一种基于CRISPR-Cas12a的胡萝卜软腐果胶杆菌可视化快速检测方法技术

本发明专利技术公开了一种基于CRISPR‑Cas12a的胡萝卜软腐果胶杆菌可视化快速检测方法。本发明专利技术属于微生物检测领域，涉及一种基于CRISPR‑Cas12a的胡萝卜软腐果胶杆菌可视化快速检测方法。本发明专利技术提供鉴定或辅助鉴定胡萝卜软腐果胶杆菌的组合物，由Pcc‑F的单链DNA(核苷酸序列是SEQ ID No.1)、Pcc‑R的单链DNA(核苷酸序列是SEQ ID No.2)、特异于待检测生物的CrRNA(核苷酸序列是SEQ ID No.3)、CrRNA缓冲液、LbaCas12a蛋白、Cas12a反应缓冲液和荧光报告探针组成，本发明专利技术的检测方法具有灵敏度高、特异性强、便携、快速等特点，能够满足现场检测需求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于微生物检测领域，具体涉及一种基于crispr-cas12a的胡萝卜软腐果胶杆菌可视化快速检测方法。

技术介绍

1、胡萝卜软腐果胶杆菌(pectobacterium carotovorumsubsp.carotovorum,pcc)是一种重要的植物病原菌，能够在彩色马蹄莲、白菜、胡萝卜、番茄等寄主上引起严重的细菌性软腐病。，给农业生产造成巨大的经济损失。软腐病往往是一旦发生，难以控制，导致农作物大面积死亡。所以，软腐病的防治，重点在防。预防软腐病，其病原菌的早期预警尤为关键。传统的检测方法有pcr法，elisa法等，这些方法操作程序复杂繁琐、检测成本高、耗时、费力、专业性强，需要在专门的实验室内借助大型仪器完成，无法满足植物病原菌早期预警的现实需求。因此，现实农业生产迫切需要开发一种快速，低成本、灵敏度高，且能够在田间地头现场检测的可视化检测方法，这对于软腐病早期预警，避免造成农作物大面积死亡尤为重要。

技术实现思路

1、本专利技术所要解决的技术问题是如何简单快速鉴定胡萝卜软腐果胶杆菌或植物样本中本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.鉴定或辅助鉴定胡萝卜软腐果胶杆菌的组合物，由名称为Pcc-F的单链DNA、名称为Pcc-R的单链DNA、特异于待检测生物的CrRNA、CrRNA缓冲液、LbaCas12a蛋白、Cas12a反应缓冲液和荧光报告探针组成；

2.鉴定或辅助鉴定胡萝卜软腐果胶杆菌的试剂盒，含有权利要求1所述组合物与N；所述N为Rehydration Buffer 2×、Starter 10×。

3.根据权利要求2或3所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒为等温扩增试剂盒。

4.权利要求1所述组合物的制备方法，包括将权利要求1中所述Pcc-F、所述Pcc-R、所述特异于待检测...

【技术特征摘要】

1.鉴定或辅助鉴定胡萝卜软腐果胶杆菌的组合物，由名称为pcc-f的单链dna、名称为pcc-r的单链dna、特异于待检测生物的crrna、crrna缓冲液、lbacas12a蛋白、cas12a反应缓冲液和荧光报告探针组成；

2.鉴定或辅助鉴定胡萝卜软腐果胶杆菌的试剂盒，含有权利要求1所述组合物与n；所述n为rehydration buffer 2×、starter 10×。

3.根据权利要求2或3所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒为等温扩增试剂盒。

4.权利要求1所述组合物的制备方法，包括将权利要求1中所述pcc-f、所述pcc-r、所述特异于待检测生物的crrna、所述lbacas12a蛋白、所述荧光报告探针...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈得峰，秦娇娇，卫尊征，钟雄辉，袁梦，张月阳，
申请(专利权)人：北京市农林科学院，
类型：发明
国别省市：