一种基于多尺度基因图谱的PD的动态演化预测建模方法技术

技术编号:42222449 阅读:34 留言:0更新日期:2024-08-02 13:41
本发明专利技术公开了一种基于多尺度基因图谱的PD的动态演化预测建模方法。该方法首先将前T个时间点的病人的表达信息作为初始数据集;然后采用多尺度嵌入式基因共表达网络分析算法对基因进行共表达网络的计算,并将基因划分至不同的基因模块中;接着将全局的基因网络和局部基因模块网络进行多尺度融合,得到一个富含更多信息量的融合网络;将前T个时刻的融合基因网络和表达矩阵作为输入,利用时间卷积算法对动态图节点特征的时间维度进行提取,利用多头图自注意力算法搭配门控循环单元对图进行空间维度特征的提取,最后预测T+1时刻的帕金森病人疾病阶段。本发明专利技术有效利用了帕金森疾病多个时刻的数据信息,有效提高模型的精度和准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息学中的动态演化建模领域,尤其涉及一种基于多尺度基因图谱的帕金森疾病(parkinson’s disease—pd)的动态演化预测建模方法。


技术介绍

1、帕金森疾病是一种慢性进行性神经系统障碍,主要影响运动控制。随着人口老龄化的加剧,帕金森疾病的发病率逐渐上升,成为全球范围内备受关注的健康问题。传统的研究方法主要依赖于临床观察或者是单一尺度下的影像学检查,这些方法在早期诊断和预测疾病进展方面存在一定的局限性。这一方面临床诊断往往只能提供对疾病的表面症状和临床特征的描述,无法深入了解帕金森疾病的生物学机制和基础。对于研究人员而言,了解疾病的分子机制和相关基因的功能可能更有助于发现潜在的治疗目标和药物开发。另一方面,单一尺度的图谱数据难以提供关于疾病机制和功能连接的完整信息。疾病涉及到多种生物学和神经系统层面的变化,如基因表达、蛋白质互作、代谢物水平、神经连接等。单一尺度的数据可能无法揭示这些复杂的机制和连接。

2、动态演化建模可为个体化医疗提供支持。通过对个体疾病演化过程的建模,可以更好地了解疾病在不同患者之间的变化和异质性本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于多尺度基因图谱的PD的动态演化预测建模方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于多尺度基因图谱的PD的动态演化预测建模方法,其特征在于,步骤S1中的基因表达矩阵的数据种类具体包括但不限于:

3.根据权利要求1所述的一种基于多尺度基因图谱的PD的动态演化预测建模方法,其特征在于,步骤S1中的多尺度嵌入式基因共表达网络分析算法的基本步骤包括:

4.根据权利要求3所述的一种基于多尺度基因图谱的PD的动态演化预测建模方法,其特征在于,所述步骤S11中具体计算方法的步骤为:

5.根据权利要求3所述的一种基于多尺度基...

【技术特征摘要】

1.一种基于多尺度基因图谱的pd的动态演化预测建模方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于多尺度基因图谱的pd的动态演化预测建模方法,其特征在于,步骤s1中的基因表达矩阵的数据种类具体包括但不限于:

3.根据权利要求1所述的一种基于多尺度基因图谱的pd的动态演化预测建模方法,其特征在于,步骤s1中的多尺度嵌入式基因共表达网络分析算法的基本步骤包括:

4.根据权利要求3所述的一种基于多尺度基因图谱的pd的动态演化预测建模方法,其特征在于,所述步骤s11中具体计算方法的步骤为:

5.根据权利要求3所述的一种基于多尺度基因图谱的pd的动态演化预测建模方法,其特征在于,所述步骤s12中,计算方法的步骤为:

6.根据权利要求1所述的一种基于多尺度基因图谱的pd的动态演化预测建模方法,其特征在于,所述步骤s2中,具...

【专利技术属性】
技术研发人员:许泽棋张蔚叶钧杰
申请(专利权)人:浙江理工大学
类型:发明
国别省市:

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