bp处存在c/a的变化,引起耐高温性差异。依据该单核苷酸多态性(singl本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测水稻TT2基因型的KASP引物组,其特征在于,所述引物组包括第一正向引物、第二正向引物和反向引物;

2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述引物组针对水稻耐高温基因TT2的SNP位点,所述SNP位点位于水稻3号染色体的16733442bp处,碱基为A或C。

3.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述第一正向引物和第二正向引物采用不同标记物修饰。

4.根据权利要求3所述的引物组,其特征在于,所述标记物为荧光基团或标签序列。

5.根据权利要求4所述的引物组,其特征在于,所述第一正向引物采用FAM标签序列修饰;第二正向引...

【技术特征摘要】

1.一种检测水稻tt2基因型的kasp引物组,其特征在于,所述引物组包括第一正向引物、第二正向引物和反向引物;

2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述引物组针对水稻耐高温基因tt2的snp位点,所述snp位点位于水稻3号染色体的16733442bp处,碱基为a或c。

3.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述第一正向引物和第二正向引物采用不同标记物修饰。

4.根据权利要求3所述的引物组,其特征在于,所述标记物为荧光基团或标签序列。

5.根据权利要求4所述的引物组,其特征在于,所述第一正向引物采用fam标签序列修饰;第二正向引物采用hex标签序列修饰。

6.一种检测水稻tt2基因型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:巫明明傅艺炜张小明吴佳椰露叶胜海翟荣荣朱国富叶靖
申请(专利权)人:浙江省农业科学院
类型:发明
国别省市:

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