一种单核苷酸遗传标记在选育高海拔适应性黄牛中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种单核苷酸遗传标记在选育高海拔适应性黄牛中的应用。利用全基因组渗入分析方法，对藏牛的全基因组SNP进行分析，发现藏牛EGLN1基因启动子上的三个单核苷酸变异可能与藏牛高海拔适应性相关，并从中发现了作为高海拔适应性黄牛选育的分子标记，可以用于快速建立高海拔适应性牛群体，为培育适应高原环境的牛品种提供了依据。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及与牛(bos taurus)高海拔适应性相关的基因组变异，具体涉及在dna水平上发现与牛高海拔适应性相关的snp以及利用这些变异在黄牛的选育中进行的应用。

技术介绍

1、青藏高原地区的黄牛(简称藏牛)有阿沛甲砸牛、日喀则牛、樟木牛、迪庆牛、玉树牛、定结牛、柴达木牛和甘孜藏牛等品种(或本地黄牛群体)。藏牛属于小型牛，为原牛后裔，由于青藏高原复杂的地理屏障，藏牛始终没有迁移到青藏高原以外的地方，故应是世界上最古老的牛种群之一。同时由于藏牛长期生存在高原地区，它们在形态、生理上也逐渐适应了高寒和低氧的极端环境。

2、单核苷酸多态性(snp，single nucleotide polymorphism)是同一物种不同个体基因组dna的等位序列上单个核苷酸存在差别的现象。snp是生物体基因组中存在最为广泛的一类变异，具体是由于单个核苷酸的插入、缺失、转换和颠换而引起的。相同长度的dna因其顺序不同或单个碱基差异，所形成的构象就会不同，这些不同可能影响dna的表达及功能。

3、egln1(egl-9 family hypoxia-本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：所述待测牛来源于定结牛或其他藏牛群体。

3.根据权利要求1所述一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：所述4151028位的单核苷酸多态性位点的变异与牛高海拔适应性相关。

4.根据权利要求1所述一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：所述其他单核苷酸多态性位点为位于牛参考基因组第28...

【技术特征摘要】

1.一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：所述待测牛来源于定结牛或其他藏牛群体。

3.根据权利要求1所述一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：所述4151028位的单核苷酸多态性位点的变异与牛高海拔适应性相关。

4.根据权利要求1所述一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：所述其他单核苷酸多态性位点为位于牛参考基因组第28号染色体上4150843位和4150859位的单核苷酸多态性位点，4150843位的单核苷酸多态性位点为c>g突变，4150859位的单核苷酸多态性位点为t>c突变。

5.一种与牛高海拔适应性相关的候选基因组区域单核苷酸多态性的检测试剂盒，其特征在于：该试剂盒包括用于特异性扩增待测牛egln1基因启动子区与牛高海拔适应性相关的单核苷酸多态性位点并鉴定相应位点基因型的引物，所述单核苷酸多态性位点为位于牛参考基因组第28号染色体上4151028位的单核苷酸多态性位点；所述牛参考...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈宁博，汪富文，吕阳，雷初朝，马志杰，夏小婷，巴桑珠扎，索朗曲吉，黄必志，刘建勇，马伟东，成海建，张继才，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：