一种有机分子虚拟筛选库构建方法、装置、设备及介质制造方法及图纸

技术编号:42223622 阅读:25 留言:0更新日期:2024-08-02 13:42
本申请公开了一种有机分子虚拟筛选库构建方法、装置、设备及介质,涉及虚拟数据库构建技术领域,解决了现有虚拟筛选库对新分子的发现效率较低的技术问题。所述方法包括:获取并基于SMILES已知分子片段集,将分子片段中的活性位点采用R占位符进行标记,生成多个带有R标记的分子片段mol文件;再生成多个基团的SMILES字符串和多个待组装骨架;将各基团的SMILES字符串、各待组装骨架以及预设接入位点数量输入并发执行器中进行组装遍历循环,获得第一组合分子集;基于InChI标识符和第一组合分子的化学相似性指标,筛选获得第二组合分子,并构建获得有机分子虚拟筛选库。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及虚拟数据库构建,尤其涉及一种有机分子虚拟筛选库构建方法、装置、设备及介质


技术介绍

1、在材料和药物领域中,计算机辅助虚拟筛选是一种常用的新化合物设计方法。虚拟筛选根据预先设定的条件,通过不同的计算方法和模型预测分子性质,从大量被筛选分子中挑选出满足性能需求的候选分子。其中被筛选分子的集合被称为虚拟筛选库,它是进行虚拟筛选的基础。为了能够寻找出拥有特定性质或活性的候选分子,按需构建对应的虚拟筛选库是整个过程的重点。通常,虚拟筛选库的构建使用分子对接方法,它能够组装出可能满足性能需求的一系列候选分子。

2、但现有有机分子虚拟筛选库在构建时,通常是基于模板来选择功能单元并定制组装策略的,从而造成现有有机虚拟筛选库在对有机分子进行筛选组装时,对新分子的发现效率较低且开发周期较长。


技术实现思路

1、本申请提供了一种有机分子虚拟筛选库构建方法、装置、设备及介质,至少解决了现有虚拟筛选库对新分子的发现效率较低且开发周期较长的技术问题。

2、为解决上述技术问题,本申请实施例提供了:一种本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述基于所述SMILES已知分子片段集中各SMILES格式的分子片段,将分子片段中的活性位点采用R占位符进行标记,生成多个带有R标记的分子片段mol文件的步骤,包括:

3.根据权利要求2所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述将所述mol文件格式的分子片段中的活性位点采用R占位符进行标记,生成多个带有R标记的分子片段mol文件的步骤,包括:

4.根据权利要求1所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述基于各所述基团...

【技术特征摘要】

1.一种有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述基于所述smiles已知分子片段集中各smiles格式的分子片段,将分子片段中的活性位点采用r占位符进行标记,生成多个带有r标记的分子片段mol文件的步骤,包括:

3.根据权利要求2所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述将所述mol文件格式的分子片段中的活性位点采用r占位符进行标记,生成多个带有r标记的分子片段mol文件的步骤,包括:

4.根据权利要求1所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述基于各所述基团分子片段,生成多个基团的smiles字符串的步骤,包括:

5.根据权利要求1所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述将各所述骨架分子片段中除r标记位点以外的所有位点进行加氢保护,获得多个待组装骨架的步骤,包括:

6.根据权利要求1所述有机分子虚拟筛选库构建方法,其特征在于,所述将各所述基团的smiles字符串、各所述待组装骨架以及预设接入位点数量输入并发执行器中进行组装遍历循环,获得组装遍历循环的第一组合分子集的步骤,包括:

【专利技术属性】
技术研发人员:杨春明黄超逸贺英杰周扬帆张晖
申请(专利权)人:西南科技大学
类型:发明
国别省市:

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