【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本公开涉及用于对熔解曲线进行基因型分型的方法，特别地涉及用于自动地对熔解曲线进行聚类以改善熔解曲线的基因型分型的方法。
技术介绍
1、聚合酶链式反应(pcr)已成为生物医学研究、疾病监测和诊断中普遍存在的工具。熔解曲线分析同样已成为通常在pcr之后执行的用于识别dna基因型的常用工具。熔解曲线分析对双链dna在加热期间的解离特征进行评定。特别地，与双链dna结合的荧光染料通常随着温度增加而失去荧光，并且表现出与dna的有效解离一致的荧光减少。因为不同的基因型在不同的温度处解离，所以不同的基因型因此具有带有不同轮廓的熔解曲线。这种有效解离在其处发生的温度通常通过识别在熔解曲线的负一阶导数中形成的峰来查明。因此，具有相似特征(诸如峰)的负一阶导数可指示曲线属于相同的基因型。因此，对熔解曲线(以及特别地其负一阶导数)的分析可用于通过将相似的曲线分组在一起来对测定进行基因型分型。
2、虽然存在用于基于熔解曲线分析来进行此类基因型分型的方法，但先前的方法具有局限性。例如，当对各种各样的基因型(包括带有大量基因型的测定和/或其中熔解曲线...
【技术保护点】
1.一种用于对包括在温度范围内的荧光测量结果的多条熔解曲线进行基因型分型的自动化方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中通过执行k-均值聚类来编译所述初始聚类矩阵。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述初始聚类矩阵的每一行包括：
4.根据权利要求2所述的方法，其中基于初始聚类的输入数量来执行所述k-均值聚类。
5.根据权利要求1所述的方法，其中对所述初始聚类矩阵进行过滤包括：从所述初始聚类矩阵去除重复行。
6.根据权利要求5所述的方法，其中对所述初始聚类矩阵进行过滤进一步包括：将含有共同的经...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于对包括在温度范围内的荧光测量结果的多条熔解曲线进行基因型分型的自动化方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中通过执行k-均值聚类来编译所述初始聚类矩阵。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述初始聚类矩阵的每一行包括：
4.根据权利要求2所述的方法，其中基于初始聚类的输入数量来执行所述k-均值聚类。
5.根据权利要求1所述的方法，其中对所述初始聚类矩阵进行过滤包括：从所述初始聚类矩阵去除重复行。
6.根据权利要求5所述的方法，其中对所述初始聚类矩阵进行过滤进一步包括：将含有共同的经处理的熔解曲线的相交聚类相组合。
7.根据权利要求6所述的方法，其中将相交聚类相组合包括以下步骤：
8.根据权利要求5所述的方法，其中对所述初始聚类矩阵进行过滤进一步包括：识别带有重复的经处理的熔解曲线的聚类，并且去除所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：R·柯尼克，
申请(专利权)人：豪夫迈·罗氏有限公司，
类型：发明
国别省市：
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