一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法技术

技术编号:41680640 阅读:16 留言:0更新日期:2024-06-14 15:33
本发明专利技术涉及一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法。首先,采用超高效液相色谱‑高分辨质谱非靶向采集待测生物样本的代谢组学数据;对得到的数据进行代谢物鉴定;采用统计分析筛选差异代谢物,再利用串联质谱信息对其中未知差异代谢物进行类别推断。在此基础上利用已知结构或类别信息的代谢物与未知差异代谢物共建分子网络,对未知差异代谢物的代谢途径进行预测。最后利用差异代谢物的途径信息进行重要差异代谢途径识别。该方法充分利用非靶向代谢组学数据中已知和未知差异代谢物的途径信息,有效提高了差异途径的解析能力。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分析化学领域,是一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法


技术介绍

1、代谢通路分析目前已经成为高通量分析代谢组学数据的一种常用的策略,通过结合已有的生物学知识或收录全面的通路信息数据库如kegg数据库等,将代谢物的动态变化信息置于生物体整体的代谢环境以及代谢通路中,从已报道或kegg庞大的代谢通路数据库中找到最值得被关注的几条差异代谢途径或通路,可基于通路分析方法评估与功能或活性相关代谢物的协调变化,以此揭示与外界胁迫,疾病等刺激相关的潜在生物过程,为后续研究项目的深入开发及生物学意义的阐述指明方向。

2、传统的代谢组学研究重要差异途径或通路及其相关代谢物的分析方法的一般步骤如下:首先,进行非靶向代谢组学分析,接着,通过差异分析对有显著性差异的代谢特征进行定性分析,最后,将获得确切定性结果的代谢物通过化合物名称或id映射到相应的代谢通路中,进行富集分析。metaboanalyst是最常用的代谢通路富集和分析工具,但其分析过程往往需要较多已得到成功定性的差异代谢物,由于现有定性能力的限制,较少的定性结果通常导致差异代谢途径本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于,所述N组具有统计学意义的生物组织样品,具体为:N为大于等于2的整数,每组样品中包含6个或6个以上样品。

3.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于S3中,采用超高效液相色谱-高分辨质谱分析待测样本,质谱扫描模式为全扫加二级质谱采集模式,采用多段扫描和多针迭代的方式获取样品中代谢物二级质谱图。

4.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新...

【技术特征摘要】

1.一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于,所述n组具有统计学意义的生物组织样品,具体为:n为大于等于2的整数,每组样品中包含6个或6个以上样品。

3.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于s3中,采用超高效液相色谱-高分辨质谱分析待测样本,质谱扫描模式为全扫加二级质谱采集模式,采用多段扫描和多针迭代的方式获取样品中代谢物二级质谱图。

4.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于s5中,对不同组别的生物样本进行统计分析,采用主成分分析方法对代谢组学数据进行维度的降低,考察不同组别样本的分布差异:

5.根据权利要求1所述一种基于非靶向代谢组学的重要差异途径识别新方法,其特征在于s6中,在将s4步骤中已获取...

【专利技术属性】
技术研发人员:许国旺张秀琼李在芳陈田田孙晓珊王鑫欣赵春霞路鑫
申请(专利权)人:中国科学院大连化学物理研究所
类型:发明
国别省市:

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