DNA甲基化测序数据分析方法、系统、设备及存储介质技术方案

技术编号:41903492 阅读:32 留言:0更新日期:2024-07-05 14:09
本申请提供了一种DNA甲基化测序数据分析方法、系统、设备及存储介质,本申请的DNA甲基化测序数据分析方案的分析流程简单、界面友好,用户只需分配实验组和对照组样本,即可一键开始分析。分析结果通过火山图、热图、质控信息表、Manhattan图等多种形式进行针对化、多元化直观展示,对使用人员的专业背景要求低,同时保证了数据安全性以及运行过程符合标准规程化。在一定程度上解决了目前市场上已有的甲基化分析软件及数据库的分析弊端。

【技术实现步骤摘要】

本申请属于基因测序,具体涉及一种dna甲基化测序数据分析方法、系统、设备及存储介质。


技术介绍

1、随着下一代测序技术(next generation sequence,ngs)的广泛应用,基因测序的成本迅速下降,基因测序技术得以在更加广泛的生物、医疗、健康、刑侦、农业等等许多领域被推广应用。其中,基于ngs的脱氧核糖核酸(deoxyribo-nucleic acid,dna)甲基化测序是一个非常有应用价值的分支领域,受到广泛的关注。dna甲基化是一种常见的dna表观修饰现象。研究表明,人的dna甲基化与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,异常的甲基化往往是许多疾病的起因。因此,dna甲基化检测对于生物研究、医疗诊断、法医生物学等多个领域具有非常大的应用价值。

2、目前甲基化研究的主要方法是通过亚硫酸氢钠处理dna序列,将基因组中未发生甲基化的c碱基转换成u(甲基化的碱基c保持不变),在pcr扩增后变成t,与原本具有甲基化修饰的碱基c区分开来。随着高通量测序技术的发展,二代测序技术已逐渐成为检测dna甲基化的主流方法,适用于全基因组范围内绘本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种DNA甲基化测序数据分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的DNA甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述进行碱基质量衡量生成碱基质检报告,包括:

3.根据权利要求1所述的DNA甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述绘制得到差异甲基化位点Manhattan图之后,还包括:

4.根据权利要求3所述的DNA甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述根据所述组间差异甲基化位点DML中的甲基化位点位置十等分统计绘制曲线图,包括:

5.根据权利要求1所述的DNA甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述绘制得到差异甲基化位...

【技术特征摘要】

1.一种dna甲基化测序数据分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的dna甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述进行碱基质量衡量生成碱基质检报告,包括:

3.根据权利要求1所述的dna甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述绘制得到差异甲基化位点manhattan图之后,还包括:

4.根据权利要求3所述的dna甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述根据所述组间差异甲基化位点dml中的甲基化位点位置十等分统计绘制曲线图,包括:

5.根据权利要求1所述的dna甲基化测序数据分析方法,其特征在于,所述绘制得到差异甲基化位点manh...

【专利技术属性】
技术研发人员:高端张闯吴理达顾雨春宁泽民赵毅强刘晓庆
申请(专利权)人:呈诺再生医学科技北京有限公司
类型:发明
国别省市:

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