与水稻杂种劣势基因Hwi2紧密连锁的分子标记制造技术

本发明专利技术基于2058个水稻品种中8584244个SNP位点信息，获得杂种劣势基因Hwi2功能SNP位点上下游各250 Kb区域内的共计8848个SNP的基因型信息，通过连锁不平衡分析，筛选出2组与水稻杂种劣势基因Hwi2紧密连锁的单倍型标记，这2组单倍型分子标记可用于水稻杂种劣势基因Hwi2的功能鉴定，有效避免了因少数标记检测失败而导致的鉴定精准性问题，以及由于基因附近发生重组而导致的基因功能丧失的问题，提高功能基因鉴定的精准性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于植物分子育种领域，具体涉及2组与水稻杂种劣势基因hwi2紧密连锁的分子标记。

技术介绍

1、生殖障碍在物种形成过程中起着至关重要的作用，杂种劣势是在自然界广泛存在的重要生殖隔离形式。中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所林鸿宣研究组发现来自海南普通野生稻(oryza rufipogon)杂种劣势显性座位hybrid weakness i1(hwi1)上的两个基因与来自亚洲栽培稻(oryza sativa)品种teqing的显性基因hwi2遗传上不相容，同时携带hwi1和hwi2的杂种植株，其体内的自身免疫应答被组成型激活，影响了植株的正常生长发育(chen chen等，a two-locus interaction causes interspecifichybrid weakness in rice，2014)。

2、分子标记是基于遗传物质dna基础上的多态性标记，依据标记和性状的关联关系，能够利用基因的功能标记或者紧密连锁标记，快速地鉴定品种所含有的功能基因。snp标记是数量最多、分布最广泛的一种分子标记。snp标记的本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.单倍型分子标记1在鉴定水稻杂种劣势基因Hwi2中的应用，其特征在于，所述单倍型分子标记1由9个SNP位点组成，SNP位点信息如下：

2.单倍型分子标记2在鉴定水稻杂种劣势基因Hwi2中的应用，其特征在于，所述单倍型分子标记2由12个SNP位点组成，SNP位点信息如下：

【技术特征摘要】

1.单倍型分子标记1在鉴定水稻杂种劣势基因hwi2中的应用，其特征在于，所述单倍型分子标记1由9个snp位点组成，snp位点信息如下：

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【专利技术属性】
技术研发人员：张翠翠，伍应天，邱树青，周发松，
申请(专利权)人：武汉双绿源创芯科技研究院有限公司，
类型：发明
国别省市：