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【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本公开涉及生物技术。更具体地,本公开涉及分子条形码以及相关方法和系统。
技术介绍
技术实现思路
【技术保护点】
1.一种分子条形码,其包括由一或多个标识体构成的集合,所述由标识体构成的集合中的每个标识体都包括由一或多个可检测标记构成的集合,所述一或多个可检测标记操作性地连接到支架部分,所述支架部分包括:
2.根据权利要求1所述的分子条形码,由此应用与所述识别部分具有正交反应性的切割剂在至少一个标识体的所述切割位点处切割所述分子条形码,以根据所述标识体的正交性使所述一或多个可检测标记从三维布置中解离,并且由此诱导可检测信号响应以解码所述分子条形码。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的分子条形码,其中所述支架部分包括多肽、氨基酸、环肽、核酸或其组合。
4.根据权利要求1至3中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括双链DNA(dsDNA),所述识别部分包括核酸酶识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
5.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括双链DNA,所述识别部分包括蛋白酶识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
6.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中
7.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括氨基酸,所述识别部分包括蛋白酶识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
8.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括氨基酸,所述识别部分包括化学切割识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
9.根据权利要求1至8中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述识别部分包括所述切割位点。
10.根据权利要求1至9中任一权利要求所述的分子条形码,其进一步包括位于所述由标识体构成的集合中的每个标识体之间的标识体接头。
11.根据权利要求10所述的分子条形码,其中所述标识体接头选自以下群组:点击化学部分、天然化学连接接头和酶介导的连接接头。
12.根据权利要求1至11中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述由标识体构成的集合中的至少一个标识体的所述识别部分包括化学接头、肽或核酸。
13.根据权利要求1至12中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述由标识体构成的集合中的所述可检测标记中的至少一或多个可检测标记包括荧光团。
14.根据权利要求1至13中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述由标识体构成的集合中的每个识别部分都包括至少一个选自以下的部分:蛋白酶识别部分、核酸内切酶识别部分、能通过亲和试剂识别的表位、核酸探针识别部分、经修饰的肽侧链和非天然肽侧链。
15.根据权利要求1至14中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述分子条形码附接到珠粒。
16.根据权利要求15所述的分子条形码,其中所述珠粒进一步附接到测试剂。
17.根据权利要求15所述的分子条形码,其中所述珠粒进一步附接到化学结构单元。
18.根据权利要求1至17中任一权利要求所述的分子条形码,其进一步包括与所述分子条形码的所述三维布置具有互信息的材料。
19.一种将材料分类的方法,所述方法包括:
20.一种筛选方法,其包括:
21.根据权利要求19或权利要求20所述的方法,其中所述可检测信号响应是在不进行富集的情况下诱导的。
22.根据权利要求20或权利要求21所述的方法,其中将正交反应性切割剂选择性地应用于所述多个测试构建体包括依序地应用所述切割试剂。
23.根据权利要求22所述的方法,其中依序地应用所述切割试剂包括迭代地应用单一切割剂或依序地应用两种或更多种切割剂。
24.根据权利要求19至23中任一权利要求所述的方法,其中所述可检测信号响应包括检测又一个或多个解离的可检测标记的存在或不存在或调节信号频率或信号幅度。
25.一种用于产生分子条形码的方法,所述方法包括:
26.根据权利要求25所述的方法,其进一步包括将所述第一标识体操作性地附接到材料。
27.根据权利要求26所述的方法,其中所述材料为表面。
28.根据权利要求27所述的方法,其中所述表面包括微粒或珠粒的外表面或内表面。
29.根据权利要求27或权利要求28所述的方法,其包括将所述第一标识体通过高亲和力结合蛋白操作性地附接到所述表面。
30.根据权利要求25所述的方法,其进一步包括将所述第一标识体附接到三臂接头。
31.根...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种分子条形码,其包括由一或多个标识体构成的集合,所述由标识体构成的集合中的每个标识体都包括由一或多个可检测标记构成的集合,所述一或多个可检测标记操作性地连接到支架部分,所述支架部分包括:
2.根据权利要求1所述的分子条形码,由此应用与所述识别部分具有正交反应性的切割剂在至少一个标识体的所述切割位点处切割所述分子条形码,以根据所述标识体的正交性使所述一或多个可检测标记从三维布置中解离,并且由此诱导可检测信号响应以解码所述分子条形码。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的分子条形码,其中所述支架部分包括多肽、氨基酸、环肽、核酸或其组合。
4.根据权利要求1至3中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括双链dna(dsdna),所述识别部分包括核酸酶识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
5.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括双链dna,所述识别部分包括蛋白酶识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
6.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括双链dna,所述识别部分包括化学切割识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
7.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括氨基酸,所述识别部分包括蛋白酶识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
8.根据权利要求1至4中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述支架部分包括氨基酸,所述识别部分包括化学切割识别部分,并且所述一或多个可检测标记包括荧光团。
9.根据权利要求1至8中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述识别部分包括所述切割位点。
10.根据权利要求1至9中任一权利要求所述的分子条形码,其进一步包括位于所述由标识体构成的集合中的每个标识体之间的标识体接头。
11.根据权利要求10所述的分子条形码,其中所述标识体接头选自以下群组:点击化学部分、天然化学连接接头和酶介导的连接接头。
12.根据权利要求1至11中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述由标识体构成的集合中的至少一个标识体的所述识别部分包括化学接头、肽或核酸。
13.根据权利要求1至12中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述由标识体构成的集合中的所述可检测标记中的至少一或多个可检测标记包括荧光团。
14.根据权利要求1至13中任一权利要求所述的分子条形码,其中所述由标识体构成的集合中的每个识别部分都包括至少一个选自以下的部分:蛋白酶识别部分、核酸内切酶识别部分、能通过亲和试剂识别的表位、核酸探针识别...
【专利技术属性】
技术研发人员:C·M·丹巴赫尔,
申请(专利权)人:俄勒冈健康与科学大学,
类型:发明
国别省市:
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