可用于蚕豆农艺性状解析的SNP位点组合、相关基因芯片及应用制造技术

技术编号:41842246 阅读:37 留言:0更新日期:2024-06-27 18:22
本发明专利技术提供一种可用于蚕豆农艺性状解析的SNP位点组合,包括12295个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该SNP位点的等位基因变化,所述12295个SNP位点的物理位置是基于蚕豆品种Hedin/2全基因组序列,与蚕豆的重要农艺性状相关,可通过测定蚕豆植株DNA中这12295个SNP位点的基因型来评估蚕豆植株的农艺性状,将其应用于蚕豆的农艺性状解析时,加快了育种进程。采用本发明专利技术的可用于蚕豆农艺性状解析的SNP位点组合制备的液相基因芯片能够用于蚕豆农艺性状解析,而且检测费用大大降低,适于大规模推广应用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及作物分子育种,特别涉及蚕豆分子育种,具体是指一种可用于蚕豆农艺性状解析的snp位点组合、相关基因芯片及应用。


技术介绍

1、蚕豆是粮、菜、饲、肥兼用的作物,营养价值丰富,具有“养人、养畜、养地”的功能,在农业生产中具有重要地位。当前蚕豆以传统育种为主,对农艺性状的选择主要依赖育种家的经验,不仅工作量大、周期长,对品质性状的选择效率也较低。而传统育种对农艺性状鉴定不够准确,很多与优异、特异农艺性状相关联的变异未能充分挖掘与利用。由于蚕豆巨大的基因组(约13g),以覆盖10x的测序低标准计算,成本也非常高。因此,蚕豆基因组学发展缓慢,分子育种研究仍然处在起步阶段。品质性状相关联的分子标记十分缺乏,分子育种技术急需创新。

2、液相snp芯片技术将大量的snp探针固定在一张芯片上,将样本dna与芯片杂交,可一次检测样本中成千上万个snp位点。除了具有固相芯片的核苷酸测序、单核苷酸多态性分析等功能外,检测时样本数比较灵活,芯片位点可根据要求调整,可以同时定性、定量分析,结果准确,重复性高。

3、目前,已经有研究者基于蚕豆花、叶、本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种可用于蚕豆农艺性状解析的SNP位点组合,其特征在于,包括12295个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该SNP位点的等位基因变化,所述12295个SNP位点的物理位置是基于蚕豆品种Hedin/2全基因组序列,所述蚕豆品种Hedin/2全基因组序列版本号为211010Vfaba split pseudomolecules hedin v1 plus chlro cleanunanchored contigs,所述12295个SNP位点的变异信息如下:

2.根据权利要求1所述的可用于蚕豆农艺性状解析的SNP位点组合,其特征在于,所述农艺性状包括株...

【技术特征摘要】

1.一种可用于蚕豆农艺性状解析的snp位点组合,其特征在于,包括12295个snp位点,每个snp位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该snp位点的等位基因变化,所述12295个snp位点的物理位置是基于蚕豆品种hedin/2全基因组序列,所述蚕豆品种hedin/2全基因组序列版本号为211010vfaba split pseudomolecules hedin v1 plus chlro cleanunanchored contigs,所述12295个snp位点的变异信息如下:

2.根据权利要求1所述的可用于蚕豆农艺性状解析的snp位点组合,其特征在于,所述农艺性状包括株高、叶型、叶色、荚型、荚质、种皮颜色、籽粒长度、籽粒宽度、籽粒长宽比、籽粒厚度、籽粒周长、籽粒表面积、百粒重、蛋白质含量、淀粉含量、单宁含量、纤维含量和脂肪含量。

3.一套用于检测如权利要求1所述的可用于蚕豆农艺性状解析的snp位点组合的核苷酸探针。

4.一种液相基因芯片,其特征在于,用于检测如...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵娜魏利斌王学军缪亚梅汪凯华薛冬王永强顾春燕周恩强李波
申请(专利权)人:江苏沿江地区农业科学研究所
类型:发明
国别省市:

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