一种基于16S rRNA高通量测序技术对热应激环境下鸡肠道微生物的检测方法技术

技术编号:42531421 阅读:65 留言:0更新日期:2024-08-27 19:39
本发明专利技术公开了一种基于16S rRNA高通量测序技术对热应激环境下鸡肠道微生物的检测方法,属于微生物技术领域。将鸡在高温环境下进行饲养,利用16S rRNA高通量测序技术对高温饲养结束后的鸡肠道菌群进行检测,以常温条件饲养的鸡为对照,分析热应激环境下的鸡肠道微生物的变化。本发明专利技术通过对照组和热应激组母鸡育成至产前期盲肠肠道微生物的差异比较分析发现,热应激状态下,盲肠肠道菌群减少1个属,1019个ASVs细菌阶元。热应激后肠道微生物中的拟杆菌属丰度增加、理研菌科RC9肠道菌属丰度降低,考拉杆菌属丰度差异显著。热应激后肠道次生代谢的生物合同通路和感染疾病通路因子丰度明显降低。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及微生物,特别是涉及一种基于16s rrna高通量测序技术对热应激环境下鸡肠道微生物的检测方法。


技术介绍

1、禽类可以提供丰富的蛋类和肉类食品,是人类蛋白质的主要来源,对其生产力限制的主要因素之一是热应激。家禽饲养的最佳温度为18~22℃,一般来说,家禽热应激类型有:急性在27~38℃环境下持续1~24h;中度在27~38℃环境下最多持续7天;慢性或重度在38~50℃环境下持续7天或更长时间。任何偏离这些范围的情况,特别是在较高的临界温度下,都会引发家禽的热应激反应。热应激通常是指机体在热环境中出现的一系列非特异性全身反应,如明显的适应不良、生理疲劳等。热应激是影响农场动物,特别是家禽的生长过程和相关生产性能的最有害的环境挑战之一。家禽在受到热应激刺激时,迅速产生全身高温炎症反应,导致家禽生长发育迟缓,繁殖性能减弱,产蛋量和肉质下降,严重时可导致家禽死亡。因此,热应激给全球家禽业造成了巨大的经济损失。据美国农业部估计,美国畜牧业每年因热应激造成的损失高达24亿美元,其中有1.28~1.65亿美元来自家禽业。根据东非气候变化,持续增长的热应激会本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于16S rRNA高通量测序技术对热应激环境下鸡肠道微生物的检测方法,将鸡在高温环境下进行饲养,利用16S rRNA高通量测序技术对高温饲养结束后的鸡肠道菌群进行检测,以常温条件饲养的鸡为对照,分析热应激环境下的鸡肠道微生物的变化。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述将鸡在高温环境下进行饲养具体为:第0~3天温度为35℃,第4~7天温度为33℃,第8~14天温度为32℃,第15~21天温度为29℃,第22~28天温度为26℃,第29~35天温度为23℃,第36~120天温度为30℃。

3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述常温...

【技术特征摘要】

1.一种基于16s rrna高通量测序技术对热应激环境下鸡肠道微生物的检测方法,将鸡在高温环境下进行饲养,利用16s rrna高通量测序技术对高温饲养结束后的鸡肠道菌群进行检测,以常温条件饲养的鸡为对照,分析热应激环境下的鸡肠道微生物的变化。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述将鸡在高温环境下进行饲养具体为:第0~3天温度为35℃,第4~7天温度为33℃,第8~14天温度为32℃,第15~21天温度为29℃,第22~28天温度为26℃,第29~35天温度为23℃,第36~120天温度为30℃。

3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述常温条件饲养具体为:第0~3天温度为35℃,第4~7天温度为33℃,第8~14天温度为32℃,第15~21天温度为29℃,第22~28天温度为26℃,第29~35天温度为23℃,第36~120天温度为21℃。

4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述鸡肠道菌群为盲肠肠道菌群。

5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述利用16s rrna高通量测序技术对高温饲养结束后的鸡肠道菌群进行检测具体为:基于大肠杆菌16s rrna v3-v4区片段,设计并合成具有barcode的特异性扩增引物,对鸡肠道菌群总dna进行16s rdna v3-v4区特异性片段扩增,确定扩增产物的大小和浓度,再使用abi steponeplus real-time pcrsystem进行rna...

【专利技术属性】
技术研发人员:李春苗赵振华黄华云王钱保黄正洋吴兆林孔令琳刘宏祥
申请(专利权)人:江苏省家禽科学研究所
类型:发明
国别省市:

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