一种端粒相关基因表达预测模型的构建方法及其产品和应用技术

技术编号:42583256 阅读:16 留言:0更新日期:2024-09-03 18:01
本发明专利技术公开了一种端粒相关基因表达预测模型的构建方法及其产品和应用,所述构建方法,包括如下步骤:1、基于胃癌与正常组织基因差异表达,筛选胃癌差异表达基因;2、基于端粒相关基因集,筛选端粒相关差异表达基因;3、基于胃癌患者预后,筛选与胃癌预后关联的端粒相关差异表达基因;4、基于筛选的与胃癌预后关联的端粒相关差异表达基因,采用LASSO‑COX回归算法构建所述端粒相关基因表达预测模型。本发明专利技术通过建立的适用于胃癌患者的预后和药物敏感性模型,提示胃癌患者预后及对潜在治疗药物的敏感性,可以提高治疗的疗效,同时降低物质和实践成本,为临床医生提供更可靠和便捷的决策支持。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种端粒相关基因表达预测模型的构建方法及其产品和应用,属于生信分析。


技术介绍

1、胃癌是一种高度侵袭性的恶性肿瘤,是世界上第五常见、第三致命的癌症(brayf,ferlay j,soerjomataram i,siegel rl,torre la,jemal a(2018)global cancerstatistics 2018:globocan estimates of incidence and mortality worldwide for36cancers in 185countries.ca cancer j clin 68:394-424.doi 10.3322/caac.21492)。胃癌通常起源于胃黏膜的上皮细胞,并且在发展过程中可通过不同的途径扩散到周围组织和淋巴结,甚至远处器官。胃癌的早期症状不明显,这导致了诊断的延迟,大部分患者在晚期才被发现并诊断。因此,胃癌患者通常治愈可能性低,预后差,生存前景有限。这类患者的5年生存率仅为10%-30%。远处转移患者预后明显较差,中位生存期不足10个月。

2、传统的胃癌本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种构建端粒相关基因表达预测模型的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述与胃癌预后关联的端粒相关差异表达基因包括MYOM2、RAD54L、TEAD4、BRIP1、TUBB3、CDC45、CHEK2、FEN1、GEN1、PALM、CAMKV、EZH2、FANCD2、ECT2、PNCK、PDE1B、RAB9B、EPS8L1、RAD51、LRRN1、RPS6KA5、ATP2B3、CLSPN、PDK4、TCEAL7、TFAP2B、SNCG、KLF9、AR、CDC25A、MSH2、CALD1、NFE2L3、PSAT1或GAMT。...

【技术特征摘要】

1.一种构建端粒相关基因表达预测模型的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述与胃癌预后关联的端粒相关差异表达基因包括myom2、rad54l、tead4、brip1、tubb3、cdc45、chek2、fen1、gen1、palm、camkv、ezh2、fancd2、ect2、pnck、pde1b、rab9b、eps8l1、rad51、lrrn1、rps6ka5、atp2b3、clspn、pdk4、tceal7、tfap2b、sncg、klf9、ar、cdc25a、msh2、cald1、nfe2l3、psat1或gamt。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述模型预测所有抗癌药物的敏感性。

4.一种基于权利要求1~3任一项所述端粒相关基因表达预测模型的装置。

5.根据权利要求4所述装置,其特征在于,所述端粒相关基因表达预测模型为sc ore=(0.02940246)*lrrn1+(...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨璐王晓璇
申请(专利权)人:南京林业大学
类型:发明
国别省市:

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