一种用于湖羊肌内脂肪性状选育的单倍型分子标记制造技术

本发明专利技术公开了一种用于湖羊肌内脂肪性状选育的单倍型分子标记。利用湖羊基因组重测序结果，通过全基因组关联分析和全基因组选择性清除信号计算两种方法，对湖羊全基因组单核苷酸多态性进行分析，发现不同IMF含量湖羊在第10号染色体候选基因组区域内的SNPs之间存在极强的连锁不平衡，且候选基因组区域内存在与湖羊IMF含量显著相关的单倍型。本发明专利技术为湖羊IMF性状的选育提供了依据，可以通过鉴定候选基因组区域的单倍型分子标记在DNA水平上对湖羊的IMF性状进行标记辅助选择，有助于在适当范围内提高湖羊IMF含量。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及湖羊育种中的标记辅助选择，具体涉及在dna水平上检测与湖羊肌内脂肪性状密切相关的snps，以及利用目标单倍型对湖羊个体进行鉴别与选留。

技术介绍

1、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp)是同一物种不同个体基因组dna的等位序列上单个核苷酸存在差别的现象。snp是生物体基因组中存在最为广泛的一类变异，它是由于单个核苷酸的插入、缺失、转换和颠换而引起的。单倍型(haplotype)是指在染色体上一段特定的dna序列，通常由多个邻近的snps组成，这些snp位点在同一个染色体上相互连锁，以一种特定的模式传递给后代。特定的单倍型可能与性状的表现有关，通过分析单倍型与表型之间的关联，可以揭示不同单倍型或其组合对于特定性状的影响。并且与通过全基因组关联分析确定的snp位点相比，单倍型可以规避单个位点与性状相关性的假阳性分析结果，从而更具选择的价值和优势。

2、肌内脂肪(intramuscular fat,imf)含量与羊肉的风味、多汁性和嫩度等密切相关，是羊肉品质评估中的一个关键指标，也是消费本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种肌内脂肪性状选育用单倍型分子标记的检测方法，其特征在于：该检测方法包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述一种肌内脂肪性状选育用单倍型分子标记的检测方法，其特征在于：所述多个SNP位点具体为绵羊参考基因组第10号染色体的第28171391位、第28171414位、第28171980位、第28172213位、第28172475位、第28172501位、第28173738位和第28173822位。

3.根据权利要求2所述一种肌内脂肪性状选育用单倍型分子标记的检测方法，其特征在于：所述单倍型选自Hap1、Hap2、Hap3中的一种或两种；其中Hap1的序列为CTA...

【技术特征摘要】

1.一种肌内脂肪性状选育用单倍型分子标记的检测方法，其特征在于：该检测方法包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述一种肌内脂肪性状选育用单倍型分子标记的检测方法，其特征在于：所述多个snp位点具体为绵羊参考基因组第10号染色体的第28171391位、第28171414位、第28171980位、第28172213位、第28172475位、第28172501位、第28173738位和第28173822位。

3.根据权利要求2所述一种肌内脂肪性状选育用单倍型分子标记的检测方法，其特征在于：所述单倍型选自hap1、hap2、hap3中的一种或两种；其中hap1的序列为ctagtccc，是依次由所述第28171391位、第28171414位、第28171980位、第28172213位、第28172475位、第28172501位、第28173738位和第28173822位的参考碱基构成，hap2的序列为tcgaattt，是依次由所述第28171391位、第28171414位、第28171980位、第28172213位、第28172475位、第28172501位、第28173738位和第28173822位的突变碱基构成，hap3的序列为ctgaattt，是依次由所述第28171391位和第28171414位的参考碱基、第28171980位、第28172213位、第28172475位、第28172501位、第28173738位和第28173822位的突变碱基构成。

4.根据权利...

【专利技术属性】
技术研发人员：乐样鹏，王钟毓，张雪莹，秦芳，
申请(专利权)人：兰州大学，
类型：发明
国别省市：