【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，具体来说是一种青稞品种鉴定的ssr分子标记引物组、试剂盒及应用。
技术介绍
1、青稞（ hordeum vulgare l. var. nudum hook. f.），属禾本科、大麦属，是大麦的变种，因籽粒不带稃，故称为裸大麦、元麦、米麦等，是中国历史悠久的栽培作物之一。具有生育期短、适应性强，抗逆性好和营养丰富等优点，广泛分布在我国青海、西藏、四川阿坝州、甘肃甘南州和云南迪庆州等青藏高原高寒和高海拔地区。现今，青稞产业已成为藏区农牧业经济发展的支柱产业，青稞产业的稳步发展是促进农牧民增产增收、藏区农牧业转型升级、农村社会稳定的关键因素，在保障民族地区粮食安全、助推乡村振兴方面具有重要意义。
2、分子标记技术可以直接检测样品间dna水平上的差异，不受环境条件的影响，具有快速高效的特点，目前已被世界各国应用于品种鉴定中。ssr(simple sequence repeat，简单重复序列）又称微卫星，通常指是以少数（1～6）核苷酸为单位的串联重复dna序列。与rflp和rapd相比，ssr分子标记具有多态性高、共显性遗传、可靠性高、易实现自动化分析，数据便于交流等特点，是目前应用最为成熟的dna分子标记。公开号为cn 109082477 a、名称为一种不同品种青稞的鉴别方法的专利技术专利（对比文件1），方法公开了14对ssr引物，可鉴定福8-4、南-3、山南白青稞、甘靑3号、昆仑15号、北青3号、藏青2000、北青9号、北
3、但是，对比文件1-3公开的方法中，未明确ssr分子标记引物在青稞染色体上的分布信息，可能存在分子标记在染色体中的不均匀分布、部分染色体无分子标记位点、分子标记间存在连锁反应等问题，进而影响ssr分子标记引物的鉴别效率。对比文件4公开的方法中，虽明确了ssr分子标记引物在相关染色体上的位置，但依然存在分子标记在染色体上分布不均的问题，鉴别影响权重差异较大。对比文件1-4公开的方法中，仅对少量品种开展鉴定工作，对鉴别效率未开展评价；按照多态性信息含量（pic）的衡量标准，提供ssr分子标记引物多为低度或中度多态性引物。上述方法可实现对青稞品种的鉴定，但仍然存在着鉴定效率评价不足、鉴定品种应用较少和引物多态性较低等问题，对青稞品种鉴定、遗传多样性分析的高效性和精确性具有一定影响。
4、因此，迫切需要建立适用于青稞品种鉴定的ssr分子标记鉴定技术体系。实现青稞品种快速分子鉴定，对今后的青稞新品种选育、dus测试近似品种筛选、品种权纠纷快速鉴定以及国际合作交流等具有积极而深远的意义。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是针对现有技术存在的问题，提供一种青稞品种鉴定的ssr分子标记引物组、试剂盒及应用，该ssr分子标记引物组均匀地分布在青稞的7条染色体上，可实现青稞品种的精确鉴定。
2、为实现上述目的，本专利技术采用的技术方案是：一种青稞品种鉴定的ssr分子标记引物组，所述ssr分子标记引物组由：定位于1号染色体的seq id no.1～6，定位于2号染色体的seq id no.7～12，定位于3号染色体的seq id no.13～18，定位于4号染色体的seq idno.19～24，定位于5号染色体的seq id no.25～30，定位于6号染色体的seq id no.31～36和定位于7号染色体的seq id no.37～42的序列组成。
3、本专利技术的第二目的是提供一种用于鉴定青稞品种的试剂盒，所述试剂盒含有上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组。
4、本专利技术的第三目的是提供一种上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组或上述所述试剂盒在青稞品种鉴定的应用。
5、本专利技术的第四目的是提供一种上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组或上述所述试剂盒在青稞实质性派生品种鉴定中的应用。
6、本专利技术的第五目的是提供一种上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组或上述所述试剂盒在青稞种质资源遗传多样性分析中的应用。
7、本专利技术的第六目的是提供一种上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组或上述所述试剂盒构建青稞品种dna指纹数据库中的应用。
8、利用上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组或上述所述试剂盒进行青稞品种鉴定的方法，包括如下步骤：
9、(1)提取样本dna：取待检青稞样品，提取其中的dna；
10、(2)基因扩增：用上述seq id no.1～42所示的ssr分子标记引物组或上述所述试剂盒对待检样本进行pcr扩增；
11、(3)结果检测：对dna扩增结果进行检测。
12、本专利技术的原理：ssr随机分布在青稞基因组上，不同品种每个位点上ssr的重复次数可能存在差异，这种差异可通过pcr扩增及电泳方法进行检测，进而区分不同的青稞品种。
13、本专利技术的有益技术效果是：在本专利技术的技术方案中，提供了21对ssr分子标记引物，明确了相关引物的染色体分布位置，选择ssr分子标记引物均匀分布在青稞的7条染色体上，每条染色体上筛选了3个ssr检测位点。与现有技术相比，ssr分子标记的分布更为均匀、合理。利用21对ssr本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.青稞品种鉴定的SSR分子标记引物组，其特征在于，所述SSR分子标记引物组由：定位于1号染色体的SEQ ID No.1～6，定位于2号染色体的SEQ ID No.7～12，定位于3号染色体的SEQ ID No.13～18，定位于4号染色体的SEQ ID No.19～24，定位于5号染色体的SEQ IDNo.25～30，定位于6号染色体的SEQ ID No.31～36和定位于7号染色体的SEQ ID No.37～42的序列组成。
2.一种用于鉴定青稞品种的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒含有权利要求1所述SSR分子标记引物组。
3.一种权利要求1所述SSR分子标记引物组或权利要求2所述试剂盒在青稞品种鉴定的应用。
4.一种权利要求1所述SSR分子标记引物组或权利要求2所述试剂盒在青稞实质性派生品种鉴定中的应用。
5.一种权利要求1所述SSR分子标记引物组或权利要求2所述试剂盒在青稞种质资源遗传多样性分析中的应用。
6.一种权利要求1所述SSR分子标记引物组或权利要求2所述试剂盒在构建青稞品种DNA指纹数据库中的应用。>...
【技术特征摘要】
1.青稞品种鉴定的ssr分子标记引物组，其特征在于，所述ssr分子标记引物组由：定位于1号染色体的seq id no.1～6，定位于2号染色体的seq id no.7～12，定位于3号染色体的seq id no.13～18，定位于4号染色体的seq id no.19～24，定位于5号染色体的seq idno.25～30，定位于6号染色体的seq id no.31～36和定位于7号染色体的seq id no.37～42的序列组成。
2.一种用于鉴定青稞品种的试剂盒，其特征在于，所...
【专利技术属性】
技术研发人员：胡强，滕彩玲，韩瑞玺，杨晓洪，姚宗泽，乔菊香，赵秦，毛进，
申请(专利权)人：云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所，
类型：发明
国别省市：
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