黄麻根系总蛋白双向电泳方法技术

技术编号:4243543 阅读:350 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及一种黄麻的总蛋白质双向电泳方法,属于生物技术领域。是针对能够生存在沿海滩涂的黄麻根系总蛋白采用双向电泳技术进行分离,采用本技术方案对生长在沿海滩涂地的黄麻根系进行实验取得了很好的效果。目前,经过反复实验证明,采用双向电泳方法对其进行分离,分离得到蛋白点多,经PDQuest软件检测,蛋白点多于1100个,图谱清晰,无横纵纹现象,蛋白点圆,重复性好,是一套适用于黄麻根系总蛋白组分析的双向电泳方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种黄麻的根系总蛋白双向电泳方法,属于生物
是能够在沿海滩涂大面积生长的黄麻根系的蛋白质组分离,该方法可直接应用于能够在沿海滩涂生 存的高耐盐植物研究开发利用。
技术介绍
抗逆性是植物在系统进化过程中,为适应不良环境获得的一种对策。在植物的生 存环境中一些非生物因子胁迫,对植物的生长发育和生存都会产生严重的影响,为了应对 外界环境的不利影响,植物在进化过程中形成了完整的防御机制。为了解析其防御机制就 势必需要分离一些与逆境相关的蛋白质。 黄麻(0rchorus olitorius L.)又称络麻、绿麻,是一种能在沿海滩涂地大面积 生长的一年生草本韧皮纤维经济作物,在沿海滩涂开发热的今天可作为滩涂改良的先锋作 物。由于其能够耐受沿海滩涂高盐胁迫,因此成了耐盐性研究中的一种优秀的指示植物材 料。 但由于其植物体内含有盐渍化条件下产生的多种次生代谢物(色素、酚类、醌类等),众多干扰使得作为蛋白质组研究的核心技术_双向电泳成为挑战,常规方法不能成功制备纯度高的蛋白,在电泳过程中,合理的参数设定可有效的除盐,聚焦等。以黄麻植物根系为材料,进行根系总蛋白的制备,建立适用于黄麻根系蛋白质组学分离的双向电泳方法,可为盐渍化环境下植物材料耐盐性蛋白质组学研究提供实验基础和参考。 本专利技术的突破点就是建立盐渍化环境下的高耐盐植物黄麻的双向电泳方法体系,利用该方法可对黄麻进行蛋白质组学研究分析。
技术实现思路
技术问题 本专利技术目的在于提供一种黄麻根系的总蛋白分离的双向电泳方法,是针对能够生存在沿海滩涂的植物黄麻的根系总蛋白采用双向电泳方法进行分离,该技术经反复实验证明样品制备全、分离蛋白点多、重复性好、图谱清晰,是一套适用于黄麻根系总蛋白组分析的双向电泳技术。 技术方案 本专利技术所述的一种黄麻根系的总蛋白双向电泳方法,按下列步骤进行 1)采集黄麻根系,超纯水清洗干净,用液氮罐装运回,在实验室-7(TC以下保存备 用; 2)将2g黄麻根系迅速放入冰浴的研钵中加入液氮研磨,研磨过程中加入0. 2g聚 乙烯吡咯烷酮,直到研磨成细粉,转入预冷-2(TC的50ml离心管; 3)加入3倍体积-2(TC预冷的三氯乙酸提取液,充分混合后,放在-2(TC 1.5h,三 氯乙酸提取液配制质量体积比10X三氯乙酸TCA,质量体积比0. 07X二硫苏糖醇DTT, lmM苯甲基磺酰氟PMSF,溶剂为丙酮; 4)35000g,4t:离心15min,取沉淀,加入25ml预冷的样品洗涤液,充分混合后,放 在-20°C lh,期间间隔涡旋;样品洗涤液配制质量体积比0. 07% DTT, lmM PMSF,溶剂为丙 酮; 5)20000g,4t:离心15min,取沉淀,加入25ml预冷的样品洗涤液,充分混合后,放 在-2(TC lh,期间间隔涡旋; 6)重复步骤5)—次; 7)20000g,4。C离心15min,去掉上清后,用滤纸封口 ,真空干燥; 8)将粗蛋白溶于裂解液,室温1. 5h ;裂解液配制7M尿素、2M硫脲、质量体积比 4% 3--l-丙磺酸CHAPS、65mM DTT、lmM PMSF、体积比 0.2%载体两性电解质; 9)离心,得到上清液用3倍体积预冷的样品洗涤液-2(TC沉淀0. 5h后再20000g、 4t:、15min离心,弃上清液; 10)沉淀再次溶解于步骤8)中的500 iU裂解液,充分溶解后,离心,取上清; 11)蛋白质定量采用Bradford法测定其蛋白浓度; 12)第一向等电聚焦电泳按上样量350iig,上样体积330ia,对已定量好的蛋白 样品进行稀释,上样水化液同步骤8)中的裂解液,将样品加入固相pH梯度IPG胶条聚焦 盘内后,再将PH 4-7, 17cm的IPG胶条胶面向下放入盘中,除去胶面与样品液间的气泡,用 2. 5ml矿物油/条,覆盖胶条,进行等电聚焦; 13)胶条平衡将聚焦好后的固相pH梯度IPG胶条进行平衡I、 II,每次平衡时间 为20min,平衡缓冲液配制如下 胶条平衡缓冲液母液6M尿素,质量体积比2%十二烷基磺酸钠SDS,O. 375MpH8. 8 的Tris-HCl,体积比20%甘油,溶剂为水。 胶条平衡缓冲液I :每10ml胶条平衡缓冲液母液加入0. 2g DTT ; 胶条平衡缓冲液II :每10ml胶条平衡缓冲液母液加入0. 25g碘乙酰胺; 14)第二向SDS-PAGE电泳将平衡好的胶条置于胶浓度为质量体积比12 %的SDS-PAGE胶上,用质量体积比0. 5%、含有质量体积比0. 002%溴酚蓝的低熔点琼脂糖封胶液封住顶部,按如下参数进行电泳16t:恒温下,恒功率,先用1瓦/条,1. 5h ;再用15瓦/条,4 6h ; 15)染色方法采用硝酸银法进行染色。 整个过程的溶液配制均需用超纯水。 整个过程的裂解液与上样水化液均需现用现配。 整个过程所需的DTT均需现用现加。 步骤12)中的等电聚焦参数设置如下50V水化,13h ;250V慢速,lh ;500V慢速, lh ;2000V线性,lh ;8000V线性,4h ;8000V快速,60000V. h ;500V快速,保持。 步骤14)中胶浓度质量体积比12 %的SDS PAGE凝胶所用的溶液体积比 含量为,水质量体积比30%丙烯酰胺0. 375M pH8. 8的Tris-HCl :质量体积比10%十二烷基硫酸钠质量体积比10%过硫酸铵体积比10%四甲基乙二胺= 33 : 40 : 25 : i : i : o. 15。 步骤14)电极缓冲液配制如下按质量体积比0. 1 %十二烷基硫酸钠,0. 025mol/L 三羟甲基氨基甲烷和0. 192mol/L甘氨酸进行配制,溶剂为水,并调制pH值为8. 3。 步骤15)中的染色方法程序如下 步骤1 :取50ml冰乙酸、200ml无水乙醇、加水至500ml固定,1. 5h ; 步骤2 :取lg硫代硫酸钠,56. 36g三水合乙酸钠,150ml无水乙醇,加水至500ml敏化,30min ; 步骤3 :500ml水漂洗三遍,5min/次; 步骤4 :1. 25g硝酸银溶于500ml水,避光银染,20min ; 步骤5 :500ml水漂洗二遍,lmin/次; 步骤6 :12. 5g碳酸钠,0. 2ml甲醛,加水至500ml,显色共2次;第一次待溶液变黄后倒掉,第二次显色到理想的背景和清晰度; 步骤7 :7. 3g Na2EDTA溶于500ml水终止,10min。 有益效果 本专利技术针对黄麻体内含有盐渍化条件下产生的多种次生代谢物(色素、酚类、醌 类等),众多干扰使得作为蛋白质组研究的核心技术_双向电泳成为挑战,首次建立了一套 适合黄麻根系蛋白质组学研究的双向电泳方法。 本套方法首次将黄麻根系总蛋白样品进行制备,采用双向电泳方法对其进行分 离,分离得到蛋白点多,经PDQuest软件检测,蛋白点多于IIOO个,图谱清晰,无横纵纹现 象,蛋白点圆,重复性好。可在黄麻根系蛋白组学中直接运用。附图说明 下面结合附图和实施例对本专利技术进一步说明。 图1黄麻室内水培根系总蛋白双向电泳图谱。 1为乙醇脱氢酶2为黄酮醇合成酶;3为RBAP2蛋白。 图2沿海滩涂生长的黄麻根系总蛋白本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种黄麻根系总蛋白双向电泳方法,其特征在于按下列步骤进行:1)采集黄麻根系,超纯水清洗干净,用液氮罐装运回,在实验室-70℃以下保存备用;2)将2g黄麻根系迅速放入冰浴的研钵中加入液氮研磨,研磨过程中加入0.2g聚乙烯吡咯烷酮,直到研磨成细粉,转入预冷-20℃的50ml离心管;3)加入3倍体积-20℃预冷的三氯乙酸提取液,充分混合后,放在-20℃1.5h,三氯乙酸提取液配制:质量体积比10%三氯乙酸TCA,质量体积比0.07%二硫苏糖醇DTT,1mM苯甲基磺酰氟PMSF,溶剂为丙酮;4)35000g,4℃离心15min,取沉淀,加入25ml预冷的样品洗涤液,充分混合后,放在-20℃1h,期间间隔涡旋;样品洗涤液配制:质量体积比0.07%DTT,1mMPMSF,溶剂为丙酮;5)20000g,4℃离心15min,取沉淀,加入25ml预冷的样品洗涤液,充分混合后,放在-20℃1h,期间间隔涡旋;6)重复步骤5)一次;7)20000g,4℃离心15min,去掉上清后,用滤纸封口,真空干燥;8)将粗蛋白溶于裂解液,室温1.5h;裂解液配制:7M尿素、2M硫脲、质量体积比4%3-[(3-胆固醇氨丙基)二甲基氨基]-1-丙磺酸CHAPS、65mMDTT、1mMPMSF、体积比0.2%载体两性电解质;9)离心,得到上清液用3倍体积预冷的样品洗涤液-20℃沉淀0.5h后再20000g、4℃、15min离心,弃上清液;10)沉淀再次溶解于步骤8)中的500μl裂解液,充分溶解后,离心,取上清;11)蛋白质定量:采用Bradford法测定其蛋白浓度;12)第一向等电聚焦电泳:按上样量350μg,上样体积330μl,对已定量好的蛋白样品进行稀释,上样水化液同步骤8)中的裂解液,将样品加入固相pH梯度IPG胶条聚焦盘内后,再将pH4-7,17cm的IPG胶条胶面向下放入盘中,除去胶面与样品液间的气泡,用2.5ml矿物油/条,覆盖胶条,进行等电聚焦;13)胶条平衡:将聚焦好后的固相pH梯度IPG胶条进行平衡Ⅰ、Ⅱ,每次平衡时间为20min,平衡缓冲液配制如下:胶条平衡缓冲液母液:6M尿素,质量体积比2%十二烷基磺酸钠SDS,0.375MpH8.8的Tris-HCl,体积比20%甘油,溶剂为水。胶条平衡缓冲液Ⅰ:每10ml胶条平衡缓冲液母液加入0.2gDTT;胶条平衡缓冲液Ⅱ:每10ml胶条平衡缓冲液母液加入0.25g碘乙酰胺;14)第二向...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:麻浩马洪雨王显生何小玲
申请(专利权)人:南京农业大学
类型:发明
国别省市:84[中国|南京]

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