术后菌血症检测标志物确定方法、装置、电子设备及介质制造方法及图纸

本发明专利技术涉及一种术后菌血症检测标志物确定方法、装置、电子设备及介质，其方法包括：采集肠道菌群样本数据集；提取肠道菌群样本数据集的微生物基因组DNA作为测序数据，对所述测序数据进行划分获得ASV特征序列，并对ASV特征序列进行注释，生成分类学丰度数据，其中，分类学丰度数据包括第一丰度数据和第二丰度数据；基于预设的分析软件分析第一丰度数据，得到差异性菌属，并将差异性菌属作为术后菌血症的检测标志物；对第二丰度数据进行ROC曲线分析，输出验证结果。本发明专利技术中检测标志物的确定方法复杂度较低，可以在临床实现术后菌血症快速、高效的预测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及医学生物，尤其涉及一种术后菌血症检测标志物确定方法、装置、电子设备及介质。

技术介绍

1、血流感染是各种病原微生物入侵血液所引起的感染，是菌血症与败血症的统称。血流感染作为一种严重的全身感染性疾病，不仅发病率高，病死率也很高。目前，革兰氏阴性杆菌仍然是医院内获得性感染的重要致病菌之一。这些细菌是败血症、肺炎、泌尿道感染、术后感染、腹腔感染的常见原因。因此，在癌症等外科手术前做好肠道菌群检测，有利于降低术后肠道菌群移位带来的血液或者器官感染风险。

2、目前临床对于术后菌血症的诊断时间通常为术后5-8天甚至更晚，并且传统的细菌培养并不能提供有效的致病菌信息，这使得约半数患者需要接受包括二次手术在内的激进干预措施。而通过检测术后菌血症患者与健康人群肠道菌群变化，以及患者术前、术后肠道菌群的改变，明确术后菌血症和肠道菌群变化之间的相互关系。这种统计学的结果是与菌群统计方法有关。举例而言，在专利cn112851793a、cn114167062a和cn116333930a中都涉及一种体腔内感染性并发症早期诊断的标记物，以及相关的试剂盒和装置，本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述肠道菌群样本数据集包括训练数据集和验证数据集；

3.根据权利要求1所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述提取所述肠道菌群样本数据集的微生物基因组DNA作为测序数据，包括：

4.根据权利要求1所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述对所述测序数据进行划分获得ASV特征序列，包括：

5.根据权利要求2所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述差异性菌属包括肠杆菌属、肠球菌属、埃希氏菌...

【技术特征摘要】

1.一种术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述肠道菌群样本数据集包括训练数据集和验证数据集；

3.根据权利要求1所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述提取所述肠道菌群样本数据集的微生物基因组dna作为测序数据，包括：

4.根据权利要求1所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述对所述测序数据进行划分获得asv特征序列，包括：

5.根据权利要求2所述的术后菌血症检测标志物确定方法，其特征在于，所述差异性菌属包括肠杆菌属、肠球菌属、埃希氏菌属、沙门氏菌属、志贺氏菌属、金黄色葡萄球菌、丁酸弧菌属、罗氏菌属、产丁酸球菌属、长口杆菌属及艾森伯格菌属；

6.根...

【专利技术属性】
技术研发人员：叶颖江，沈鹤霄，吕永玲，周先锋，付广，滕兆伟，熊凯，
申请(专利权)人：北京大学人民医院，
类型：发明
国别省市：