水稻冠根数目相关的分子标记及其应用制造技术

本说明书实施例公开了水稻冠根数目相关的分子标记及其应用，所述分子标记位于水稻第1号染色体上，所述分子标记包括：分子标记SNP_1_36816059_A/C、分子标记SNP_1_36817315_G/C、分子标记SNP_1_36817701_T/C、分子标记SNP_1_36818252_T/C、分子标记INDEL_1_36817566_T/TAGCTCATGTAGATACCCTGAAACATGATACGCTA，通过分子标记及检测引物对，检测水稻冠根调控基因OsQHB的基因型。

【技术实现步骤摘要】

本说明书涉及作物遗传育种及分子标记，尤其涉及一种水稻冠根数目相关的分子标记及其应用。

技术介绍

1、根系作为植物吸收水分和养分的重要器官，对植物的生长发育起决定性的作用。根系生长发育的可塑性有利于植物在各种逆境下获取更多的水分和养分，是植物适应不同生长环境尤其是逆境的重要手段。因此，根系生长发育的可塑性既是作物在有利条件下高产的基础，也是作物在逆境条件下存活和稳产的重要保障。

2、以水稻为代表的单子叶植物的根系主要由初生根、冠根和侧根所组成。水稻初生根在苗期停止生长，其后的各个生长发育时期主要由冠根来行使水分和营养吸收以及植株的固着作用。冠根的发育受到多种植物激素及转录因子的调控，例如，wuschel-relatedhomeobox(wox)家族编码的转录因子在植物中是特有的，且在植物发育中发挥着不同的作用，例如胚胎发生、维管分化、侧器官发生以及根尖分生组织的维持等；osqhb（静止中心特异的同源异型框基因(quiescent-center-specific homeobox gene, qhb)）是atwox5的同源基因，在根尖分生组织中特异本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种水稻冠根数目相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记位于水稻第1号染色体上，所述分子标记包括：分子标记SNP_1_36816059_A/C、分子标记SNP_1_36817315_G/C、分子标记SNP_1_36817701_T/C、分子标记SNP_1_36818252_T/C、分子标记INDEL_1_36817566_T/TAGCTCATGTAGATACCCTGAAACATGATACGCTA。

2.如权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述分子标记SNP_1_36816059_A/C位于水稻第1号染色体上的第36816059bp处，单核苷酸多态位点为存在核苷酸单碱基...

【技术特征摘要】

1.一种水稻冠根数目相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记位于水稻第1号染色体上，所述分子标记包括：分子标记snp_1_36816059_a/c、分子标记snp_1_36817315_g/c、分子标记snp_1_36817701_t/c、分子标记snp_1_36818252_t/c、分子标记indel_1_36817566_t/tagctcatgtagataccctgaaacatgatacgcta。

2.如权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述分子标记snp_1_36816059_a/c位于水稻第1号染色体上的第36816059bp处，单核苷酸多态位点为存在核苷酸单碱基突变a/c；

3.一种水稻冠根数目相关的分子标记的检测方法，其特征在于，所述检测方法用于检测如权利要求1所述的分子标记，所述分子标记snp_1_36816059_a/c的检测引物对为第一检测引物对，所述第一检测引物对包括上游通用引物c1f和特异下游引物fam1r、hex1r，所述第一检测引物对如序列表seq id no：1-3所示；

4.如权利要求3所述的检测方法，其特征在于，所述分子标记snp_1_36816059_a/c、所述分子标记snp_1_36817315_g/c、所述分子标记snp_1_36817701_t/c及所述分子标记snp_1_36818252_t/c检测方...

【专利技术属性】
技术研发人员：秦华，李宇翔，葛秉坤，索志恒，王娟，权瑞党，黄荣峰，
申请(专利权)人：中国农业科学院生物技术研究所，
类型：发明
国别省市：