【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于信息处理，更进一步涉及医学电子数据处理中的一种基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法。本专利技术可用于通过识别空间转录组技术，对细胞的类型进行分类。
技术介绍
1、空间转录组技术可以全面测量整个组织切片的总mrna表达情况,并将这些mrna的空间分布信息与组织的形态学特征相融合。在保留细胞空间位置信息的前提下,绘制出各基因在整个组织中的精确表达位置,从而获得复杂生物过程的详尽基因表达图谱。与此同时,空间转录组还能够确定组织中不同类型的细胞群,并保留细胞群在组织中的具体空间位置信息。对空间转录组进行细胞类型识别是能够更全面地了解生物体内细胞的复杂性，为探索组织结构和功能、揭示细胞间相互作用，以及促进疾病研究提供技术支持。
2、到目前为止，空间转录组细胞类型识别方法有基于概率的方法、基于非负矩阵分解的方法和基于深度学习的方法。其中，基于概率的方法使用泊松或负二项分布在似然或贝叶斯框架下对空间转录组学的原始计数进行建模。这些基于概率的方法能够合并各种效应的统计参数化，例如观察到的表达计数的位置特异性移位或过度...
【技术保护点】
1.一种基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，计算待识别细胞类型的空间转录组中细胞类型特异性的基因特征，重建取基因交集后的空间转录组分布，利用高斯核条件生成，从重建后的空间转录组分布中识别细胞类型；该细胞类型识别方法的步骤包括如下：
2.根据权利要求1所述的基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，步骤1中所述单细胞参考集指的是，包含至少6种已知细胞类型，具体为淋巴细胞、吞噬细胞、巨噬细胞、粒细胞、少突胶质细胞和白细胞的测序深度高、基因读数多的单细胞转录组数据。
3.根据权利要求1所述的基于高斯核条件生成...
【技术特征摘要】
1.一种基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，计算待识别细胞类型的空间转录组中细胞类型特异性的基因特征，重建取基因交集后的空间转录组分布，利用高斯核条件生成，从重建后的空间转录组分布中识别细胞类型；该细胞类型识别方法的步骤包括如下：
2.根据权利要求1所述的基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，步骤1中所述单细胞参考集指的是，包含至少6种已知细胞类型，具体为淋巴细胞、吞噬细胞、巨噬细胞、粒细胞、少突胶质细胞和白细胞的测序深度高、基因读数多的单细胞转录组数据。
3.根据权利要求1所述的基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，步骤1中所述基因交集指的是，待识别细胞类型的空间转录组中的所有基因与单细胞参考集的所有基因的交集。
4.根据权利要求1所述的基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，步骤2中所述计算待识别细胞类型的空间转录组中细胞类型特异性的基因特征是由下式得到的：
5.根据权利要求1所述的基于高斯核条件生成的空间转录组细胞类型识别方法，其特征在于，步骤3中所述...
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