用于SMN基因扩增、拷贝数检测的引物组及方法技术

本发明专利技术公开了用于SMN基因扩增、拷贝数检测的引物组及方法，引物组包括上游引物和下游引物，上游引物和下游引物中的一条为扩增‑阻滞引物，扩增‑阻滞引物包括第一部分和第二部分，第一部分为扩增部分，与靶标基因互补结合后引导碱基合成，其3’端碱基有修饰，无法合成碱基，引发模板扩增；第二部分为与阻滞引物可形成退火互补的序列，其长度短于第一部分，第一部分和第二部分之间通过spacer连接。在退火温度下，扩增引物与阻滞引物形成一个Z字形结构并与各自的目标基因结合，扩增引物与靶基因结合引发扩增延伸，阻滞引物与非靶标序列结合阻滞非靶标序列延伸，极大程度阻止极相似的非靶标序列的扩增。辅以内标记系统，也可完成靶标基因的拷贝数检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物，具体涉及一种用于smn基因扩增、拷贝数检测的引物组及方法。

技术介绍

1、脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy，sma)是一种常染色体隐性遗传病，是由于脊髓前角及α运动神经原退化变性引起的神经变性病。临床表现为进行性、对称性、以肢体近端为主的肌无力和肌萎缩，根据发病时间与临床表型又分为i～iv型。患者表型差异大，具体的症状可能有：肌张力减低，反射减退，吸吮吞咽和呼吸困难，生长发育迟滞，严重的患者可能在幼儿期死亡。约95％的sma患者是由于smn1基因第7外显子的纯合缺失所致，其它患者多为复合杂合变异和双等位基因微小变异。

2、目前临床上用于sma的基因诊断技术主要有：变性高效液相色谱分析(pcr-dhplc)、限制性片段长度多态性聚合酶链式反应技术(pcr-rflp)、多重连接探针扩增技术(mlpa)、实时荧光定量pcr等。pcr-dhplc法可检测smn1基因7号外显子杂合缺失型携带者和纯合缺失患者，但通量低，操作复杂，耗时较长，且需特定的仪器。pcr-rflp法只能定性检测smn1基因7号外显子本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于SMN基因扩增的引物组，包括上游引物和下游引物，其特征在于，所述上游引物和下游引物中的一条为扩增-阻滞引物，所述扩增-阻滞引物包括第一部分和第二部分，其中：第一部分为扩增部分，与靶标基因互补结合后引导碱基合成，其3’端碱基有修饰，无法合成碱基，引发模板扩增；第二部分为与阻滞引物可形成退火互补的序列，其长度短于第一部分，第一部分和第二部分之间通过spacer连接。

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述扩增-阻滞引物第一部分的长度为16～28个碱基；和/或所述扩增-阻滞引物第二部分的长度为8～15个碱基。

3.根据权利要求1所述的引物组，其特征...

【技术特征摘要】

1.一种用于smn基因扩增的引物组，包括上游引物和下游引物，其特征在于，所述上游引物和下游引物中的一条为扩增-阻滞引物，所述扩增-阻滞引物包括第一部分和第二部分，其中：第一部分为扩增部分，与靶标基因互补结合后引导碱基合成，其3’端碱基有修饰，无法合成碱基，引发模板扩增；第二部分为与阻滞引物可形成退火互补的序列，其长度短于第一部分，第一部分和第二部分之间通过spacer连接。

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述扩增-阻滞引物第一部分的长度为16～28个碱基；和/或所述扩增-阻滞引物第二部分的长度为8～15个碱基。

3.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述扩增-阻滞引物第一部分的3’端往5’端方向的第2～5碱基的位置引入1个与靶标基因和非靶标基因碱基均不同的碱基。

4.根据权利要求3所述的引物组，其特征在于，所述扩增...

【专利技术属性】
技术研发人员：李胜，蒋馥蔓，曾晓静，陈昊，杜伯乐，王阳，郭宇来，李小坤，
申请(专利权)人：深圳精科生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：