本发明专利技术公开了一种军曹鱼ＭＨＣ－ＩＩβ基因序列，它的ＤＮＡ核苷酸及相应的氨基酸序列如ＳＥＱ？ＩＤ？ＮＯ．１所述。本基因的获得不仅为研究鱼类ＭＨＣ－ＩＩβ类分子的作用机理以及ＭＨＣ－ＩＩβ基因多态性与鱼体抗病力的关系奠定基础，而且通过基因序列可以获得具有生物活性的纯化蛋白，为进一步研究ＭＨＣ－ＩＩβ的免疫学功能奠定了基础提供理论基础。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及的是一种蛋白编码序列，尤其是涉及一种军曹鱼MHC-Iie基因序列。
技术介绍
MHC (major histocompatibility complex)即主要组织相容性复合体，是指染色体上由一系列紧密连锁的基因位点所组成的具有高度多态性的复合遗传系统或区域。是由MHC编码的一类细胞表面转膜蛋白，能结合并呈递内源抗原和外源抗原给T淋巴细胞。根据化学结构和功能的不同，MHC可分为MHC I类分子和MHC II类分子。其中，II类MHC分子呈递的抗原多是细胞外源性多肽，它在内质网内由a 、P和辅助分子Y链组装成完整三聚体，蛋白酶水解Y链，抗原多肽与II类MHC分子结合，形成稳定的II类MHC-多肽复合体，再运至细胞表面，外源性抗原在线粒体或溶酶体中与MHC II类分子结合后呈递给协助T淋巴细胞(Th，CD4+)，从而触发免疫反应。鱼类MHC II类分子是由a链和P链以非共价键的形式组成一个异二聚体。 MHC广泛参与免疫应答的诱导与调节，激发机体特异性免疫反应，在免疫学上具有极为重要的意义。由于MHC具有多态性、与疾病的相关性以及连锁不平衡性的特点，因此，了解鱼类MHC基因的结构与功能，寻找与疾病相关联的易感基因或疾病抵抗基因，对预防疾病具有很高的价值。此外，由于MHC的高度多态性，故可用于种群遗传学研究，并作为种群分子进化的标记之一。再者，MHC具有的多态性、与疾病的关联及其连锁不平衡等特点可以用来选育抗病品系。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种军曹鱼腿C-II |3基因序列。 本专利技术通过以近源物种腿C-Iie基因的CDS序列的保守区设计的兼并引物，并用PCR法扩增，结合RACE技术克隆到军曹鱼MHC-II P链基因的全表达序列；通过对MHC-II P基因设计有效地鉴定引物，从而可以通过半定量来分析该基因的组织分布情况，并运用荧光定量PCR对经LPS剌激后的脾脏中的MHCIie的表达量进行了分析。具体DNA核苷酸及相应的氨基酸序列如下 agagctctcaactcaccatcatggcttcatccttcgtctgcctctgcctcgtcttcatcg 〈 Leader peptide MASSFVCLCLVFI ctgcctecacagcagatggattcatgaatttcgcggtgggtcgctgtgacttteactcct X P 1 domain AAYT^DGFMNFAVGRCDFNS ctgatccteaagacatcgagtecattcagtcttettettecaacgaactggagttcatca SDPKDIEYIQSYYYNELEFI ggttc3gC3gC3gtgtgggg皿gtttgttgg3tec3C3g3gcttgg3gtg皿g皿cgC3g忆60131203318053240 RFSSSVGKFVGYTELGVKNA 73 皿cgctgg皿c皿3ggtcc3g3gttggttc3g3tg皿gggtg3g皿gg3C3g3tectgtg 300 ERWNKGPELVQMKGEKDRYC 93 tcaggaccgtgggactegactecacagctettctgacteagtcagtcgaaccctcggtca 360 X domain VRTVGLDYTAILTKSYEPSV 113 ggctgcactcgaccacgccccctetgggcaaacacccggccatgctggtctgcagcgtct 420 RLHSTTPPMGKHPAMLVCSV 133 acgacttcteccccaaatecatcagggtgagttggtgccgagatggacaggaagtggcct 480 YDFYPKYIRVSWCRDGQEVA 153 ctgatgtcagctccactgaggagctggctgacggcgactggtecteccagatccactctc 540 SDVSSTEELADGDWYYQIHS 173 acctggagtecacgcccaggtctggagagaagatctcctgtgtggtggagcacgccagcc 600 HLEYTPRSGEKISCVVEHAS 193 tgaaagaacctctggttettgactgggatccgtccatgcctgagtcagagagaaacaaaa 660 〉〈 CP/TM/CYT regi on LKEPLVIDW2PSMPESERNK 213 ttgccattggagcttcaggactgatcctgggtctgatcttetctctggctggattcatct 720 IAIGASGLILGLILSLAGFI 233 actecaagaggaaggcccgaggaaggatcctggttcccacteactgagccaggtcctgte 780 YYKRKARGRILVPTN* 248 tgctggacctggacctggacctggacctgcttctcagatggaagaaaatcagctgctgct 840 tteaactgcttcttgtttctcagtgctgccacttgttggaccagctgaacacctcagtct 900 ggtccaggactggrtctgacagtctgctggtcteaacctggtycatgaggtcacaggagt 960 cttgatcgggactctgacagtcctggaccaggttteatgtggactcacgtgtetcagctg 1020 gatctggactctgctgctttectgtgtgaatcaaaaccagatcagggctctggtgtcaaa 1080 tccttcatgatccagatgttttctecgctgtcatgt attta caateaaaaccaccagaaa 1140 c t c t g皿皿皿皿皿皿皿皿 1161 本专利技术的优点本基因的获得不仅为研究鱼类MHC-II |3类分子的作用机理以及MHC-II 13基因多态性与鱼体抗病力的关系奠定基础，而且通过基因序列可以获得具有生物活性的纯化蛋白，为进一步研究MHC-Iie的免疫学功能奠定了基础提供理论基础。本基因为鱼类种群遗传学及进化遗传学研究提供材料，可用于种群遗传学研究，并作为种群分子进化的标记之一。同时可以进行抗病相关性及抗病辅助育种的研究。附图说明 图i是本专利技术在军曹鱼正常组织中的分布； A.正常军曹鱼组织的腿CIie基因的组织表达 B. e-actin 1.头肾；2.皮肤；3.脾；4.肠；5.鳃；6.脑；7.心 图2是本专利技术经LPS剌激后军曹鱼脾脏组织中的MHC-II P基因随时间的表达变化图。具体实施例方式1.总RNA的提取 取健康的军曹鱼(体重约1000g)在养殖桶中养殖3日后，腹腔注射1ml的鲨鱼弧菌(JT2)。剌激192h后，解剖鱼体取出脾脏约250mg，放入-8(TC冰箱备用。取备用组织约lOOmg用剪刀剪碎加入1ml的Trizol (美国invitrogen公司)进行匀浆，按照试剂盒说明提取总RNA。 2. cDNA第一链的合成 取军曹鱼总RNA5iig与反转录引物(oligodT接头引物)1 (1Opmo本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种军曹鱼ＭＨＣ－Ⅱβ基因序列，其特征在于：它的ＤＮＡ核苷酸及相应的氨基酸序列如ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１所述。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：冯娟，茅莉娜，侯月娥，苏友禄，徐力文，郭志勋，王江勇，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院南海水产研究所，
类型：发明
国别省市：81[中国|广州]
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