微生物相关代谢物预测模型的构建和使用方法及装置制造方法及图纸

技术编号:42000135 阅读:21 留言:0更新日期:2024-07-12 12:23
本发明专利技术涉及微生物相关代谢物预测模型的构建和使用方法及装置,该方法通过构建关于微生物数据与代谢物数据的关联模型;利用所述关联模型预测样本代谢物,得到预测值;比对所述预测值与所述样本代谢物的测量值,得到相关性参数,所述相关性参数包括高相关代谢物及低相关代谢物;判断所述相关性参数是否全部为所述高相关代谢物;若否,利用所述微生物数据与所述高相关代谢物迭代所述关联模型;若是,确认所述关联模型为代谢物预测模型。本发明专利技术实施例提供的技术方案,利用已知的微生物数据与代谢物数据构建预测模型,利用此预测模型对样本代谢物进行预测,得到高相关代谢物以及低相关代谢物,利用高相关代谢物重复迭代构建预测模型以及预测的过程,直至没有低相关代谢物的产生,该方法剔除了与微生物关联性不大且不适合用微生物数据进行预测的代谢物,构建的关联模型包含了代谢物之间、微生物之间、以及代谢物对微生物、微生物对代谢物的作用,保证了代谢物预测的准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及代谢物数据分析,尤其涉及一种微生物相关代谢物预测模型的构建和使用方法及装置


技术介绍

1、在针对人体肠道菌群的代谢过程以及宿主状态的研究过程中,微生物(肠道菌群)数据以及代谢物数据都是非常重要的参考指标。并且伴随着研究的日益增多,微生物数据的积累程度已经可以满足现阶段研究的需要,但是对于代谢物数据的积累却很少,这主要是由于代谢物测量技术以及测量成本等原因。因此目前存在采用代谢物信息去推测代谢物数据的情况,例如:基于先验知识,利用已知的微生物代谢网络,如kegg数据库的代谢通路信息,合理推测微生物群落可能的代谢情况;又或者采用数据驱动型工具,通过对处于相似生境的真实数据进行训练,构建模型来预测新样本的代谢数据。

2、其中现阶段采用数据模型的方式来进行代谢物预测的方法主要采用melonnpan和envim的预测工具,两者的工作原理均为为每个独立代谢物建立微生物弹性网络回归模型,该模型主要考量的是微生物对代谢物的影响以及微生物与微生物之间可能的共线性问题,但是由于微生物与代谢物之间属于一种连锁反应的复杂关系网络,因此代谢物之间以及代谢本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述构建关于微生物数据与代谢物数据的关联模型之前,还包括:

3.根据权利要求1所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述构建关于微生物数据与代谢物数据的关联模型,具体包括:

4.根据权利要求1所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述比对所述预测值与所述样本代谢物的测量值,得到相关性参数,具体包括:

5.根据权利要求4所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述比较...

【技术特征摘要】

1.微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述构建关于微生物数据与代谢物数据的关联模型之前,还包括:

3.根据权利要求1所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述构建关于微生物数据与代谢物数据的关联模型,具体包括:

4.根据权利要求1所述的微生物相关代谢物预测模型的构建方法,其特征在于,所述比对所述预测值与所述样本代谢物的测量值,得到相关性参数,具体包括:

5.根据权利要求4所述的微生物相关代谢物预测模型的...

【专利技术属性】
技术研发人员:余光创唐文丽罗晓
申请(专利权)人:南方医科大学
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1