一种基于T7核酸外切酶的单链DNA特异高通量测序方法技术

技术编号:42543313 阅读:32 留言:0更新日期:2024-08-27 19:46
本发明专利技术属于生物医药领域,具体涉及一种基于T7核酸外切酶的单链DNA特异高通量测序方法。具体地是,利用T7核酸外切酶富集ssDNA并设计ssDNA特异的建库测序方法。本方法灵敏度高,对纳克(ng)级别的多种生物学DNA样品都能得到良好的ssDNA特异文库和测序数据;适用性广,已经在多种生物学DNA样品(多种细胞的培养基cfDNA、血清cfDNA、血浆cfDNA)中进行了验证,都能良好适用,十分稳定,且偏好性低,体现出良好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物,具体涉及一种基于t7核酸外切酶的单链dna特异高通量测序方法。


技术介绍

1、目前所有报道的单链dna高通量测序方法因为使用了变性处理之后产生的单链dna样品进行建库测序而得名,并非为了区分和检测样品中的单链dna。在建库之前将dna样品进行变性处理,使样品中的dna分子都变为单链dna,这样可以增加样品中单链dna的丰度,从而提高序列产量。但是这都是人为操作带来的,并不能反应样品中真正单链dna的情况。同时,这很大程度上也是由于我们对单链dna的忽视所造成的。

2、由于我们无法区分样品中的单链dna和双链dna,因此也就无法进一步了解它们的差异,如长短大小、碱基分布等情况。但是如果我们想更深入地了解样品中单链dna与双链dna的差异,那么在建库之前将样品dna变性就显得缺乏特异性了。

3、受益于循环肿瘤dna(circulating tumor dna,ctdna)检测与表征的进展,液体活检开始进入临床实践。实际上,ctdna包含单链dna(ctssdna)和双链dna(ctdsdna)。内源单链dna在很大程本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种富集单链核酸分子的方法,所述方法包括使用对双链DNA具有特异性水解活性的核酸外切酶处理的样品;

2.针对单链核酸分子的文库构建方法,所述方法包括在权利要求1所述方法所富集得到的单链核酸分子的两端连接核酸分子后,进行扩增的步骤;

3.如权利要求2所述文库构建方法,所述步骤1)、2)、3)的反应是在相同或各自不同的缓冲液中进行反应;

4.如权利要求2所述文库构建方法,所述加尾也即添加poly(dN)尾;

5.如权利要求2所述文库构建方法,所述5’末端磷酸化试剂包括PNK和/或ATP。

6.如权利要求2所述文库构建方法,所述接...

【技术特征摘要】

1.一种富集单链核酸分子的方法,所述方法包括使用对双链dna具有特异性水解活性的核酸外切酶处理的样品;

2.针对单链核酸分子的文库构建方法,所述方法包括在权利要求1所述方法所富集得到的单链核酸分子的两端连接核酸分子后,进行扩增的步骤;

3.如权利要求2所述文库构建方法,所述步骤1)、2)、3)的反应是在相同或各自不同的缓冲液中进行反应;

4.如权利要求2所述文库构建方法,所述加尾也即添加poly(dn)尾;

5.如权利要求2...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘德培谢龑马兰枝陈厚早
申请(专利权)人:中国医学科学院基础医学研究所
类型:发明
国别省市:

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