确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法、系统、介质及电子设备技术方案

技术编号:42021623 阅读:24 留言:0更新日期:2024-07-16 23:13
本发明专利技术提供一种确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法、系统、介质及电子设备;所述方法包括:对子宫组织病灶样本及子宫组织对照样本进行mRNA测序检测,得到子宫组织病灶样本及子宫组织对照样本中包含空间位置信息的基因表达数据;对基因表达数据与同一月经周期的子宫单细胞数据进行整合分析,得到多个包含空间位置信息的细胞亚群,并将所得到的各个细胞亚群定义为目标亚群;得到各个目标亚群之间的相互作用概率分布及细胞互作概率的显著性,并确定子宫腺肌病微环境;基于子宫腺肌病微环境确定子宫腺肌病空间特异性调控分子;本发明专利技术解决了现有研究方法难以充分利用空间位置信息解析子宫腺肌病不同发展过程的分子特征的问题。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物工程,涉及一种子宫腺肌病,特别是涉及一种确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法、系统、介质及电子设备


技术介绍

1、子宫腺肌病是指子宫肌层中存在异位、非肿瘤性的子宫内膜腺体和基质,典型症状是痛经、月经过多、慢性盆腔疼痛和不孕,其发病率高,孕龄未生育女性子宫腺肌病的发病率超过34%。子宫腺肌病对女性的生育力、辅助生殖结局和妊娠结局都有不良影响:子宫腺肌病患者临床妊娠率仅有18.2%;子宫腺肌病会增加辅助生殖技术后的流产风险同时降低活产率,子宫腺肌病患者的临床妊娠率显著低于未患有子宫腺肌病的女性,同时着床率、每周期临床妊娠率、每胚胎移植临床妊娠率、持续妊娠率和活产率均显著降低;子宫腺肌病会导致流产、早产、小于胎龄儿、先兆子痫风险增加。但子宫腺肌病目前缺乏特异实验室诊断指标,缺乏特异的对因治疗药物,缺乏与预后和治疗方案相关的统一的分类、分级标准。

2、子宫腺肌病是一个典型的具有空间分布特异性的疾病。子宫腺肌病病灶起源于子宫内膜基底层的内膜内陷,子宫内膜与肌层交界处的失衡是子宫腺肌病发病的始动因素,这种失衡可能是内膜侵袭能力增强和肌本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,所述步骤S2中利用贝叶斯模型对子宫组织病灶样本及子宫组织对照样本中包含空间位置信息的基因表达数据,与同一月经周期的子宫单细胞数据进行整合分析,得到多个包含空间位置信息的细胞亚群包括:

3.根据权利要求2所述的确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,子宫单细胞数据的细胞类型至少包括以下任意一种:上皮细胞、基质成纤维细胞、支持细胞、内皮细胞或者免疫细胞。

4.根据权利要求1所述的确定子宫腺肌病空...

【技术特征摘要】

1.一种确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,所述步骤s2中利用贝叶斯模型对子宫组织病灶样本及子宫组织对照样本中包含空间位置信息的基因表达数据,与同一月经周期的子宫单细胞数据进行整合分析,得到多个包含空间位置信息的细胞亚群包括:

3.根据权利要求2所述的确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,子宫单细胞数据的细胞类型至少包括以下任意一种:上皮细胞、基质成纤维细胞、支持细胞、内皮细胞或者免疫细胞。

4.根据权利要求1所述的确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,包含空间位置信息的细胞亚群的类型包括:上皮细胞、基质成纤维细胞、支持细胞、内皮细胞或者免疫细胞。

5.根据权利要求1所述的确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法,其特征在于,在所述步骤s2中利用贝叶斯模型对子宫组织病灶样本及子宫组织对照样本中包含空间位置信息的基因表达数据,与同一月经周期的子宫单细胞数据进行整合分析的步骤之后,所述步骤s2中得到多个包含空间位置信息的细胞亚群,并将所得到的各个细胞亚群定义为目标亚群的步骤之前,所述确定子宫腺肌病空间特异性调控分子的方法还包括:用pearson相关性分析得到空间转录组数据和单细胞数据的差异表达基因在不同细胞类型表达的相关性,以确定包含空间位置信息的细胞亚群...

【专利技术属性】
技术研发人员:孙贇齐家李博豫
申请(专利权)人:上海交通大学医学院附属仁济医院
类型:发明
国别省市:

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