系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法技术方案

技术编号:42593403 阅读:31 留言:0更新日期:2024-09-03 18:07
本发明专利技术公开了一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,涉及生物信息技术领域,通过获取待检测样本的重叠DNA序列和检测代谢物质;对重叠DNA序列进行分箱处理;对宏基因组组装基因组进行筛选;对高质量宏基因组组装基因组进行注释和分类;基于高质量宏基因组组装基因组的分类学信息和注释信息构建代谢网络模型;利用代谢网络模型预测高质量宏基因组组装基因组的代谢物质,得到预测代谢物质;根据检测代谢物质和预测代谢物质,确定目标代谢物质;根据预测代谢物质,确定和目标代谢物质合成相关的微生物和子群落,具备广泛适用性和简便易行的特点,整个流程简单可靠,准确度高,易于理解和操作,方便实施。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息,尤其涉及一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法


技术介绍

1、随着计算机计算能力不断增强,代谢网络模型数量与日俱增,从个体水平向群落水平不断发展。

2、现有的特定代谢物质相关微生物和子群落的分析方法,过于繁琐,且准确率较低。


技术实现思路

1、本专利技术的主要目的在于:提供一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,旨在解决现有技术中特定代谢物质相关微生物和子群落的分析方法,过于繁琐,且准确率较低的技术问题。

2、为实现上述目的,本专利技术采用如下技术方案:

3、第一方面,本专利技术提供了一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,获取待检测样本的重叠dna序列和检测代谢物质;

4、对所述重叠dna序列进行分箱处理,得到宏基因组组装基因组;

5、对所述宏基因组组装基因组进行筛选,得到高质量宏基因组组装基因组;

6、对所述高质量宏基因组组装基因组进行注释和分类,得到分类学信息和注释信息;本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述方法包括:

2.如权利要求1所述的系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述获取待检测样本的重叠DNA序列,包括:

3.如权利要求2所述的系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述移出所述测序片段中的读数适配器、污染物和低质量测序片段,得到目标测序片段,包括:

4.如权利要求3所述的系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述对所述测序片段进行修剪和群落结构分析之后,所述方法还包括:

5.如权利要求1所述的...

【技术特征摘要】

1.一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述方法包括:

2.如权利要求1所述的系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述获取待检测样本的重叠dna序列,包括:

3.如权利要求2所述的系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述移出所述测序片段中的读数适配器、污染物和低质量测序片段,得到目标测序片段,包括:

4.如权利要求3所述的系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述对所述测序片段进行修剪和群落结构分析之后,所述方法还包括:

5.如权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员:邹伟陈聪杨凌凌
申请(专利权)人:四川轻化工大学
类型:发明
国别省市:

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