Sanger测序数据分析方法、装置、设备及存储介质制造方法及图纸

技术编号:42453923 阅读:44 留言:0更新日期:2024-08-21 12:45
本发明专利技术属于基因测序技术领域,公开了一种Sanger测序数据分析方法、装置、设备及存储介质,读取Sanger测序数据,获得若干测序数据集;根据剪切规则确定每个测序数据集的剪切位点,获得修剪位置信息;根据所述修剪位置信息对所述测序数据集进行截取,获得各个所述测序数据集对应的剪切序列;对所述剪切序列进行质量控制,获得若干筛选后序列;基于子序列的一致性对所述筛选后序列进行防污染核查,获得核查结果;根据所述核查结果组装所述筛选后序列,获得组装后基因序列。能够自动选择最合适的剪切位点,有效避免了误判剪切问题,并引入自动化质控机制和污染分析方法,确保了数据的准确性,提高分析效率,降低误差。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因测序,具体涉及一种sanger测序数据分析方法、装置、设备及存储介质。


技术介绍

1、sanger测序技术(第一代dna测序技术)的高准确性使其在短片段或低复杂度基因组区域的测序中表现出色,且其简便的工作流程、易操作性和较低的成本使其在特定领域的研究中独具优势,依然在小规模项目、验证突变和特定应用场景中广泛应用。

2、然而,sanger测序数据的分析依赖于厂家或第三方软件,如sequencher、hbv/hcy生信分析工具和chromas等,这些软件存在剪切误判,也无法在质量核查和防污染处理过程中进行干预,结果不够准确。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种sanger测序数据分析方法、装置、设备及存储介质,解决现有sanger测序数据分析时结果不够准确的问题。

2、本专利技术第一方面公开一种sanger测序数据分析方法,包括:

3、读取sanger测序数据,获得若干测序数据集;

4、根据剪切规则确定每个测序数据集的剪切位点,获得修剪本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种Sanger测序数据分析方法,其特征在于,包括:

2.如权利要求1所述的Sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述根据剪切规则确定每个测序数据集的剪切位点,获得修剪位置信息,包括:

3.如权利要求2所述的Sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述基于每个所述测序数据集的峰值,获得真正信号的位置,包括:

4.如权利要求2所述的Sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述基于目标碱基序列中5'端和3'端的峰值信息,根据剪切规则确定剪切位点,所有的所述剪切位点构成所述修剪位置信息,包括:

5.如权利要求1所述的Sanger测序数...

【技术特征摘要】

1.一种sanger测序数据分析方法,其特征在于,包括:

2.如权利要求1所述的sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述根据剪切规则确定每个测序数据集的剪切位点,获得修剪位置信息,包括:

3.如权利要求2所述的sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述基于每个所述测序数据集的峰值,获得真正信号的位置,包括:

4.如权利要求2所述的sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述基于目标碱基序列中5'端和3'端的峰值信息,根据剪切规则确定剪切位点,所有的所述剪切位点构成所述修剪位置信息,包括:

5.如权利要求1所述的sanger测序数据分析方法,其特征在于,所述对所述剪切序列进行质量控制,获得若干筛选后序列,包括:

6.如权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员:杜梓鑫金文祥何睿熙曾征宇张磊郭晓磊吴俊斌刘菲菲刘勇
申请(专利权)人:广州金域医学检验中心有限公司
类型:发明
国别省市:

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