一种基于CRISPR-Cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体及其构建方法与应用技术方案

技术编号:41964557 阅读:51 留言:0更新日期:2024-07-10 16:47
本申请涉及合成生物学技术领域,具体公开一种基于CRISPR‑Cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体及其构建方法与应用。其中基于CRISPR‑Cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体包括gRNA区的一个直接重复片段的核酸序列、目标gRNA的核酸序列、上游同源臂的核酸序列、下游同源臂的核酸序列、复制元件的核酸序列和Cas12a蛋白的核酸序列,目标gRNA的核酸序列包括如SEQ ID No.1‑6所示的核酸序列中的至少一种。本申请提供的噬藻体基因组编辑载体,结构精简,通过强效gRNA,高效招募Cas12a蛋白,实现目的基因的高效切割,提升其对噬藻体基因组的编辑效率。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及合成生物学,尤其涉及一种基于crispr-cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体及其构建方法与应用。


技术介绍

1、蓝藻水华的爆发对水生环境和人类与动物健康都造成威胁,噬藻体是可以高效侵染裂解蓝细菌(蓝藻)的病毒,在自然环境中拥有很高的丰度。目前纯培养的噬藻体都是从天然环境中分离纯化得到的,可用于研究病毒-宿主之间的进化关系,也可以利用噬藻体治理蓝藻水华,具有独特的优越性和发展潜力。但野生型噬藻体具有宿主专一性,野生型噬藻体应用于蓝藻水华治理中有很多限制因素,通常只侵染特定藻株,且产毒蓝藻的噬藻体的分离纯化是非常困难和耗时的。为解决上述问题,可以通过合成生物学的方法,对天然噬藻体进行改造。

2、目前,噬菌体基因编辑已成为研究重点之一,crispr-cas系统作为一种高效的基因编辑工具,在蓝藻研究中也广泛应用。wendt及其同事研究发现cas9的高表达水平对蓝藻有毒,导致蓝藻的细胞活力降低;ungerer等人应用cas12a应用于蓝藻基因组编辑,成功在聚球藻utex 2973、集胞藻pcc 6803和鱼腥藻pcc 7120实现无痕迹敲入本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于CRISPR-Cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体,其特征在于,包括gRNA区的一个直接重复片段的核酸序列、目标gRNA的核酸序列、上游同源臂的核酸序列、下游同源臂的核酸序列,复制元件的核酸序列和Cas12a蛋白的核酸序列;

2.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体,其特征在于,所述上游同源臂的长度为50bp,所述下游同源臂的长度为50bp。

3.一种权利要求1或2所述的基于CRISPR-Cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体的构建方法,其特征在于,包括步骤:

4.根据权利要求3所述的构建方法,其特...

【技术特征摘要】

1.一种基于crispr-cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体,其特征在于,包括grna区的一个直接重复片段的核酸序列、目标grna的核酸序列、上游同源臂的核酸序列、下游同源臂的核酸序列,复制元件的核酸序列和cas12a蛋白的核酸序列;

2.根据权利要求1所述的基于crispr-cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体,其特征在于,所述上游同源臂的长度为50bp,所述下游同源臂的长度为50bp。

3.一种权利要求1或2所述的基于crispr-cas12a系统的噬藻体基因组编辑载体的构建方法,其特征在于,包括步骤:

4.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述目标grna的序列获取方法包括:

5.根据权利要求3所述的构建方法,...

【专利技术属性】
技术研发人员:马迎飞寇春华黎晏辰袁盛建
申请(专利权)人:中国科学院深圳先进技术研究院
类型:发明
国别省市:

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